More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1645 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1645  MiaB-like tRNA modifying enzyme  100 
 
 		 410 aa  810    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.447021  hitchhiker  0.00298865 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10340  MiaB-like tRNA modifying enzyme  57.25 
 
 		 409 aa  427  1e-118  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0729922  unclonable  0.00000000167703 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07660  MiaB-like tRNA modifying enzyme  52.67 
 
 		 409 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.738464 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1992  MiaB-like tRNA modifying enzyme  41.83 
 
 		 471 aa  262  6e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.130467  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0795  RNA modification enzyme, MiaB family  40.59 
 
 		 423 aa  253  4.0000000000000004e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.134555  normal  0.773593 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1634  RNA modification protein  39.95 
 
 		 448 aa  250  3e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.654078  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1668  RNA modification protein  39.95 
 
 		 448 aa  250  3e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2433  RNA modification enzyme, MiaB family  36.38 
 
 		 451 aa  250  4e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000747616  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1857  putative MiaB-like tRNA modifying enzyme  41.18 
 
 		 432 aa  249  7e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3036  RNA modification protein  38.64 
 
 		 450 aa  249  8e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0366508  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4391  hypothetical protein  38.13 
 
 		 450 aa  247  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.115711  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4443  RNA modification enzyme, MiaB family  38.13 
 
 		 450 aa  247  2e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000190996  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4161  RNA modification protein  38.13 
 
 		 450 aa  247  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.556145  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1017  RNA modification enzyme, MiaB family  36.95 
 
 		 449 aa  248  2e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4209  hypothetical protein  38.13 
 
 		 450 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4047  hypothetical protein  38.13 
 
 		 450 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4057  hypothetical protein  38.13 
 
 		 450 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4535  hypothetical protein  38.13 
 
 		 450 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4332  RNA modification enzyme, MiaB family  38.13 
 
 		 450 aa  246  6e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16472e-48 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0807  RNA modification enzyme, MiaB family  38.99 
 
 		 450 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137858  decreased coverage  2.64257e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4429  hypothetical protein  38.99 
 
 		 450 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111241  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2053  MiaB-like tRNA modifying enzyme  40 
 
 		 450 aa  243  3e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0674  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.09 
 
 		 429 aa  241  1e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1144  hypothetical protein  36.25 
 
 		 448 aa  241  2e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3217  RNA modification enzyme, MiaB family  37.38 
 
 		 435 aa  239  5e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000221997  hitchhiker  0.000000785503 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2492  RNA modification protein  38.04 
 
 		 436 aa  239  5e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00131013  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0969  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.57 
 
 		 421 aa  235  9e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1187  RNA modification enzyme, MiaB family  35.34 
 
 		 446 aa  234  3e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0386779 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1182  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.41 
 
 		 441 aa  233  5e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0484271  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2570  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.45 
 
 		 429 aa  231  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.005255 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12760  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.02 
 
 		 438 aa  231  2e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00265105  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0611  RNA modification enzyme, MiaB family  40.56 
 
 		 437 aa  230  4e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.920211  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1643  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.21 
 
 		 429 aa  229  5e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.119605  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0503  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.22 
 
 		 408 aa  229  9e-59  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0522  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.47 
 
 		 420 aa  228  1e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2352  MiaB-like tRNA modifying enzyme  40.94 
 
 		 443 aa  226  5.0000000000000005e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4295  RNA modification enzyme, MiaB family  37.7 
 
 		 439 aa  226  8e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00281289  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1574  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.71 
 
 		 456 aa  224  3e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000454579  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1490  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.52 
 
 		 444 aa  223  4e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1807  RNA modification enzyme, MiaB family  34.13 
 
 		 451 aa  223  4e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000210311  decreased coverage  0.000315868 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1711  hypothetical protein  39.19 
 
 		 436 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0319  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.97 
 
 		 419 aa  223  4.9999999999999996e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.29 
 
 		 434 aa  223  6e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.81672  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0926  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.06 
 
 		 427 aa  223  7e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.084888  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2241  RNA modification enzyme, MiaB family  32.95 
 
 		 454 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00150078  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2497  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.01 
 
 		 411 aa  219  6e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0715823  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3405  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.19 
 
