More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1261 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1261  cell cycle protein  100 
 
 		 397 aa  797    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0112895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14200  cell division membrane protein  63.32 
 
 		 405 aa  476  1e-133  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06110  rod shape-determining protein RodA  60.81 
 
 		 404 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000223269 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0674  cell cycle protein  42.78 
 
 		 408 aa  285  9e-76  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.935594  normal  0.572504 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  38.52 
 
 		 365 aa  248  1e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  39.12 
 
 		 378 aa  238  1e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  37.6 
 
 		 379 aa  236  6e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1459  cell cycle protein  40.67 
 
 		 388 aa  236  7e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  35.98 
 
 		 380 aa  219  8.999999999999998e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  38.12 
 
 		 378 aa  217  2.9999999999999998e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  35 
 
 		 369 aa  211  1e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0522  rod shape-determining protein RodA  38.12 
 
 		 372 aa  209  6e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.886192  hitchhiker  0.00122393 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4287  rod shape-determining protein RodA  34.07 
 
 		 426 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  36.52 
 
 		 387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0956  rod shape-determining protein RodA  37.87 
 
 		 382 aa  200  5e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.215548  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7281  rod shape-determining protein RodA  39.07 
 
 		 407 aa  199  7.999999999999999e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6465  rod shape-determining protein RodA  35.51 
 
 		 382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.848347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0999  rod shape-determining protein RodA  35.2 
 
 		 379 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.771718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3056  rod shape-determining protein RodA  34.65 
 
 		 419 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176215 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2325  RodA, rod cell shape determining protein  35.2 
 
 		 379 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574517  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  34.22 
 
 		 379 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3169  rod shape-determining protein RodA  35.51 
 
 		 382 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0940392  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3130  rod shape-determining protein RodA  34.99 
 
 		 382 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.416509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2500  rod shape-determining protein RodA  34.99 
 
 		 382 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3114  rod shape-determining protein RodA  34.99 
 
 		 382 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376248  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0983  cell cycle protein  33.99 
 
 		 376 aa  196  7e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.867453  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  41.24 
 
 		 412 aa  196  7e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3052  rod shape-determining protein RodA  35.51 
 
 		 382 aa  196  9e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0992  rod shape-determining protein RodA  40.48 
 
 		 371 aa  195  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0276003  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  36.46 
 
 		 382 aa  195  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2662  rod shape-determining protein RodA  33.94 
 
 		 398 aa  194  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7278  rod shape-determining protein  38.78 
 
 		 387 aa  194  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3302  cell cycle protein  32 
 
 		 417 aa  193  5e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311457  decreased coverage  0.00878539 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1104  cell division protein FtsW  34.53 
 
 		 421 aa  193  6e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.921577  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3461  rod shape-determining protein RodA  36.41 
 
 		 413 aa  191  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0402831  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1203  rod shape-determining protein RodA  35.25 
 
 		 374 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4969  rod shape-determining protein RodA  34.88 
 
 		 380 aa  190  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  38.75 
 
 		 368 aa  189  7e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4069  rod shape-determining protein RodA  32.63 
 
 		 417 aa  189  8e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0500  rod shape-determining protein RodA  33.78 
 
 		 384 aa  189  8e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0107532 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4108  rod shape-determining protein RodA  32.63 
 
 		 417 aa  189  8e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.136733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0401  cell division protein  37.14 
 
 		 412 aa  188  1e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.908892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  38.14 
 
 		 369 aa  187  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1045  rod shape-determining membrane protein; sensitivity to radiation and drugs  36.66 
 
 		 365 aa  187  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3111  rod shape-determining protein RodA  35.51 
 
 		 382 aa  188  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  34.41 
 
 		 377 aa  187  3e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2730  rod shape-determining protein RodA  33.06 
 
 		 371 aa  186  5e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00606092  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1234  rod shape-determining protein RodA  32.26 
 
 		 366 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  35.48 
 
 		 371 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0760  rod shape-determining protein RodA  33.16 
 
