More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1585 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1585  Phenylacetate--CoA ligase  100 
 
 
457 aa  937    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0730683 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  55.9 
 
 
430 aa  495  1e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  55.53 
 
 
438 aa  496  1e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  52.2 
 
 
432 aa  486  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  52.71 
 
 
433 aa  478  1e-134  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  52.24 
 
 
433 aa  474  1e-132  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  50.47 
 
 
432 aa  472  1e-132  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  51.76 
 
 
433 aa  473  1e-132  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  50.94 
 
 
431 aa  465  9.999999999999999e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  49.65 
 
 
433 aa  462  1e-129  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  51.06 
 
 
433 aa  464  1e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  51.03 
 
 
436 aa  456  1e-127  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  48.73 
 
 
433 aa  450  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  49.88 
 
 
433 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  49.65 
 
 
433 aa  444  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1756  phenylacetate--CoA ligase  51.74 
 
 
432 aa  444  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  49.42 
 
 
433 aa  442  1e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  48.96 
 
 
433 aa  444  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  48.72 
 
 
433 aa  444  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  46.65 
 
 
435 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  48.02 
 
 
435 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  48.13 
 
 
433 aa  440  9.999999999999999e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  48.49 
 
 
433 aa  440  9.999999999999999e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  48.96 
 
 
435 aa  438  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  46.96 
 
 
433 aa  435  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  48.59 
 
 
433 aa  437  1e-121  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  49.77 
 
 
441 aa  436  1e-121  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  48.49 
 
 
434 aa  438  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  48.24 
 
 
434 aa  436  1e-121  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  46.53 
 
 
435 aa  432  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  48.26 
 
 
432 aa  434  1e-120  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  49.77 
 
 
432 aa  433  1e-120  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  47.55 
 
 
433 aa  434  1e-120  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  48.03 
 
 
432 aa  432  1e-120  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  48.26 
 
 
432 aa  432  1e-120  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  47.88 
 
 
435 aa  430  1e-119  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1818  phenylacetate-CoA ligase  49.42 
 
 
433 aa  429  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1218  phenylacetate-CoA ligase  46.15 
 
 
436 aa  428  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  47.1 
 
 
433 aa  431  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  48.24 
 
 
434 aa  431  1e-119  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  47.79 
 
 
446 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  47.1 
 
 
433 aa  431  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  47.33 
 
 
433 aa  426  1e-118  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  48.27 
 
 
432 aa  426  1e-118  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  46.28 
 
 
434 aa  426  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  47.06 
 
 
435 aa  423  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  47.79 
 
 
432 aa  423  1e-117  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  47.8 
 
 
444 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  47.59 
 
 
444 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  45.69 
 
 
434 aa  423  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  45.22 
 
 
434 aa  422  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3091  phenylacetate--CoA ligase  47.22 
 
 
437 aa  424  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000125462  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  46.59 
 
 
434 aa  424  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0070  phenylacetate--CoA ligase  49.77 
 
 
445 aa  424  1e-117  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  46.59 
 
 
434 aa  420  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  46.4 
 
 
432 aa  419  1e-116  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  47.11 
 
 
444 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0815  phenylacetate--CoA ligase  47.29 
 
 
439 aa  416  9.999999999999999e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180698  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  46.05 
 
 
439 aa  412  1e-114  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  44.78 
 
 
433 aa  412  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3626  phenylacetate-CoA ligase  44.93 
 
 
432 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0611072  normal  0.539384 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  48.6 
 
 
437 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  46.28 
 
 
443 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0469  phenylacetate-CoA ligase  44.93 
 
 
432 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.119457  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4320  phenylacetate--CoA ligase  47.97 
 
 
444 aa  404  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2855  phenylacetate-CoA ligase  44.47 
 
 
432 aa  404  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.343301  normal  0.707193 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  46.98 
 
 
434 aa  404  1e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  44.19 
 
 
439 aa  404  1e-111  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0052  Phenylacetate--CoA ligase  48.47 
 
 
441 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0041  phenylacetate--CoA ligase  48.69 
 
 
446 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0036  phenylacetate-CoA ligase  48.47 
 
 
441 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  45.92 
 
 
433 aa  403  1e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0901  phenylacetate-CoA ligase  47.06 
 
 
445 aa  402  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  44.19 
 
 
439 aa  404  1e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0040  Phenylacetate--CoA ligase  48.47 
 
 
441 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.373743  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0444  phenylacetate-CoA ligase  44.93 
 
 
432 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  45.35 
 
 
432 aa  402  1e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3490  phenylacetate-CoA ligase  44.37 
 
 
434 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352435  hitchhiker  0.000125806 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3096  phenylacetate-CoA ligase  46.59 
 
 
439 aa  399  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0154139  hitchhiker  0.00102169 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3083  phenylacetate--CoA ligase  45.73 
 
 
423 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0039  phenylacetate--CoA ligase  47.8 
 
 
441 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.728722  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0656  phenylacetate-CoA ligase  44.47 
 
 
434 aa  400  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0466  phenylacetate-CoA ligase  44.83 
 
 
434 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0511  phenylacetate-CoA ligase  44.01 
 
 
432 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.948349  normal  0.684224 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2566  phenylacetate-CoA ligase  44.01 
 
 
432 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06240  phenylacetate-CoA ligase  47.39 
 
 
436 aa  400  9.999999999999999e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.57467  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0539  phenylacetate-CoA ligase  44.01 
 
 
432 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.743587  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1578  Phenylacetate--CoA ligase  44.55 
 
 
436 aa  401  9.999999999999999e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.198004 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3741  phenylacetate-CoA ligase  45.06 
 
 
448 aa  396  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.1455  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3367  phenylacetate-CoA ligase  45.2 
 
 
443 aa  397  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322757  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2752  phenylacetate-CoA ligase  44.6 
 
 
434 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0185722  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3117  phenylacetate-CoA ligase  45.69 
 
 
434 aa  393  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0603128  normal  0.0548798 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0038  phenylacetate-CoA ligase  47.2 
 
 
441 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.455543  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0227  phenylacetate-CoA ligase  44.37 
 
 
433 aa  392  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0683  phenylacetate-CoA ligase  45.28 
 
 
444 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2693  phenylacetate-CoA ligase  45.33 
 
 
434 aa  393  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666778  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3366  phenylacetate-CoA ligase  45.54 
 
 
431 aa  389  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2904  phenylacetate-CoA ligase  43.68 
 
 
432 aa  389  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0773804  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0054  Phenylacetate--CoA ligase  47.2 
 
 
441 aa  391  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  46.98 
 
 
434 aa  391  1e-107  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>