More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1711 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1711  NusB/RsmB/TIM44  100 
 
 		 473 aa  945    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09910  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  44.81 
 
 		 531 aa  382  1e-104  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000618646 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07960  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  44.38 
 
 		 500 aa  378  1e-103  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.29477 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  33.96 
 
 		 452 aa  195  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0866  NusB/RsmB/TIM44  30.33 
 
 		 463 aa  192  1e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000084773  normal  0.32873 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  33.5 
 
 		 452 aa  186  8e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  31.12 
 
 		 453 aa  184  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0241  Sun protein  34.04 
 
 		 451 aa  182  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  32.06 
 
 		 464 aa  181  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  32.71 
 
 		 449 aa  181  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  35.02 
 
 		 446 aa  181  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  31.43 
 
 		 451 aa  176  6e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  31.43 
 
 		 451 aa  176  6e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0900  sun protein  33.25 
 
 		 457 aa  176  7e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  28.98 
 
 		 455 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  30.72 
 
 		 448 aa  169  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3594  sun protein  31.35 
 
 		 448 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0859  sun protein  30.02 
 
 		 452 aa  167  4e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  31.25 
 
 		 448 aa  167  5e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3851  sun protein  32.28 
 
 		 453 aa  166  8e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  29.76 
 
 		 452 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  32.56 
 
 		 448 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15690  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  34.49 
 
 		 484 aa  163  7e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.822345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1532  sun protein  27.05 
 
 		 449 aa  161  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  27.67 
 
 		 452 aa  157  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3688  sun protein  30.51 
 
 		 444 aa  156  7e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.66831  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1758  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  29.45 
 
 		 438 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3964  sun protein  30.6 
 
 		 444 aa  155  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4229  sun protein  33.1 
 
 		 432 aa  154  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.494405 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3716  sun protein  30.66 
 
 		 444 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0992207  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3606  sun protein  30.66 
 
 		 444 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4003  sun protein  30.66 
 
 		 444 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3879  sun protein  30.66 
 
 		 444 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26957e-17 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1279  sun protein  30.75 
 
 		 444 aa  154  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.19762 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3624  sun protein  30.75 
 
 		 444 aa  154  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0232202  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3913  sun protein  30.36 
 
 		 444 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0159883  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3907  sun protein  30.75 
 
 		 444 aa  152  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1064  sun protein  29.38 
 
 		 447 aa  152  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2517  sun protein  30.19 
 
 		 444 aa  152  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000512112  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1228  hypothetical protein  28.95 
 
 		 456 aa  151  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.13972  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04801  Sun protein (Fmu protein)  28.5 
 
 		 448 aa  151  2e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.273951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  29.56 
 
 		 451 aa  150  5e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  29.5 
 
 		 443 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1280  sun protein  31.56 
 
 		 431 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000185655  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  25.06 
 
 		 444 aa  147  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1171  sun protein  28.97 
 
 		 449 aa  146  8.000000000000001e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04221  Sun protein (Fmu protein)  28.5 
 
 		 432 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1406  sun protein  30.12 
 
 		 431 aa  145  1e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  28.04 
 
 		 443 aa  145  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09930  sun protein  27.63 
 
 		 440 aa  145  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  29.06 
 
 		 449 aa  145  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1994  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  25.55 
 
 		 442 aa  144  4e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1712  sun protein  25.6 
 
 		 442 aa  143  6e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.212482  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0918  sun protein  28.74 
 
 		 453 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0437  16S rRNA methyltransferase B  28.3 
 
 		 431 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  28.64 
 
 		 446 aa  142  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2084  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  27.77 
 
 		 424 aa  141  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616143  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1394  RNA-binding protein  29.31 
 
 		 442 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20681  Sun protein (Fmu protein)  30.53 
 
 		 450 aa  141  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2443  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.63 
 
 		 472 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2583  sun protein  33.49 
 
 		 501 aa  140  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0446199  normal  0.0296322 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1666  Fmu (Sun) domain protein  32.49 
 
 		 527 aa  140  4.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000139928 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3722  sun protein  34.05 
 
 		 444 aa  140  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0783  sun protein  24.73 
 
 		 435 aa  139  8.999999999999999e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1954  sun protein  29.67 
 
 		 444 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0448  NusB/RsmB/TIM44  31.09 
 
 		 439 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.455606  normal  0.168542 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04881  Sun protein (Fmu protein)  27.76 
 
 		 437 aa  139  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.929228  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0762  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  27.85 
 
 		 438 aa  138  2e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000298868 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0018  NusB/RsmB/TIM44  29.15 
 
 		 429 aa  137  4e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0209  rRNA methyltransferase RsmB (sun protein), putative  24.34 
 
 		 428 aa  136  7.000000000000001e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1672  Fmu (Sun) domain-containing protein  31.4 
 
 		 539 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.280936  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1437  sun protein  28.01 
 
 		 430 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1322  sun protein  27.86 
 
 		 451 aa  133  5e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0191  sun protein  28.53 
 
 		 436 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2566  Fmu (Sun) domain protein  31.26 
 
 		 452 aa  132  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.178272  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3584  16S rRNA methyltransferase B  29.5 
 
 		 429 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.287379  normal  0.154829 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3771  16S rRNA methyltransferase B  29.5 
 
 		 429 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.075284  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1513  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  27.7 
 
 		 448 aa  131  2.0000000000000002e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03139  16S rRNA m5C967 methyltransferase, S-adenosyl-L-methionine-dependent  29.25 
 
 		 429 aa  131  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0425  sun protein  29.25 
 
 		 429 aa  131  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0425  16S rRNA methyltransferase B  29.25 
 
 		 429 aa  131  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.53016  hitchhiker  0.000468253 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3482  16S rRNA methyltransferase B  29.25 
 
 		 429 aa  131  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066221  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3673  16S rRNA methyltransferase B  29.25 
 
 		 429 aa  131  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4611  16S rRNA methyltransferase B  29.44 
 
 		 429 aa  131  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0527839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03090  hypothetical protein  29.25 
 
 		 429 aa  131  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0029  sun protein  27.41 
 
 		 428 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000239617 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1301  sun protein  24.56 
 
 		 435 aa  130  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1276  sun protein  24.56 
 
 		 435 aa  130  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04811  Sun protein (Fmu protein)  26.33 
 
 		 438 aa  130  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1337  sun protein  24.82 
 
 		 462 aa  130  5.0000000000000004e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0524507  normal  0.361587 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2843  sun protein  26.99 
 
 		 424 aa  130  6e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04501  Sun protein (Fmu protein)  25.67 
 
 		 438 aa  130  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0025  sun protein  27.16 
 
 		 428 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0041  sun protein  28.61 
 
 		 427 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1369  Fmu (Sun) domain-containing protein  30.68 
 
 		 465 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.217845  normal  0.0543141 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2384  Fmu (Sun)  33.03 
 
 		 455 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112186  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2431  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.03 
 
 		 455 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447758  normal  0.478955 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0030  sun protein  27.16 
 
 		 428 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1277  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.58 
 
 		 440 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00916342  normal  0.333018 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0019  Sun protein  27.89 
 
 		 445 aa  127  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>