More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1233 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1233  translation initiation factor IF-3  100 
 
 
198 aa  407  1e-113  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  1.35112e-07  normal  0.0984034 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  79.58 
 
 
197 aa  317  1e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  2.8162e-05  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  83.43 
 
 
207 aa  313  1e-84  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  1.88671e-05  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0522  translation initiation factor IF-3  67.84 
 
 
193 aa  243  1e-63  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  6.92532e-08  hitchhiker  5.79185e-07 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6087  Translation initiation factor 3 (IF-3)-like protein  55.17 
 
 
222 aa  206  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897729  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4144  translation initiation factor IF-3  58.54 
 
 
227 aa  205  4e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415962  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3169  translation initiation factor IF-3  56.97 
 
 
277 aa  204  5e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2042  translation initiation factor IF-3  57.23 
 
 
199 aa  204  7e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0708817  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3182  translation initiation factor IF-3  58.43 
 
 
205 aa  203  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466683  normal  0.175076 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11658  translation initiation factor IF-3  59.04 
 
 
201 aa  202  3e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3039  translation initiation factor IF-3  53.16 
 
 
212 aa  202  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271102  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3328  translation initiation factor IF-3  59.04 
 
 
243 aa  201  5e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.825238  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3025  translation initiation factor 3  58.43 
 
 
238 aa  201  5e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.335133 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1269  translation initiation factor 3  57.32 
 
 
225 aa  201  5e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.628011  normal  0.508823 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3052  translation initiation factor IF-3  56.57 
 
 
182 aa  201  5e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2981  translation initiation factor 3  58.43 
 
 
238 aa  201  5e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2996  translation initiation factor 3  58.43 
 
 
238 aa  201  6e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.171641  normal  0.0309942 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1316  translation initiation factor IF-3  51.34 
 
 
351 aa  201  7e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2459  translation initiation factor 3  57.83 
 
 
243 aa  201  7e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3622  translation initiation factor IF-3  57.14 
 
 
357 aa  200  1e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0913675  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5483  translation initiation factor IF-3  56.63 
 
 
250 aa  199  2e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195942  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1875  translation initiation factor IF-3  56.71 
 
 
239 aa  199  2e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.384688 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1477  translation initiation factor 3  53.94 
 
 
396 aa  197  7e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0613769  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3071  translation initiation factor IF-3  58.82 
 
 
182 aa  197  1e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427548  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  56.21 
 
 
198 aa  197  1e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1480  translation initiation factor IF-3  53.94 
 
 
356 aa  196  2e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.87235e-11 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5473  translation initiation factor IF-3  52.17 
 
 
204 aa  196  2e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1624  translation initiation factor IF-3  51.81 
 
 
415 aa  195  3e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.640548 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1103  translation initiation factor IF-3  49.21 
 
 
233 aa  195  4e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0433779  normal  0.928932 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22440  translation initiation factor 3  50.82 
 
 
329 aa  194  7e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1882  translation initiation factor IF-3  55.9 
 
 
204 aa  192  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0284235  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  55.49 
 
 
202 aa  192  3e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  56.79 
 
 
178 aa  192  3e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  56.17 
 
 
178 aa  192  4e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  55.9 
 
 
172 aa  191  6e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2418  translation initiation factor IF-3  53.07 
 
 
196 aa  191  7e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2066  translation initiation factor 3  58.17 
 
 
179 aa  190  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.383221  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0475  translation initiation factor IF-3  51.46 
 
 
253 aa  189  2e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2139  translation initiation factor IF-3  57.52 
 
 
177 aa  189  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0045601  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1249  translation initiation factor IF-3  57.14 
 
 
174 aa  189  3e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.246001 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  50.92 
 
 
173 aa  188  5e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1301  translation initiation factor 3  59.21 
 
 
175 aa  185  3e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.444006  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2385  translation initiation factor IF-3  55.56 
 
 
192 aa  185  3e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157849  normal  0.289584 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14590  translation initiation factor 3  50.91 
 
 
401 aa  186  3e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  48.28 
 
 
219 aa  184  6e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  4.86529e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  50.57 
 
