More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1517 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1517  N-6 DNA methylase  100 
 
 		 691 aa  1430    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.140297 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4454  N-6 DNA methylase  44.49 
 
 		 675 aa  545  1e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2868  type I restriction-modification system DNA methylase  44.35 
 
 		 675 aa  535  1e-150  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0465984  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4760  type I restriction-modification system DNA methylase  41.89 
 
 		 659 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.362482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1016  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  37.52 
 
 		 680 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1155  N-6 DNA methylase  37.94 
 
 		 659 aa  449  1.0000000000000001e-124  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0234  N-6 DNA methylase  36.31 
 
 		 661 aa  447  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0075  N-6 DNA methylase  36.63 
 
 		 658 aa  443  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0413  N-6 DNA methylase  36.6 
 
 		 661 aa  443  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.190573  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2687  N-6 DNA methylase  36.01 
 
 		 661 aa  436  1e-121  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.965628  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0604  type I restriction-modification system, M subunit; N-6 adenine-specific DNA methylase  37.7 
 
 		 655 aa  424  1e-117  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0795  N-6 DNA methylase  36.03 
 
 		 673 aa  423  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364287 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3935  N-6 DNA methylase  36.89 
 
 		 676 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3984  N-6 DNA methylase  36.56 
 
 		 676 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604067  normal  0.0238771 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  37.74 
 
 		 663 aa  410  1e-113  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0684916  normal  0.490543 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1792  N-6 DNA methylase  35.59 
 
 		 725 aa  406  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0174866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0960  N-6 DNA methylase  36.2 
 
 		 670 aa  403  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2608  N-6 DNA methylase  35.04 
 
 		 683 aa  404  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.648611  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1550  N-6 DNA methylase  36.98 
 
 		 673 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.677514 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2604  N-6 DNA methylase  35.02 
 
 		 728 aa  394  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.205723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0751  N-6 DNA methylase  35.42 
 
 		 686 aa  386  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.309292 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2680  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  34.53 
 
 		 676 aa  382  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.558636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4253  N-6 DNA methylase  33.69 
 
 		 708 aa  381  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.196682  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0488  N-6 DNA methylase  33.63 
 
 		 580 aa  361  3e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.19026 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1495  N-6 DNA methylase  36.19 
 
 		 661 aa  360  7e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.304059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1060  type I restriction-modification  39.76 
 
 		 675 aa  345  2e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000030221  normal  0.0378969 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1328  N-6 DNA methylase  35.4 
 
 		 806 aa  342  1e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.909053  normal  0.133174 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1480  N-6 DNA methylase  35.66 
 
 		 777 aa  340  8e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3359  N-6 DNA methylase  31.47 
 
 		 709 aa  332  1e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.270263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22800  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  33.05 
 
 		 644 aa  327  3e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.386245 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1857  N-6 DNA methylase  37.31 
 
 		 611 aa  325  2e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.618647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0192  N-6 DNA methylase  38.73 
 
 		 583 aa  322  9.999999999999999e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341004 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0657  N-6 DNA methylase  31.7 
 
 		 725 aa  317  4e-85  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0276  N-6 DNA methylase  36.07 
 
 		 569 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4916  N-6 DNA methylase  37.4 
 
 		 607 aa  313  9e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253414  normal  0.660274 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19060  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  39.84 
 
 		 586 aa  312  2e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0947092 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3442  N-6 DNA methylase  36.51 
 
 		 592 aa  298  3e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  0.982345 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3570  N-6 DNA methylase  33.33 
 
 		 647 aa  297  4e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4473  N-6 DNA methylase  32.32 
 
 		 677 aa  295  1e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1025 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1861  type I restriction-modification system specificity subunit  32.88 
 
 		 710 aa  294  4e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0263  N-6 DNA methylase  35.41 
 
 		 589 aa  287  4e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2177  N-6 DNA methylase  35.7 
 
 		 793 aa  283  6.000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1367  putative DNA methylase HsdM  34.7 
 
 		 793 aa  276  8e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0641  N-6 DNA methylase  35.06 
 
 		 587 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0841  hypothetical protein  35.35 
 
 		 608 aa  273  8.000000000000001e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0027333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2269  type I restriction-modification system DNA methylase  35.89 
 
 		 763 aa  273  9e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2201  N-6 DNA methylase  34.07 
 
 		 778 aa  270  8e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003234  type I restriction-modification system DNA-methyltransferase subunit M  34.21 
 
