More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1234 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1234  ribosomal protein L35  100 
 
 		 65 aa  130  5e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000264492  normal  0.0861149 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05730  LSU ribosomal protein L35P  87.69 
 
 		 65 aa  116  7.999999999999999e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000571086  normal  0.0115615 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15190  LSU ribosomal protein L35P  72.31 
 
 		 65 aa  94  6e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00179087  normal  0.120131 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0523  ribosomal protein L35  65.08 
 
 		 66 aa  87  8e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000250837  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  71.67 
 
 		 65 aa  81.6  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  73.21 
 
 		 65 aa  78.6  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2145  50S ribosomal protein L35  61.29 
 
 		 65 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000037882  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1857  50S ribosomal protein L35  61.29 
 
 		 65 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000905032  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  63.33 
 
 		 65 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0216  50S ribosomal protein L35  65 
 
 		 65 aa  73.2  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000459393  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  56.9 
 
 		 65 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1757  50S ribosomal protein L35P  54.84 
 
 		 66 aa  72  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000556581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2626  50S ribosomal protein L35  61.67 
 
 		 65 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000318579  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1822  LSU ribosomal protein L35P  63.49 
 
 		 64 aa  72.4  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000209842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1871  ribosomal protein L35  59.32 
 
 		 65 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000188111  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2053  50S ribosomal protein L35  59.68 
 
 		 65 aa  71.6  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471288  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1091  50S ribosomal protein L35  58.33 
 
 		 64 aa  70.1  0.000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000360763  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  60 
 
 		 65 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  58.33 
 
 		 65 aa  70.1  0.000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1413  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 64 aa  69.7  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000182997  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3755  ribosomal protein L35  55.38 
 
 		 65 aa  69.7  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241542 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1476  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 64 aa  68.2  0.00000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000416006  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1992  ribosomal protein L35  59.32 
 
 		 65 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.709618  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2306  ribosomal protein L35  55 
 
 		 65 aa  67.4  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0184658  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2228  ribosomal protein L35  59.32 
 
 		 65 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00277145 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1729  50S ribosomal protein L35  50.79 
 
 		 64 aa  67  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00486125  hitchhiker  0.0014444 
 
 
-
 
NC_002950  PG0990  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 		 65 aa  67  0.00000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1644a  50S ribosomal protein L35  60 
 
 		 64 aa  67  0.00000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00277503  normal  0.0564408 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0026  50S ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 65 aa  66.6  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  56.45 
 
 		 79 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1205  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  65.5  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000004157  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  55 
 
 		 65 aa  65.5  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2241  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00115942  hitchhiker  0.00480689 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3038  ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 64 aa  65.1  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.153889  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3023  50S ribosomal protein L35  60.34 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2612  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0594985  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0429  ribosomal protein L35  53.33 
 
 		 64 aa  64.7  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1908  ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 66 aa  64.7  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22420  LSU ribosomal protein L35P  52.38 
 
 		 64 aa  64.3  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  57.14 
 
 		 65 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2659  ribosomal protein L35  55.17 
 
 		 66 aa  63.9  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000049252  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2399  ribosomal protein L35  56.67 
 
 		 63 aa  63.9  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00298171  normal  0.367465 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0426  ribosomal protein L35  55.17 
 
 		 65 aa  63.5  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000276792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21900  LSU ribosomal protein L35P  53.97 
 
 		 64 aa  63.5  0.0000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404594  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5472  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 64 aa  63.5  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2460  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 64 aa  63.5  0.0000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3070  ribosomal protein L35  52.38 
 
 		 64 aa  63.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1614  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 64 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000148702  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1302  50S ribosomal protein L35P  52.31 
 
 		 65 aa  63.2  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.357951  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1268  50S ribosomal protein L35  49.21 
 
 		 64 aa  63.2  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.35125 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1104  ribosomal protein L35  53.97 
 
 		 64 aa  62.4  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.124943  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3168  ribosomal protein L35  52.38 
 
 		 64 aa  62.4  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.422818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0876  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000162638  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05600  ribosomal protein L35  60.42 
 
 		 57 aa  61.6  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000612539  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0799  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 66 aa  61.6  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 68 aa  61.6  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1009  50S ribosomal protein L35P  53.23 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0922518  hitchhiker  0.0085078 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0914  ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1162  ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 68 aa  60.8  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000825182  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1243  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 66 aa  60.8  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143813  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2847  ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 64 aa  60.8  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161293  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1142  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000161072  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5482  ribosomal protein L35  53.97 
 
 		 64 aa  60.1  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.424037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1737  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617441  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4705  50S ribosomal protein L35  55.17 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804213  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4470  50S ribosomal protein L35  55.17 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000641004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4305  50S ribosomal protein L35  55.17 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4316  50S ribosomal protein L35  55.17 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000453199  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2768  50S ribosomal protein L35  50.79 
 
 		 66 aa  60.1  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2641  50S ribosomal protein L35  50.79 
 
 		 66 aa  60.1  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3260  50S ribosomal protein L35  53.45 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000643202  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2097  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  60.1  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4818  50S ribosomal protein L35  55.17 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129882  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4682  50S ribosomal protein L35  55.17 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000635188  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1771  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000608449  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0767  ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0555  50S ribosomal protein L35  55.17 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000323504  hitchhiker  9.12848e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4698  50S ribosomal protein L35  55.17 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000030404  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14580  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 64 aa  59.7  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2217  ribosomal protein L35  51.72 
 
 		 64 aa  60.1  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0577163 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12260  LSU ribosomal protein L35P  52.38 
 
 		 64 aa  59.7  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.162562  normal  0.135462 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4689  50S ribosomal protein L35  55.17 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.93198e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4405  50S ribosomal protein L35  55.17 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000318772  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25680  50S ribosomal protein L35  49.21 
 
 		 64 aa  59.7  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0751  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 67 aa  58.9  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000137261  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2417  ribosomal protein L35  46.03 
 
 		 64 aa  59.3  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2301  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0994  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2122  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000215801  normal  0.0294636 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1317  ribosomal protein L35  49.21 
 
 		 64 aa  59.3  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.660104  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1957  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000132572  normal  0.347549 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2019  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101706  normal  0.0487659 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2045  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000199534  hitchhiker  0.00708309 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1452  ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.150894  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2018  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2065  50S ribosomal protein L35P  46.03 
 
 		 63 aa  58.2  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.100679  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1839  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 63 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2016  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 64 aa  58.5  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000210298  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1767  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 64 aa  58.2  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852967  normal  0.0187188 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1343  ribosomal protein L35  49.18 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000164157  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>