More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1405 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1405  Ribonuclease H  100 
 
 		 262 aa  519  1e-146  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000142088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10380  ribonuclease HII  61.78 
 
 		 258 aa  298  5e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000218298  unclonable  0.00000000118399 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07010  ribonuclease HII  58.69 
 
 		 262 aa  290  1e-77  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000706526  normal  0.43338 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0699  Ribonuclease H  47.67 
 
 		 257 aa  203  2e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000499736  hitchhiker  0.00000400312 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  39.2 
 
 		 268 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  36.8 
 
 		 277 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  41.9 
 
 		 255 aa  158  7e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0664  ribonuclease HII  42.52 
 
 		 267 aa  158  9e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0628332  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  41.18 
 
 		 242 aa  157  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0812  ribonuclease HII  33.73 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000539552  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  39.81 
 
 		 256 aa  155  7e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  38.77 
 
 		 250 aa  153  2.9999999999999998e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0920  ribonuclease HII  39.29 
 
 		 255 aa  152  4e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0777  ribonuclease HII  35.74 
 
 		 256 aa  151  1e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119605  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  35.92 
 
 		 257 aa  151  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  34.9 
 
 		 253 aa  151  1e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1012  ribonuclease HII  35.71 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0454013  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  37.4 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1415  ribonuclease HII  37.65 
 
 		 258 aa  149  3e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000335536  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1678  ribonuclease HII  34.82 
 
 		 272 aa  148  7e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.652859  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1960  ribonuclease HII  34.82 
 
 		 272 aa  148  9e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.317166  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1328  ribonuclease HII  35.04 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.506161  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1303  ribonuclease HII  35.04 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00555633  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  36.68 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1993  ribonuclease HII  43.78 
 
 		 206 aa  146  3e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1554  ribonuclease H  44.24 
 
 		 307 aa  146  3e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0977063 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0038  ribonuclease HII  40 
 
 		 205 aa  145  5e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0289  ribonuclease HII  40.4 
 
 		 283 aa  145  6e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.267831  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  46.49 
 
 		 201 aa  144  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0278  ribonuclease HII  39.6 
 
 		 283 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0302  ribonuclease HII  37.2 
 
 		 338 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0995743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0300  ribonuclease HII  39.6 
 
 		 283 aa  142  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  43.28 
 
 		 210 aa  142  5e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  45.56 
 
 		 203 aa  142  5e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0018  ribonuclease HII  41.85 
 
 		 207 aa  142  5e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000987865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  42.47 
 
 		 198 aa  141  9e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  41.4 
 
 		 206 aa  141  9.999999999999999e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000692909  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0404  ribonuclease HII  42.86 
 
 		 203 aa  139  4.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.505687 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  41.11 
 
 		 202 aa  139  6e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  41.11 
 
 		 202 aa  139  6e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  38.78 
 
 		 206 aa  138  7.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1375  ribonuclease HII  42.31 
 
 		 198 aa  138  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000308633  normal  0.450716 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  44.75 
 
 		 201 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0976  ribonuclease H  43.75 
 
 		 206 aa  138  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1308  ribonuclease HII  37.4 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000033795  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0017  ribonuclease HII  38.43 
 
 		 299 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.851734  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0189  Ribonuclease H  39.01 
 
 		 197 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.682381  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1867  ribonuclease HII  39.67 
 
 		 218 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0144978  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  41.36 
 
 		 235 aa  136  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4366  ribonuclease HII  38.73 
 
 		 230 aa  136  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  43.65 
 
 		 201 aa  136  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3850  ribonuclease HII  36.18 
 
 		 257 aa  136  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  42.11 
 
 		 230 aa  136  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0011  ribonuclease HII  42.7 
 
 		 208 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000000150276  normal  0.177364 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3879  ribonuclease HII  36.18 
 
 		 257 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000611644  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1282  ribonuclease HII  36.56 
 
 		 225 aa  135  7.000000000000001e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000227459  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3596  ribonuclease HII  35.77 
 
 		 257 aa  135  9e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00191298  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1449  ribonuclease HII  41.67 
 
 		 226 aa  135  9e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000143368  normal  0.271939 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  40.88 
 
 		 202 aa  134  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3688  ribonuclease HII  36.18 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0486132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3578  ribonuclease HII  36.18 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296428  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  42.31 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3975  ribonuclease HII  36.18 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000780116  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  35.16 
 
 		 260 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719683  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  43.08 
 
 		 210 aa  134  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3884  ribonuclease HII  36.18 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1418  ribonuclease HII  38.76 
 
 		 236 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  0.0561712 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  42.31 
 
 		 217 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1405  Ribonuclease H  40.19 
 
 		 262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  41.71 
 
 		 212 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1910  ribonuclease HII  39.11 
 
 		 216 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  36.8 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2476  ribonuclease HII  41.71 
 
 		 221 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0918976  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  44.13 
 
 		 198 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_002936  DET0780  ribonuclease HII  38.69 
 
 		 211 aa  133  3e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1834  Ribonuclease H  43.56 
 
 		 228 aa  133  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0349833 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0482  ribonuclease HII  40.21 
 
 		 211 aa  133  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  40.88 
 
 		 213 aa  132  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2489  ribonuclease HII  37.5 
 
 		 259 aa  132  5e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000648841  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  35.75 
 
 		 255 aa  132  5e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  42.64 
 
 		 227 aa  132  6e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2563  ribonuclease HII  43.94 
 
 		 224 aa  132  6.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00091403  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0986  ribonuclease H  45.05 
 
 		 241 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.216437 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1989  ribonuclease HII  38.74 
 
 		 260 aa  131  9e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  42.39 
 
 		 207 aa  131  9e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  39.56 
 
 		 209 aa  131  9e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  43.09 
 
 		 208 aa  131  9e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2218  ribonuclease HII  42.93 
 
 		 209 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329039  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1292  Ribonuclease H  35.64 
 
 		 209 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000358144  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1676  ribonuclease H  41.21 
 
 		 208 aa  131  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.119655  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  41.18 
 
 		 211 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2216  ribonuclease HII  38.53 
 
 		 260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000227744 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  40.88 
 
 		 211 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  41.94 
 
 		 206 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  40.88 
 
 		 240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  41.08 
 
 		 198 aa  130  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  41.85 
 
 		 203 aa  130  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  42.54 
 
 		 214 aa  130  3e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0628  ribonuclease H  39.36 
 
 		 210 aa  130  3e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0706  ribonuclease HII  39.8 
 
 		 212 aa  130  3e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>