More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1292 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11038  transcription-repair coupling factor mfd  36.41 
 
 		 1234 aa  643    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.970521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1067  transcription-repair coupling factor  38.91 
 
 		 1193 aa  677    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1281  transcription-repair coupling factor  37.32 
 
 		 1148 aa  678    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0067  transcription-repair coupling factor  35.48 
 
 		 1196 aa  664    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1948  transcription-repair coupling factor  38.44 
 
 		 1198 aa  645    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13430  transcription-repair coupling factor Mfd  37.01 
 
 		 1211 aa  654    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0858576  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0141  transcription-repair coupling factor  34.85 
 
 		 1169 aa  645    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1827  transcription-repair coupling factor  36.09 
 
 		 1169 aa  636    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0051  transcription-repair coupling factor  36.38 
 
 		 1176 aa  707    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5258  transcription-repair coupling factor  36.2 
 
 		 1176 aa  703    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3660  transcription-repair coupling factor  51.23 
 
 		 1265 aa  658    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593932 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0052  transcription-repair coupling factor  36.59 
 
 		 1176 aa  711    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0048  transcription-repair coupling factor  36.38 
 
 		 1178 aa  707    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0048  transcription-repair coupling factor  36.4 
 
 		 1176 aa  706    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0182  transcription-repair coupling factor  37.54 
 
 		 1183 aa  672    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1355  transcription-repair coupling factor  37.91 
 
 		 1150 aa  689    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4624  transcription-repair coupling factor  38.23 
 
 		 1211 aa  679    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0538  transcription-repair coupling factor  34.08 
 
 		 1168 aa  641    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0059  transcription-repair coupling factor  36.5 
 
 		 1176 aa  709    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0062  transcription-repair coupling factor  36.38 
 
 		 1176 aa  707    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0064  transcription-repair coupling factor  37.37 
 
 		 1201 aa  666    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.862894  normal  0.0454923 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0214  transcription-repair coupling factor  36.72 
 
 		 1157 aa  670    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0683043  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0124  transcription-repair coupling factor  53.06 
 
 		 1147 aa  1196    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00760781  normal  0.18165 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4525  transcription-repair coupling factor  38.11 
 
 		 1192 aa  680    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0665  transcription-repair coupling factor  38.1 
 
 		 1187 aa  656    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0091  transcription-repair coupling factor  36.17 
 
 		 1161 aa  640    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0197  transcription-repair coupling factor  36.99 
 
 		 1157 aa  676    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5656599999999998e-21 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1064  transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase)  37.36 
 
 		 1154 aa  683    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.566316  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0700  transcription-repair coupling factor  35.1 
 
 		 1165 aa  637    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00154056  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3189  transcription-repair coupling factor  38.13 
 
 		 1218 aa  692    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.905154  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3547  transcription-repair coupling factor  36.32 
 
 		 1158 aa  668    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0162042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0214  transcription-repair coupling factor  37.76 
 
 		 1197 aa  725    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07780  transcription-repair coupling factor Mfd  38.11 
 
 		 1212 aa  643    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.111573 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0052  transcription-repair coupling factor  36.59 
 
 		 1176 aa  711    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0111  transcription-repair coupling factor  37.58 
 
 		 1169 aa  712    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00148726  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0081  transcription-repair coupling factor  38.92 
 
 		 1183 aa  724    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000883466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0525  transcription-repair coupling factor  34.08 
 
 		 1168 aa  641    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3741  transcription-repair coupling factor  37.84 
 
 		 1182 aa  694    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.34254 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0058  transcription-repair coupling factor  36.4 
 
 		 1176 aa  703    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1560  transcription-repair coupling factor  37.32 
 
 		 1195 aa  654    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.93701  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0593  transcription-repair coupling factor  36.6 
 
 		 1165 aa  696    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0131  transcription-repair coupling factor  36.98 
 
 		 1197 aa  655    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.10317  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1023  transcription-repair coupling factor  39.05 
 
 		 1168 aa  692    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8585  transcription-repair coupling factor  37.5 
 
 		 1204 aa  642    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3135  transcription-repair coupling factor  38.25 
 
 		 1164 aa  669    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.223116  normal  0.109749 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0072  transcription-repair coupling factor  37.87 
 
 		 1176 aa  671    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0902915  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0638  transcription-repair coupling factor  34.76 
 
 		 1141 aa  640    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138681  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4245  transcription-repair coupling factor  38.23 
 
 		 1211 aa  680    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1292  transcription-repair coupling factor  100 
 
 		 1161 aa  2352    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1092  transcription-repair coupling factor  37.86 
 
 		 1148 aa  680    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0048  transcription-repair coupling factor  36.98 
 
 		 1176 aa  714    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2807  transcription-repair coupling factor  36.38 
 
 		 1162 aa  697    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2493  transcription-repair coupling factor  36.83 
 
