40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1409 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1409  hypothetical protein  100 
 
 
88 aa  184  4e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.209175  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1341  hypothetical protein  53.93 
 
 
89 aa  96.7  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2136  hypothetical protein  48.31 
 
 
89 aa  87  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.470707  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3957  hypothetical protein  46.07 
 
 
89 aa  85.5  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000131135  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2375  hypothetical protein  46.07 
 
 
88 aa  84  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1330  hypothetical protein  41.57 
 
 
89 aa  82.4  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.520904  normal  0.12078 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0567  hypothetical protein  46.07 
 
 
101 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.360241  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0193  hypothetical protein  44.94 
 
 
89 aa  81.3  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.632607  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2567  hypothetical protein  44.94 
 
 
89 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2467  hypothetical protein  42.53 
 
 
88 aa  79.7  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1017  hypothetical protein  43.82 
 
 
88 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2499  hypothetical protein  44.94 
 
 
89 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000616524  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0270  hypothetical protein  42.7 
 
 
88 aa  75.5  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6036  hypothetical protein  39.29 
 
 
84 aa  70.1  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0264  hypothetical protein  41.76 
 
 
90 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1649  hypothetical protein  42.05 
 
 
86 aa  68.9  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4195  hypothetical protein  39.77 
 
 
86 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1284  hypothetical protein  39.47 
 
 
76 aa  62.8  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1402  hypothetical protein  39.47 
 
 
76 aa  62.8  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1386  hypothetical protein  54.55 
 
 
64 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2659  hypothetical protein  40.96 
 
 
85 aa  61.2  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0463973  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1901  hypothetical protein  38.2 
 
 
94 aa  60.8  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1478  hypothetical protein  34.83 
 
 
86 aa  60.5  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2522  hypothetical protein  37.5 
 
 
86 aa  59.7  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0924  hypothetical protein  37.08 
 
 
86 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2428  hypothetical protein  35.23 
 
 
86 aa  58.9  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0239  hypothetical protein  35.23 
 
 
86 aa  57  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0902  hypothetical protein  35.23 
 
 
85 aa  56.6  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.959695  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1992  hypothetical protein  36.36 
 
 
86 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0295579  normal  0.0414259 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1212  hypothetical protein  34.09 
 
 
86 aa  54.7  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00620  predicted transcriptional regulator  31.34 
 
 
72 aa  48.9  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1067  hypothetical protein  34.09 
 
 
89 aa  48.5  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02920  hypothetical protein  30.67 
 
 
107 aa  46.2  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00324963  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1180  hypothetical protein  32.43 
 
 
103 aa  44.3  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.211605  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1385  hypothetical protein  51.28 
 
 
53 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1141  hypothetical protein  32.95 
 
 
82 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.930521  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0618  hypothetical protein  34.67 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0905  hypothetical protein  29.73 
 
 
75 aa  42  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.844945  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1092  hypothetical protein  33.85 
 
 
74 aa  40.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.482851  normal  0.103646 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1098  hypothetical protein  31.08 
 
 
86 aa  40  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>