 		 435 aa  218  1e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1211  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.36 
 
 		 495 aa  218  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.496163 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.99 
 
 		 434 aa  219  1e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.698002  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1282  RNA modification enzyme, MiaB family  32.49 
 
 		 434 aa  218  2e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2316  MiaB-like tRNA modifying enzyme  40.76 
 
 		 427 aa  217  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000240078  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0360  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.24 
 
 		 422 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.106341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2810  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.96 
 
 		 421 aa  216  7e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.756102  normal  0.266811 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3229  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.14 
 
 		 416 aa  216  8e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0152656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2852  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.6 
 
 		 444 aa  215  9e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09066  putative Fe-S oxidoreductase  32.95 
 
 		 458 aa  215  9.999999999999999e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.276137  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4866  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.8 
 
 		 449 aa  215  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0018  MiaB family tRNA modification protein  33.1 
 
 		 427 aa  215  9.999999999999999e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1770  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.06 
 
 		 435 aa  214  1.9999999999999998e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000207484  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0184  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.03 
 
 		 412 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.734186  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11680  RNA modification enzyme, MiaB family  33.5 
 
 		 450 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0952269  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2568  MiaB-like tRNA modifying enzyme  40.26 
 
 		 434 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5039  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.93 
 
 		 444 aa  213  3.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1164  RNA modification enzyme, MiaB family  33.51 
 
 		 431 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0874  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.22 
 
 		 431 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249518 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1860  hypothetical protein  35.6 
 
 		 427 aa  212  7.999999999999999e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.17951  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1933  hypothetical protein  35.6 
 
 		 427 aa  212  7.999999999999999e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2594  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.63 
 
 		 425 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.858187 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2224  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.05 
 
 		 442 aa  212  9e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.490633  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0935  MiaB-like radical SAM protein  35.63 
 
 		 425 aa  212  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2207  RNA modification enzyme, MiaB family  38.38 
 
 		 440 aa  211  1e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4070  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.09 
 
 		 424 aa  212  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3747  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.71 
 
 		 424 aa  212  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0150  RNA modification protein  32.44 
 
 		 434 aa  211  1e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.839753  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0174  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.85 
 
 		 430 aa  211  2e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1331  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.16 
 
 		 417 aa  211  2e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000562047  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0396  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.44 
 
 		 420 aa  210  4e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.342498  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1050  MiaB-like tRNA modifying enzyme  30.52 
 
 		 438 aa  210  5e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1886  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.61 
 
 		 468 aa  209  6e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000824769  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2843  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.59 
 
 		 410 aa  209  6e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.495489  normal  0.451673 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0853  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.22 
 
 		 416 aa  209  1e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.230835  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1610  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  33.33 
 
 		 471 aa  208  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.34792  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0166  RNA modification protein  34.1 
 
 		 440 aa  208  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.684419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0976  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.03 
 
 		 467 aa  208  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal  0.0700259 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0298  RNA modification enzyme, MiaB family  36.9 
 
 		 431 aa  207  2e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2980  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.78 
 
 		 425 aa  208  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.065406 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1414  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.18 
 
 		 420 aa  206  5e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6072  MiaB-like tRNA modifying enzyme  41.71 
 
 		 449 aa  206  7e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0928741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3092  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.58 
 
 		 424 aa  206  8e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.852601 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0214  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.27 
 
 		 420 aa  206  8e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0176423 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6578  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.02 
 
 		 425 aa  205  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.745679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2299  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.74 
 
 		 466 aa  205  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.198843  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2948  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.86 
 
 		 410 aa  205  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.736746  hitchhiker  0.001764 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1495  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  32.19 
 
 		 451 aa  204  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.421573  hitchhiker  0.000974888 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0422  RNA modification protein  34.08 
 
 		 446 aa  204  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0536856  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0252  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.4 
 
 		 423 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1699  RNA modification enzyme, MiaB family  33.76 
 
 		 478 aa  204  3e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000319842  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1294  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.96 
 
 		 409 aa  204  3e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0588  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.4 
 
 		 450 aa  203  5e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0962192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2937  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.52 
 
 		 439 aa  202  9.999999999999999e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.673839  normal  0.173134 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>