 		 388 aa  184  3e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1928  cell division protein  33 
 
 		 412 aa  183  5.0000000000000004e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.229986  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  36.54 
 
 		 366 aa  182  6e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  34.81 
 
 		 371 aa  182  9.000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1108  rod shape-determining protein RodA  38.13 
 
 		 367 aa  181  1e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.380475  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  35.93 
 
 		 366 aa  182  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  38.48 
 
 		 366 aa  181  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1455  rod shape-determining protein RodA  34.81 
 
 		 373 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  35.33 
 
 		 374 aa  181  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1758  rod shape-determining protein RodA  37.88 
 
 		 366 aa  181  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.225068 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2459  rod shape-determining protein RodA  36.49 
 
 		 366 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  35.31 
 
 		 366 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0351  rod shape-determining protein RodA  34.26 
 
 		 407 aa  179  4.999999999999999e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000405805  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1358  rod shape-determining protein RodA  34.81 
 
 		 373 aa  179  7e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1416  rod shape-determining protein RodA  34.45 
 
 		 384 aa  179  7e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17671  cell division membrane protein  33.33 
 
 		 423 aa  179  8e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.830985  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0103  rod shape-determining protein RodA  31.16 
 
 		 374 aa  179  9e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0858825  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0142  rod shape-determining protein RodA  34.2 
 
 		 382 aa  178  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0099283  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  34.23 
 
 		 373 aa  178  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0615  rod shape-determining protein RodA  34.79 
 
 		 381 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.131957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4402  putative rod shape-determining protein, rodA  33.51 
 
 		 382 aa  178  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17871  cell division membrane protein  32.79 
 
 		 422 aa  177  3e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.17316  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1543  rod shape-determining protein RodA  38.74 
 
 		 401 aa  177  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.391462  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0362  rod shape-determining protein RodA  33.94 
 
 		 382 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  34.68 
 
 		 366 aa  177  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4036  rod shape-determining protein RodA  32.13 
 
 		 380 aa  177  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.924124  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  34.23 
 
 		 403 aa  177  4e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  34.23 
 
 		 364 aa  176  4e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  32.24 
 
 		 368 aa  177  4e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0177  rod shape-determining protein RodA  33.94 
 
 		 382 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.365127  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0158  rod shape-determining protein RodA  33.94 
 
 		 382 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2464  rod shape-determining protein RodA  38.99 
 
 		 386 aa  176  5e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  32.51 
 
 		 368 aa  176  5e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2789  rod shape-determining protein RodA  33.94 
 
 		 382 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2370  rod shape-determining protein RodA  33.94 
 
 		 382 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2290  rod shape-determining protein RodA  33.94 
 
 		 382 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.765831  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0322  rod shape-determining protein RodA  33.51 
 
 		 382 aa  176  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0166  rod shape-determining protein RodA  33.94 
 
 		 382 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215691  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4859  rod shape-determining protein RodA  35.8 
 
 		 380 aa  176  7e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4364  cell cycle protein  35.23 
 
 		 381 aa  176  7e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1134  rod shape-determining protein RodA  37.19 
 
 		 366 aa  176  7e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.536387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0112  rod shape-determining protein RodA  34.14 
 
 		 370 aa  175  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1672  rod shape determining protein  33.88 
 
 		 422 aa  175  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.111343  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17711  cell division membrane protein  33.6 
 
 		 422 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1973  rod shape-determining protein RodA  33.62 
 
 		 372 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3151  cell wall shape-determining protein  36.41 
 
 		 370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0537844  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0568  rod shape-determining protein RodA  32.91 
 
 		 421 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1034  cell cycle protein  34.48 
 
 		 402 aa  174  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4824  rod-shape-determining protein RodA  36.08 
 
 		 381 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0474  rod shape-determining protein RodA  32.7 
 
 		 378 aa  174  3.9999999999999995e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268193  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1486  rod shape-determining protein RodA  32.11 
 
 		 389 aa  173  3.9999999999999995e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>