 		 794 aa  268  2e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0278  type I restriction-modification system, M subunit  35.54 
 
 		 790 aa  266  8.999999999999999e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2941  restriction/modification methyltransferase  30.89 
 
 		 783 aa  263  8e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1782  N-6 DNA methylase  33.83 
 
 		 829 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.368234 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6258  N-6 DNA methylase  32.01 
 
 		 787 aa  255  2.0000000000000002e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0776  type I restriction-modification system, M subunit  27 
 
 		 636 aa  243  7e-63  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0115537  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2227  N-6 DNA methylase  38.79 
 
 		 371 aa  234  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1222  N-6 DNA methylase  35.41 
 
 		 552 aa  233  9e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0768  N-6 DNA methylase  31.79 
 
 		 799 aa  233  1e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.161666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1365  N-6 DNA methylase  29.43 
 
 		 697 aa  179  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.518057  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2256  N-6 DNA methylase  34.44 
 
 		 316 aa  157  9e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0633793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  26.58 
 
 		 498 aa  120  9e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  26.88 
 
 		 496 aa  118  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  25.11 
 
 		 574 aa  118  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0036  type I restriction enzyme  23.8 
 
 		 510 aa  117  8.999999999999998e-25  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.27058  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3758  N-6 DNA methylase  25.17 
 
 		 511 aa  114  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.921564  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  25.61 
 
 		 508 aa  114  8.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  25.61 
 
 		 523 aa  114  8.000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  25.4 
 
 		 633 aa  113  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  24.52 
 
 		 587 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  28 
 
 		 505 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  25.57 
 
 		 574 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  27.64 
 
 		 574 aa  109  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0964  N-6 DNA methylase  27.33 
 
 		 520 aa  108  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.311438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0826  type I restriction-modification system, M subunit  27.33 
 
 		 520 aa  108  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.580356  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1412  type I restriction-modification system, M subunit  25.11 
 
 		 517 aa  108  5e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.446719  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4623  type I restriction-modification system, M subunit  27.48 
 
 		 810 aa  108  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.218097 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2248  N-6 DNA methylase  24.53 
 
 		 521 aa  107  9e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0522014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0869  N-6 DNA methylase  24.49 
 
 		 510 aa  107  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3178  N-6 DNA methylase  27.31 
 
 		 498 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0125713  hitchhiker  0.0000000000157011 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2453  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  23.08 
 
 		 538 aa  104  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.53896  normal  0.845275 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1159  N-6 DNA methylase  25.2 
 
 		 516 aa  105  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000301602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1672  N-6 DNA methylase  25.31 
 
 		 516 aa  105  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.179457  hitchhiker  0.001187 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0405  type I restriction-modification system, M subunit  27.08 
 
 		 799 aa  102  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  24.38 
 
 		 504 aa  103  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0697  N-6 DNA methylase  22.8 
 
 		 530 aa  103  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1594  N-6 DNA methylase  22.8 
 
 		 530 aa  103  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.153041  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  27.81 
 
 		 585 aa  102  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0005  type I restriction-modification system, M subunit, putative  24.74 
 
 		 568 aa  101  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2743  type I restriction system adenine methylase  23.84 
 
 		 518 aa  101  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3610  N-6 DNA methylase  25.67 
 
 		 500 aa  101  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578876  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1644  N-6 DNA methylase  22.97 
 
 		 498 aa  101  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0306  N-6 DNA methylase  25.85 
 
 		 547 aa  101  5e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0895835 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1102  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  23.92 
 
 		 548 aa  101  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.358797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3006  N-6 DNA methylase  23.98 
 
 		 520 aa  100  7e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.809429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0286  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  26.25 
 
 		 497 aa  100  8e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2193  type I restriction-modification system, M subunit  25.7 
 
 		 847 aa  100  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0865  type I restriction-modification system, M subunit  26.74 
 
 		 814 aa  100  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173727  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0034  N-6 DNA methylase  25.77 
 
 		 544 aa  100  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966218 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0952  type I restriction-modification system, M subunit  27 
 
 		 809 aa  99.8  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000609916 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2017  N-6 DNA methylase  24.26 
 
 		 517 aa  99.4  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.54323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0988  N-6 DNA methylase  25 
 
 		 527 aa  99.8  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4819  N-6 DNA methylase  27.27 
 
 		 499 aa  99.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>