More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1687 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1687  cysteine desulfurase family protein  100 
 
 
379 aa  746    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.682432 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25440  cysteine desulfurase family protein  66.67 
 
 
380 aa  503  1e-141  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0587445  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1489  cysteine desulfurase family protein  51.46 
 
 
379 aa  397  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.742565  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0618  cysteine desulfurase family protein  47.76 
 
 
381 aa  389  1e-107  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0249  Cysteine desulfurase  46.53 
 
 
392 aa  330  3e-89  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3910  Cysteine desulfurase  42.06 
 
 
376 aa  325  6e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2402  cysteine desulfurase family protein  42.11 
 
 
380 aa  324  1e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0679  aminotransferase, class V  41.41 
 
 
382 aa  310  2.9999999999999997e-83  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1912  selenocysteine lyase  43.5 
 
 
382 aa  305  6e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1692  cysteine desulfurase family protein  42.78 
 
 
385 aa  292  8e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0266  cysteine desulfurase family protein  41.53 
 
 
388 aa  291  1e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2313  cysteine desulfurase family protein  42.82 
 
 
380 aa  290  3e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1932  cysteine desulfurase family protein  43.88 
 
 
380 aa  290  4e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2316  cysteine desulfurase family protein  44.97 
 
 
383 aa  289  7e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996652  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1038  cysteine desulfurase family protein  41.53 
 
 
382 aa  289  7e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028217  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  44.41 
 
 
381 aa  288  8e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  44.59 
 
 
380 aa  288  1e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0636  cysteine desulphurase-like protein  41.93 
 
 
398 aa  287  2e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.024881  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0365  Cysteine desulfurase  39.31 
 
 
378 aa  287  2e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.60313  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1219  cysteine desulfurase family protein  41.69 
 
 
384 aa  286  4e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2291  cysteine desulfurase family protein  42.97 
 
 
380 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2214  cysteine desulphurase-like protein  41.53 
 
 
383 aa  276  3e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0350826  hitchhiker  0.000530193 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0655  cysteine desulfurase family protein  37.37 
 
 
381 aa  276  4e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.696219  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0234  selenocysteine lyase  41.22 
 
 
400 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3075  cysteine desulfurase family protein  39.74 
 
 
381 aa  273  3e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000209414 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2495  cysteine desulfurase family protein  43.17 
 
 
385 aa  273  3e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123711  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0304  selenocysteine lyase  40.63 
 
 
381 aa  265  7e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000158193  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0250  cysteine desulfurase family protein  43.72 
 
 
387 aa  264  2e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3101  cysteine desulfurase family protein  36.77 
 
 
378 aa  257  3e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2661  cysteine desulfurase family protein  35.5 
 
 
386 aa  256  6e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.146987  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2983  cysteine desulfurase family protein  35.5 
 
 
386 aa  256  7e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1876  cysteine desulfurase family protein  37.11 
 
 
381 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1729  cysteine desulfurase family protein  41.73 
 
 
385 aa  252  6e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000242055  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2696  cysteine desulfurase family protein  35.71 
 
 
380 aa  249  4e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0028  aminotransferase class V  35.53 
 
 
380 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.354528  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2460  aminotransferase, class V  35.86 
 
 
388 aa  244  9.999999999999999e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0711666  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1403  cysteine desulphurase-like protein  40.5 
 
 
383 aa  236  4e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2209  aminotransferase, class V  35.86 
 
 
390 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159851  normal  0.459608 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1204  cysteine desulfurase family protein  39.89 
 
 
381 aa  229  8e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.515711 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0881  aminotransferase, class V  38.82 
 
 
388 aa  228  1e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0070311  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0640  aminotransferase class V  37.94 
 
 
413 aa  223  4.9999999999999996e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0298  aminotransferase, class V  38.8 
 
 
383 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1751  aminotransferase, class V  35.81 
 
 
376 aa  204  3e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0255  aminotransferase, class V  33.94 
 
 
386 aa  202  8e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.409  normal  0.112068 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  37.5 
 
 
878 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  36.2 
 
 
896 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  35.86 
 
 
879 aa  197  3e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  32.55 
 
 
394 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  33.68 
 
 
394 aa  183  3e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  35.84 
 
 
412 aa  182  6e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.64 
 
 
885 aa  182  7e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  33.76 
 
 
392 aa  181  2e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1215  aminotransferase class V  34.31 
 
 
393 aa  176  5e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  33.25 
 
 
393 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.25 
 
 
406 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0048  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.49 
 
 
413 aa  171  2e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16680  cysteine desulfurase  35.04 
 
 
425 aa  168  1e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.815163  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  31.95 
 
 
404 aa  166  5e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.5 
 
 
435 aa  165  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.19 
 
 
406 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  34.46 
 
 
414 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.19 
 
 
413 aa  164  3e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  33.07 
 
 
880 aa  164  3e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.754406 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02661  cysteine sulfinate desulfinase  34.87 
 
 
401 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0878  cysteine desulfurase, catalytic subunit CsdA  34.87 
 
 
401 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.667139  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02622  hypothetical protein  34.87 
 
 
401 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0902  cysteine sulfinate desulfinase  34.87 
 
 
401 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3116  cysteine sulfinate desulfinase  34.87 
 
 
401 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000009707  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2951  cysteine sulfinate desulfinase  34.87 
 
 
401 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00101745  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2954  cysteine sulfinate desulfinase  34.79 
 
 
401 aa  163  6e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000519632  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1444  cysteine desulfurase IscS  34.19 
 
 
417 aa  162  7e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0139838 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.46 
 
 
644 aa  162  8.000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2006  cysteine desulphurases, SufS  32.64 
 
 
395 aa  162  9e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4075  cysteine sulfinate desulfinase  34.87 
 
 
401 aa  162  9e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.023337  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.72 
 
 
418 aa  161  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2915  cysteine desulfurase  35.64 
 
 
404 aa  162  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.297439  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2088  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.1 
 
 
406 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.519115 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2356  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.55 
 
 
406 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3060  cysteine sulfinate desulfinase  34.62 
 
 
401 aa  161  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000299944  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.99 
 
 
415 aa  160  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  31.51 
 
 
421 aa  160  5e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1838  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.29 
 
 
406 aa  160  5e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0112034  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.33 
 
 
429 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2248  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.94 
 
 
425 aa  159  1e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0748033  normal  0.0430442 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.33 
 
 
429 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  32.61 
 
 
408 aa  159  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.89 
 
 
413 aa  159  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0431  putative selenocysteine lyase  33.77 
 
 
406 aa  158  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.94 
 
 
410 aa  158  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  31.52 
 
 
393 aa  157  3e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.81 
 
 
414 aa  157  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  32.55 
 
 
414 aa  157  3e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1003  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.99 
 
 
406 aa  156  5.0000000000000005e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.102523  normal  0.553057 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.35 
 
 
406 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3970  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.77 
 
 
403 aa  156  5.0000000000000005e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.615432  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.12 
 
 
406 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.33 
 
 
429 aa  156  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4340  aminotransferase class V  32.99 
 
 
403 aa  156  6e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.390649  normal  0.485462 
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  32.55 
 
 
414 aa  155  7e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1242  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.99 
 
 
414 aa  155  8e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>