More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1578 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1578  Phenylacetate--CoA ligase  100 
 
 		 436 aa  901    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.198004 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  68.59 
 
 		 435 aa  649    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06240  phenylacetate-CoA ligase  60.6 
 
 		 436 aa  551  1e-155  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.57467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  54.65 
 
 		 433 aa  503  1e-141  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  54.99 
 
 		 434 aa  496  1e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  53.94 
 
 		 432 aa  498  1e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  54.4 
 
 		 434 aa  497  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  55.5 
 
 		 432 aa  491  9.999999999999999e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  51.85 
 
 		 433 aa  489  1e-137  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  52.31 
 
 		 441 aa  484  1e-136  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1218  phenylacetate-CoA ligase  53.13 
 
 		 436 aa  486  1e-136  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  52.53 
 
 		 433 aa  483  1e-135  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  51.74 
 
 		 433 aa  483  1e-135  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  53.12 
 
 		 433 aa  478  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  52.55 
 
 		 432 aa  478  1e-134  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  52.31 
 
 		 435 aa  476  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  52.89 
 
 		 433 aa  478  1e-133  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  51.72 
 
 		 435 aa  476  1e-133  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  52.78 
 
 		 432 aa  476  1e-133  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  52.44 
 
 		 433 aa  475  1e-133  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0815  phenylacetate--CoA ligase  51.51 
 
 		 439 aa  475  1e-133  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180698  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  52.19 
 
 		 433 aa  476  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  52.31 
 
 		 432 aa  474  1e-132  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  52.42 
 
 		 434 aa  473  1e-132  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  52.44 
 
 		 435 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  52.31 
 
 		 433 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  50.93 
 
 		 432 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  52.08 
 
 		 435 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  50.46 
 
 		 433 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  53 
 
 		 433 aa  469  1.0000000000000001e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  52.31 
 
 		 434 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  51.85 
 
 		 432 aa  465  9.999999999999999e-131  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  50.69 
 
 		 433 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  52.08 
 
 		 434 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  50.81 
 
 		 434 aa  462  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  49.65 
 
 		 434 aa  462  1e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  52.44 
 
 		 444 aa  461  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  51.39 
 
 		 435 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  52.8 
 
 		 444 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3083  phenylacetate--CoA ligase  52.96 
 
 		 423 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  52.45 
 
 		 446 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  52.46 
 
 		 444 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3741  phenylacetate-CoA ligase  51.99 
 
 		 448 aa  457  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.1455  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  51.96 
 
 		 437 aa  457  1e-127  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2855  phenylacetate-CoA ligase  53.04 
 
 		 432 aa  456  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.343301  normal  0.707193 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0466  phenylacetate-CoA ligase  51.52 
 
 		 434 aa  456  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  49.65 
 
 		 432 aa  457  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  51.73 
 
 		 434 aa  457  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  50.47 
 
 		 433 aa  456  1e-127  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  49.53 
 
 		 433 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0511  phenylacetate-CoA ligase  52.57 
 
 		 432 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.948349  normal  0.684224 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2693  phenylacetate-CoA ligase  52.11 
 
 		 434 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3626  phenylacetate-CoA ligase  52.1 
 
 		 432 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0611072  normal  0.539384 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  51.41 
 
 		 438 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3490  phenylacetate-CoA ligase  51.29 
 
 		 434 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352435  hitchhiker  0.000125806 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  49.53 
 
 		 433 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2566  phenylacetate-CoA ligase  52.22 
 
 		 432 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0444  phenylacetate-CoA ligase  52.1 
 
 		 432 aa  450  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0539  phenylacetate-CoA ligase  52.22 
 
 		 432 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.743587  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  48.48 
 
 		 433 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0469  phenylacetate-CoA ligase  51.64 
 
 		 432 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.119457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  48.96 
 
 		 432 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3096  phenylacetate-CoA ligase  49.89 
 
 		 439 aa  445  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0154139  hitchhiker  0.00102169 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3017  phenylacetate-CoA ligase  52.11 
 
 		 434 aa  444  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0683  phenylacetate-CoA ligase  50.12 
 
 		 444 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  48.96 
 
 		 433 aa  444  1e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4320  phenylacetate--CoA ligase  51.77 
 
 		 444 aa  443  1e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2967  phenylacetate-CoA ligase  51.28 
 
 		 439 aa  440  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  49.3 
 
 		 433 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2403  phenylacetate-CoA ligase  51.05 
 
 		 436 aa  440  9.999999999999999e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.670369 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2904  phenylacetate-CoA ligase  51.64 
 
 		 432 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0773804  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0227  phenylacetate-CoA ligase  50.23 
 
 		 433 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3279  phenylacetate-CoA ligase  49.09 
 
 		 439 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3366  phenylacetate-CoA ligase  51.52 
 
 		 431 aa  435  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0809  phenylacetate-CoA ligase  49.07 
 
 		 439 aa  436  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.693616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  46.87 
 
 		 434 aa  437  1e-121  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3165  phenylacetate-CoA ligase  50.47 
 
 		 434 aa  436  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0404023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2752  phenylacetate-CoA ligase  50.47 
 
 		 434 aa  435  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0185722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2617  phenylacetate-CoA ligase  49.77 
 
 		 439 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.179563  normal  0.174416 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2630  phenylacetate-CoA ligase  49.77 
 
 		 439 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460145  normal  0.0722332 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  50.12 
 
 		 434 aa  436  1e-121  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  47.76 
 
 		 433 aa  433  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  48.82 
 
 		 436 aa  433  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0570  phenylacetate-CoA ligase  48.71 
 
 		 434 aa  434  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.419756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  47.41 
 
 		 434 aa  434  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  48.03 
 
 		 429 aa  432  1e-120  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5526  phenylacetate-CoA ligase  50.71 
 
 		 449 aa  432  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0759485  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2480  phenylacetate-CoA ligase  49.21 
 
 		 439 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1509  phenylacetate-CoA ligase  50.47 
 
 		 441 aa  432  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.047551  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  47.56 
 
 		 439 aa  433  1e-120  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  47.91 
 
 		 433 aa  431  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  47.32 
 
 		 435 aa  433  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1756  phenylacetate--CoA ligase  47.33 
 
 		 432 aa  430  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1584  phenylacetate-CoA ligase  50.7 
 
 		 437 aa  430  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  48.47 
 
 		 431 aa  430  1e-119  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3117  phenylacetate-CoA ligase  50.23 
 
 		 434 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0603128  normal  0.0548798 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0656  phenylacetate-CoA ligase  48.83 
 
 		 434 aa  429  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1485  phenylacetate-CoA ligase  50.7 
 
 		 437 aa  431  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3944  phenylacetate-CoA ligase  49.19 
 
 		 439 aa  428  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.8736  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4801  phenylacetate-CoA ligase  50 
 
 		 436 aa  429  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12484  normal  0.238866 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>