More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1376 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1376  signal recognition particle protein  100 
 
 		 472 aa  946    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00010418  normal  0.848046 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  73.52 
 
 		 478 aa  671    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000697976 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05710  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  75.21 
 
 		 470 aa  700    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000640801  normal  0.0289565 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0849  signal recognition particle protein  66.59 
 
 		 459 aa  603  1.0000000000000001e-171  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.265552 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  54.69 
 
 		 446 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  54.82 
 
 		 453 aa  461  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  52.59 
 
 		 479 aa  462  1e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2056  signal recognition particle protein  53.7 
 
 		 446 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000690531  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  53.46 
 
 		 443 aa  457  1e-127  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  52.34 
 
 		 449 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  54.55 
 
 		 445 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  52.34 
 
 		 449 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  52.34 
 
 		 449 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  52.34 
 
 		 449 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  52.34 
 
 		 449 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  54.8 
 
 		 444 aa  451  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  52.1 
 
 		 449 aa  450  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  52.1 
 
 		 449 aa  450  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  52.1 
 
 		 449 aa  451  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  52.1 
 
 		 449 aa  451  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1304  signal recognition particle protein  54.81 
 
 		 445 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000911633  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.9 
 
 		 446 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  51.87 
 
 		 449 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  53.33 
 
 		 446 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1611  signal recognition particle protein  47.46 
 
 		 522 aa  442  1e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.000856469  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2225  signal recognition particle protein  52.3 
 
 		 451 aa  445  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000252662  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  51.15 
 
 		 450 aa  444  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  53.04 
 
 		 449 aa  444  1e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.38 
 
 		 447 aa  439  9.999999999999999e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  50.93 
 
 		 449 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  52.25 
 
 		 469 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  52.03 
 
 		 448 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  51.63 
 
 		 448 aa  439  9.999999999999999e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3683  signal recognition particle protein  53.61 
 
 		 444 aa  439  9.999999999999999e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2310  signal recognition particle protein  51.64 
 
 		 443 aa  432  1e-120  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0985246  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.71 
 
 		 447 aa  434  1e-120  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1014  signal recognition particle protein  51.93 
 
 		 449 aa  434  1e-120  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000130193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1525  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.89 
 
 		 449 aa  434  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000514832  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1228  signal recognition particle protein  51.76 
 
 		 433 aa  431  1e-119  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000301134  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0655  signal recognition particle protein  53.41 
 
 		 452 aa  431  1e-119  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000216081  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1399  signal recognition particle protein  51.42 
 
 		 449 aa  428  1e-119  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000293601  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0965  Signal recognition particle protein  51.02 
 
 		 449 aa  429  1e-119  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000805339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1227  signal recognition particle protein  51.29 
 
 		 433 aa  430  1e-119  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121808  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3424  signal recognition particle protein  52.29 
 
 		 524 aa  426  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0016197  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  50.46 
 
 		 455 aa  427  1e-118  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000079449  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0982  signal recognition particle protein Ffh  46.32 
 
 		 521 aa  426  1e-118  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2888  signal recognition particle protein  50.45 
 
 		 518 aa  426  1e-118  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403346 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1291  signal recognition particle protein  51.3 
 
 		 449 aa  426  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0012852  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0319  signal recognition particle protein  50.12 
 
 		 439 aa  426  1e-118  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000288102  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.47 
 
 		 481 aa  425  1e-118  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1296  signal recognition particle protein  50 
 
 		 455 aa  425  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000399025  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1321  signal recognition particle protein  50 
 
 		 455 aa  425  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000465855  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0805  Signal recognition particle protein  50.7 
 
 		 451 aa  423  1e-117  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.104742  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4182  signal recognition particle protein  48.43 
 
 		 535 aa  422  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2754  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  49.43 
 
 		 443 aa  423  1e-117  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2181  signal recognition particle protein  48.22 
 
 		 522 aa  422  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.374649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2026  signal recognition particle protein  50.83 
 
 		 493 aa  420  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000241588  hitchhiker  0.00894206 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1493  signal recognition particle protein  50.71 
 
 		 449 aa  421  1e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000265163  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  50.22 
 
 		 492 aa  421  1e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5930  signal recognition particle protein  49.89 
 
 		 518 aa  421  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.411186  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0978  signal recognition particle protein  49.56 
 
 		 508 aa  419  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.304091  normal  0.442389 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1190  signal recognition particle protein  50.73 
 
 		 514 aa  421  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.260849  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1804  signal recognition particle protein  51.64 
 
 		 512 aa  419  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2081  signal recognition particle protein  49.55 
 
 		 517 aa  419  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0785  Signal recognition particle GTPase  49.88 
 
 		 476 aa  421  1e-116  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000113263  unclonable  1.02574e-27 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3390  signal recognition particle protein  49.22 
 
 		 440 aa  416  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.202247  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2543  signal recognition particle protein  50.35 
 
 		 528 aa  415  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.864266  normal  0.151879 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1301  signal recognition particle protein  52.71 
 
 		 514 aa  417  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.556432  normal  0.548465 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09710  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.93 
 
 		 515 aa  415  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.955104 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0457  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  47.64 
 
 		 507 aa  417  9.999999999999999e-116  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.135401  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1561  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  48.24 
 
 		 491 aa  417  9.999999999999999e-116  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  50.57 
 
 		 452 aa  413  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  50.58 
 
 		 450 aa  414  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000192246  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2261  Signal recognition particle protein  50.11 
 
 		 452 aa  412  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.161738  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0244  signal recognition particle protein  49.53 
 
 		 450 aa  414  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450094  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2229  signal recognition particle protein  48.64 
 
 		 527 aa  412  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000229631 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3035  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  48.28 
 
 		 454 aa  414  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1825  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (SRP54)  50.12 
 
 		 516 aa  412  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2409  signal recognition particle protein  50.44 
 
 		 454 aa  414  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000225745  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2489  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  48.98 
 
 		 529 aa  414  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.277512  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1418  signal recognition particle protein  46.97 
 
 		 447 aa  412  1e-114  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000224408  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4011  signal recognition particle protein  49.45 
 
 		 528 aa  413  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.923064  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1939  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.91 
 
 		 520 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778072  normal  0.749024 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1667  signal recognition particle protein  48.75 
 
 		 444 aa  410  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000671364  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3230  signal recognition particle protein  49.55 
 
 		 453 aa  410  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0218227  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1050  signal recognition particle GTPase  49.77 
 
 		 544 aa  410  1e-113  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  49.77 
 
 		 452 aa  411  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3365  signal recognition particle protein  49.55 
 
 		 453 aa  409  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.089536  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1147  signal recognition particle protein  50.23 
 
 		 521 aa  411  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0335878 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1806  signal recognition particle protein  50.48 
 
 		 435 aa  409  1e-113  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000012194  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1286  signal recognition particle protein  48.67 
 
 		 444 aa  409  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.524326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1959  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.91 
 
 		 520 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1387  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  49.1 
 
 		 443 aa  409  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133728  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0384  signal recognition particle protein  51.63 
 
 		 451 aa  411  1e-113  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0884  signal recognition particle protein  49.55 
 
 		 453 aa  410  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.138728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.45 
 
 		 527 aa  410  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.645209  normal  0.354043 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0777  signal recognition particle protein  50.12 
 
 		 441 aa  409  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0503  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.24 
 
 		 462 aa  408  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2005  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.91 
 
 		 520 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0182683  normal  0.803066 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09140  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  49.66 
 
 		 528 aa  409  1e-113  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>