More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1302 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 
535 aa  1096  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  67.35 
 
 
498 aa  721  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  70.51 
 
 
492 aa  756  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  53.63 
 
 
504 aa  541  1e-153  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  43.59 
 
 
490 aa  409  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  40.75 
 
 
495 aa  398  1e-109  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 
482 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  42.67 
 
 
496 aa  388  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 
479 aa  388  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  40.84 
 
 
491 aa  381  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.57278e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  38.86 
 
 
480 aa  379  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 
488 aa  375  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  40.97 
 
 
546 aa  372  1e-102  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 
484 aa  374  1e-102  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 
485 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  4.30888e-08  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  39.24 
 
 
487 aa  371  1e-101  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 
467 aa  369  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  38.58 
 
 
485 aa  366  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  2.49346e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 
494 aa  368  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1055  glutamyl-tRNA synthetase  40.88 
 
 
471 aa  367  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.291926  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  40.31 
 
 
481 aa  367  1e-100  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1892  glutamyl-tRNA synthetase  39.07 
 
 
473 aa  365  1e-99  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0298  glutamyl-tRNA synthetase  39.25 
 
 
469 aa  364  2e-99  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  39.78 
 
 
495 aa  363  4e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 
470 aa  363  6e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  39.62 
 
 
484 aa  362  1e-98  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 
472 aa  361  2e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1325  glutamyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 
471 aa  361  2e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.99689e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 
466 aa  361  2e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1437  glutamyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 
471 aa  361  2e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  8.38412e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2798  glutamyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 
472 aa  359  7e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0783891  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 
468 aa  358  1e-97  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 
466 aa  357  2e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 
471 aa  357  2e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2739  glutamyl-tRNA synthetase  41.07 
 
 
471 aa  358  2e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  4.64093e-09  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 
466 aa  356  7e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3084  glutamyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 
471 aa  355  8e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00745356  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0051  glutamyl-tRNA synthetase / glutamate--tRNA(Gln) ligase  41.91 
 
 
518 aa  355  9e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 
465 aa  355  1e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  38.36 
 
 
490 aa  354  2e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 
463 aa  354  3e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 
464 aa  353  4e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3417  glutamyl-tRNA synthetase  38.83 
 
 
469 aa  352  8e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  6.34908e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1264  glutamyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 
471 aa  352  9e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2931  glutamyl-tRNA synthetase  40.19 
 
 
471 aa  352  1e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  4.00457e-07  normal  0.117314 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1191  glutamyl-tRNA synthetase  39.54 
 
 
471 aa  352  1e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0302622  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  39.62 
 
 
477 aa  352  1e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3632  glutamyl-tRNA synthetase  39.81 
 
 
471 aa  351  2e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  9.08657e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2552  glutamyl-tRNA synthetase  39.62 
 
 
471 aa  350  3e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  1.12104e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2779  glutamyl-tRNA synthetase  39.81 
 
 
471 aa  350  3e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.72763e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02267  hypothetical protein  39.62 
 
 
471 aa  350  5e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  2.11719e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2537  glutamyl-tRNA synthetase  39.62 
 
 
471 aa  350  5e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.81823e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2689  glutamyl-tRNA synthetase  39.62 
 
 
471 aa  350  5e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  5.85345e-12  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1259  glutamyl-tRNA synthetase  39.62 
 
 
471 aa  350  5e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  1.07097e-12  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02306  glutamyl-tRNA synthetase  39.62 
 
 
471 aa  350  5e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  1.63468e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2207  glutamyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 
469 aa  349  6e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  2.88711e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  36.85 
 
 
492 aa  349  9e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2919  glutamyl-tRNA synthetase  39.77 
 
 
469 aa  348  1e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  1.59151e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 
468 aa  348  1e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1272  glutamyl-tRNA synthetase  39.42 
 
 
471 aa  348  1e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  3.52174e-07  hitchhiker  0.00569831 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2649  glutamyl-tRNA synthetase  39.54 
 
 
471 aa  348  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  6.33167e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2558  glutamyl-tRNA synthetase  39.54 
 
 
471 aa  348  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  1.65684e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0456  glutamyl-tRNA synthetase  36.95 
 
 
466 aa  348  2e-94  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 
464 aa  347  2e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2673  glutamyl-tRNA synthetase  39.54 
 
 
471 aa  348  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521229  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2607  glutamyl-tRNA synthetase  39.54 
 
 
471 aa  348  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00191122  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1626  glutamyl-tRNA synthetase  39.04 
 
 
470 aa  347  3e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0744892  normal  0.201462 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004184  glutamyl-tRNA synthetase  40.46 
 
 
475 aa  347  4e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.926878  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0204  glutamyl-tRNA synthetase  36.57 
 
 
506 aa  347  4e-94  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  4.64542e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0996  glutamyl-tRNA synthetase  40.23 
 
 
464 aa  346  6e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.990972 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1806  glutamyl-tRNA synthetase  39.5 
 
 
509 aa  346  6e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  39.11 
 
 
480 aa  346  6e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2779  glutamyl-tRNA synthetase  39.35 
 
 
471 aa  345  9e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00021769  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  51.68 
 
 
469 aa  345  1e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0456  glutamyl-tRNA synthetase  38.4 
 
 
480 aa  345  1e-93  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01271  glutamyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 
475 aa  344  2e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 
466 aa  345  2e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0696  glutamyl-tRNA synthetase  41.35 
 
 
463 aa  345  2e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.69774  normal  0.269454 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 
466 aa  345  2e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1728  glutamyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 
469 aa  344  2e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  4.33955e-07  normal  0.283148 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  40.23 
 
 
467 aa  343  4e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1251  glutamyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 
474 aa  343  4e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.75767  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1352  glutamyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 
474 aa  343  4e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0213404  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2597  glutamyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 
474 aa  343  6e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1449  glutamyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 
469 aa  342  7e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  5.65413e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  39.73 
 
 
467 aa  342  8e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  5.0225e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  38.85 
 
 
491 aa  342  1e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  37.34 
 
 
486 aa  342  1e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  5.07745e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 
485 aa  341  2e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.94011e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  38.42 
 
 
488 aa  340  3e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.04549e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1234  glutamyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 
468 aa  340  3e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.966582  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  37.71 
 
 
501 aa  340  4e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1952  glutamyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 
472 aa  340  4e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1590  glutamyl-tRNA synthetase  39.09 
 
 
467 aa  340  5e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  2.81277e-07 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  37.03 
 
 
469 aa  339  8e-92  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3336  glutamyl-tRNA synthetase  38.95 
 
 
491 aa  339  8e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00658512  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0777  glutamyl-tRNA synthetase  36.57 
 
 
467 aa  339  8e-92  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.980364  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1646  glutamyl-tRNA synthetase  34.89 
 
 
493 aa  339  9e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.875023  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1430  glutamyl-tRNA synthetase  39.77 
 
 
469 aa  338  2e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  6.1517e-06  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1338  glutamyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 
494 aa  337  2e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>