253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1709 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1709  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 193 aa  397  9.999999999999999e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17550  putative transcriptional regulator with cupin domain  73.3 
 
 		 200 aa  287  5.0000000000000004e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07930  cupin domain-containing protein  66.84 
 
 		 194 aa  268  5e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.211936  normal  0.409576 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0609  cupin sensor transcriptional regulator  39.04 
 
 		 184 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.176567  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0552  transcriptional regulator  36.56 
 
 		 183 aa  132  3.9999999999999996e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0032692  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0002  transcriptional regulator, XRE family  38.04 
 
 		 184 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.138514 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0495  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 184 aa  129  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1243  transcriptional regulator  36.02 
 
 		 184 aa  127  8.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0154  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 182 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2171  transcriptional regulator  34.39 
 
 		 184 aa  118  6e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.809699 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1398  XRE family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 184 aa  118  6e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.365461  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0316  cupin 2 domain-containing protein  35.83 
 
 		 184 aa  118  6e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0587  cupin 2 domain-containing protein  35.29 
 
 		 184 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0521  cupin 2 domain-containing protein  35.29 
 
 		 184 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0992  cupin 2 domain-containing protein  31.67 
 
 		 186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00214756  normal  0.392819 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0108  transcriptional regulator, XRE family  29.73 
 
 		 186 aa  111  6e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0817  transcriptional regulator, XRE family  32.04 
 
 		 184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17340  cupin domain-containing protein  30.43 
 
 		 186 aa  101  7e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2318  transcriptional regulator  29.61 
 
 		 188 aa  97.1  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00466136  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1468  transcriptional regulator, XRE family  30.11 
 
 		 182 aa  94.7  7e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0100935  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1702  transcriptional regulator, XRE family  28.65 
 
 		 183 aa  94  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0878  cupin 2 domain-containing protein  32.64 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000206175  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1941  transcriptional regulator  31.09 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2819  MerR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.142376 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2625  transcriptional regulator, XRE family  31.02 
 
 		 217 aa  75.1  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3438  XRE family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 198 aa  75.1  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6009  XRE family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 219 aa  74.3  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.285081  hitchhiker  0.00726065 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4694  XRE family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.607677 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0079  Cro/CI family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3456  transcriptional regulator, XRE family  31.69 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3393  transcriptional regulator, XRE family  31.69 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000124891  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1039  MerR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1587  helix-turn-helix domain-containing protein  28.95 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.494606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5748  transcriptional regulator  28.35 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0474  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.554508  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1139  transcriptional regulator  28.5 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal  0.0958639 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6574  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 		 227 aa  68.2  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0448941 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1154  XRE family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0376883  normal  0.48606 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2946  transcriptional regulator  30.73 
 
 		 197 aa  67.8  0.00000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0450  XRE family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 180 aa  67.8  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0325  XRE family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 192 aa  67.8  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3301  XRE family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1227  transcriptional regulator  27.66 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.222447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0661  MerR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5637  transcriptional regulator, XRE family  28.06 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.76756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1871  putative HTH-type transcriptional regulator  29.53 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0589891  normal  0.573197 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.16 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0650  XRE family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3298  Cro/CI family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3247  XRE family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000592797 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2247  transcriptional regulator, XRE family  27.51 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0311  cupin 2 domain-containing protein  28.57 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4802  helix-turn-helix domain protein  29.1 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.329061  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2320  transcriptional regulator, XRE family  27.66 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1889  transcriptional regulator, XRE family  27.66 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3519  transcriptional regulator, XRE family  29.73 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0116433 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1444  cupin 2 domain-containing protein  26.7 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4811  XRE family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213383 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1295  XRE family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.419553 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1702  transcriptional regulator, XRE family  28.34 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5358  putative transcriptional regulator, XRE family  27.17 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.406538  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2769  XRE family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 276 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2198  transcriptional regulator, XRE family  27.32 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.351873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6754  transcriptional regulator, XRE family  28.88 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.36173  normal  0.846385 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0428  transcriptional regulator, XRE family  26.11 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2242  helix-turn-helix domain-containing protein  27.32 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.453871 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2517  transcriptional regulator, XRE family  27.32 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1987  transcriptional regulator, XRE family  26.46 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.144245  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3313  transcriptional regulator, XRE family  27.22 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0079  DNA-binding protein  25.39 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5912  XRE family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  26.67 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1558  cupin 2 domain-containing protein  27.32 
 
 		 180 aa  57.4  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2858  transcriptional regulator, XRE family  29.19 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000622832  normal  0.0374075 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1338  XRE family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0485  transcriptional regulator, XRE family  25.41 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000244144  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5143  putative transcriptional regulator, XRE family  27.32 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0117731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4610  XRE family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.985679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3489  XRE family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1668  transcriptional regulator, XRE family  30.73 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3263  transcriptional regulator, XRE family  27.81 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09060  predicted transcriptional regulator  28.49 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.391815  normal  0.265834 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5954  transcriptional regulator, XRE family  25.4 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4562  transcriptional regulator, XRE family  27.27 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3886  XRE family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1430  XRE family transcriptional regulator  23.19 
 
 		 259 aa  55.1  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00776927 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4897  XRE family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1083  XRE family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0846857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4986  XRE family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5265  XRE family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4528  transcriptional regulator, XRE family  27.27 
 
 		 173 aa  54.3  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5514  XRE family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.388539 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2999  transcriptional regulator, XRE family  29.78 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290253  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1879  transcriptional regulator, XRE family  27.57 
 
 		 182 aa  53.9  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0437  transcriptional regulator  25.4 
 
 		 212 aa  53.9  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0168  XRE family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 227 aa  54.3  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1159  putative transcription regulator protein  27.84 
 
 		 182 aa  53.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3341  XRE family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.272722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>