 		 1162 aa  703    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0803  transcription-repair coupling factor  38.41 
 
 		 1188 aa  662    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0214899 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0657  transcription-repair coupling factor  36 
 
 		 1202 aa  636    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0140  transcription-repair coupling factor  35.31 
 
 		 1159 aa  650    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00133746  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1935  transcription-repair coupling factor  36.87 
 
 		 1216 aa  642    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.671489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1298  transcription-repair coupling factor  38.16 
 
 		 1220 aa  664    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000122104 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0050  transcription-repair coupling factor  36.42 
 
 		 1177 aa  692    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21200  transcription-repair coupling factor  36.89 
 
 		 1170 aa  694    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.010694  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0011  transcription-repair coupling factor  34.34 
 
 		 1162 aa  671    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0112  transcription-repair coupling factor  36.43 
 
 		 1179 aa  667    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0271  transcription-repair coupling factor  35.7 
 
 		 1165 aa  645    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0915  transcription-repair coupling factor  38.61 
 
 		 1179 aa  678    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0521422  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1245  transcription-repair coupling factor  40 
 
 		 1222 aa  657    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.877482  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3479  transcription-repair coupling factor  37.74 
 
 		 1189 aa  679    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.706369  normal  0.219385 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2656  transcription-repair coupling factor  38.99 
 
 		 1207 aa  687    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0357057  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0048  transcription-repair coupling factor  37.18 
 
 		 1177 aa  675    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08480  transcription-repair coupling factor Mfd  66.47 
 
 		 1155 aa  1546    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.13697  normal  0.343175 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0499  transcription-repair coupling factor  37.21 
 
 		 1177 aa  678    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.245405  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0924  transcription-repair coupling factor  37.9 
 
 		 1224 aa  652    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.410165  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4331  transcription-repair coupling factor  38.23 
 
 		 1211 aa  680    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.376638 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1478  transcription-repair coupling factor  51.93 
 
 		 1246 aa  660    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.313815 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4777  transcription-repair coupling factor  37.85 
 
 		 1212 aa  665    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.549284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0048  transcription-repair coupling factor  36.1 
 
 		 1176 aa  699    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5241  transcription-repair coupling factor  37.97 
 
 		 1112 aa  633  1e-180  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2632  transcription-repair coupling factor  50.08 
 
 		 1178 aa  630  1e-179  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0017  transcription-repair coupling factor  36.5 
 
 		 1157 aa  629  1e-178  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0270668  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2072  transcription-repair coupling factor  48.78 
 
 		 1123 aa  627  1e-178  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0399  transcription-repair coupling factor  35.16 
 
 		 1179 aa  629  1e-178  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1933  transcription-repair coupling factor  35.62 
 
 		 1173 aa  628  1e-178  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436616  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10511  transcriptional-repair coupling factor  31.54 
 
 		 1167 aa  625  1e-177  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605187 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0369  transcriptional-repair coupling factor  31.75 
 
 		 1167 aa  624  1e-177  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0777  transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase)  35 
 
 		 1194 aa  624  1e-177  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1705  transcription-repair coupling factor  35.71 
 
 		 1174 aa  621  1e-176  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0262  transcription-repair coupling factor  34.6 
 
 		 1179 aa  619  1e-176  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1161  transcription-repair coupling factor  34.98 
 
 		 1143 aa  620  1e-176  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1299  transcription-repair coupling factor  33.39 
 
 		 1157 aa  618  1e-175  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0424  transcription-repair coupling factor  48.15 
 
 		 1210 aa  618  1e-175  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3926  transcription-repair coupling factor  47.43 
 
 		 1208 aa  616  1e-175  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.892466 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2767  transcription-repair coupling factor  36.92 
 
 		 1188 aa  615  9.999999999999999e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1326  transcription-repair coupling factor  36.59 
 
 		 1153 aa  614  9.999999999999999e-175  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4404  transcription-repair coupling factor  35.06 
 
 		 1166 aa  613  9.999999999999999e-175  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.353859  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2754  transcription-repair coupling factor  49.84 
 
 		 1112 aa  614  9.999999999999999e-175  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.502691  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32300  transcription-repair coupling factor Mfd  46.4 
 
 		 1199 aa  615  9.999999999999999e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.742659  normal  0.328282 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5808  transcription-repair coupling factor  47.27 
 
 		 1351 aa  615  9.999999999999999e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.294236  normal  0.50078 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1246  transcription-repair coupling factor  33.3 
 
 		 1157 aa  613  9.999999999999999e-175  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.545868  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2685  transcription-repair coupling factor  47.41 
 
 		 1218 aa  611  1e-173  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1257  transcription-repair coupling factor  36.74 
 
 		 1147 aa  612  1e-173  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.230651  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1709  transcription-repair coupling factor  35.62 
 
 		 1137 aa  612  1e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.517079  normal  0.0571023 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>