 
238 aa  183  1e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  53.94 
 
 
194 aa  182  2e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1678  translation initiation factor IF-3  53.42 
 
 
170 aa  182  2e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0127847  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1968  translation initiation factor IF-3  51.5 
 
 
183 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00361564  hitchhiker  0.00796429 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  53.66 
 
 
190 aa  182  3e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25690  translation initiation factor 3  55.7 
 
 
168 aa  182  3e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  53.33 
 
 
194 aa  182  3e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2307  translation initiation factor IF-3  54 
 
 
154 aa  182  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00282878  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2218  translation initiation factor IF-3  52.41 
 
 
182 aa  182  3e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  2.64089e-06  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  53.33 
 
 
194 aa  182  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  54.97 
 
 
154 aa  182  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  1.20038e-09  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  53.09 
 
 
178 aa  181  5e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3224  translation initiation factor IF-3  52.17 
 
 
183 aa  181  7e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.51494 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2466  translation initiation factor IF-3  52.17 
 
 
177 aa  181  7e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00240261  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3480  translation initiation factor IF-3  52.17 
 
 
183 aa  181  7e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0422454  normal  0.0155112 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  50 
 
 
187 aa  181  7e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  1.11233e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1341  translation initiation factor IF-3  55.21 
 
 
173 aa  181  8e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0671  translation initiation factor IF-3  48.63 
 
 
192 aa  180  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.395911  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12250  translation initiation factor 3  52.05 
 
 
195 aa  179  2e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.109497  normal  0.154931 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0428  translation initiation factor IF-3  54.97 
 
 
156 aa  179  2e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  50.93 
 
 
164 aa  179  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2908  translation initiation factor IF-3  55.42 
 
 
185 aa  179  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447885  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  53.9 
 
 
165 aa  179  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  7.58155e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4267  translation initiation factor IF-3  50.87 
 
 
178 aa  179  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2109  translation initiation factor IF-3  54.6 
 
 
219 aa  179  3e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  2.73336e-05  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2229  translation initiation factor IF-3  55.28 
 
 
173 aa  179  3e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00231449 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2996  translation initiation factor IF-3  47.65 
 
 
173 aa  179  3e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0425  translation initiation factor IF-3  51.55 
 
 
171 aa  179  3e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  9.64088e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  51.85 
 
 
173 aa  178  5e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2804  translation initiation factor IF-3  49.43 
 
 
180 aa  178  6e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1409  translation initiation factor IF-3  51.23 
 
 
172 aa  177  8e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.37178e-16  unclonable  1.34184e-28 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0830  translation initiation factor IF-3  53.01 
 
 
169 aa  177  8e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.124767  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2613  translation initiation factor IF-3  49.7 
 
 
172 aa  177  9e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0154974  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0766  translation initiation factor IF-3  50.59 
 
 
181 aa  177  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3542  initiation factor 3  60.74 
 
 
175 aa  177  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.407448  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  53.7 
 
 
173 aa  177  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  50 
 
 
225 aa  177  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2242  translation initiation factor IF-3  50.31 
 
 
166 aa  177  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  4.66118e-05  hitchhiker  0.00531509 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1557  translation initiation factor IF-3  55.63 
 
 
156 aa  176  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  50.62 
 
 
179 aa  176  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  1.29093e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  50.31 
 
 
174 aa  176  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0364  translation initiation factor 3  51.23 
 
 
182 aa  176  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  2.97976e-05  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1924  translation initiation factor IF-3  52.98 
 
 
180 aa  175  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  6.76935e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1914  translation initiation factor IF-3  52.98 
 
 
180 aa  175  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.119522  normal  0.223345 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01676  hypothetical protein  52.98 
 
 
180 aa  175  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0101258  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01384  translation initiation factor IF-3  55.26 
 
 
159 aa  175  4e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0488  translation initiation factor IF-3  52.98 
 
 
184 aa  174  5e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.270402  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1728  initiation factor 3  61.36 
 
 
149 aa  175  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00351932  hitchhiker  0.00163995 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2638  translation initiation factor IF-3  50.9 
 
 
169 aa  174  6e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.294805  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4532  translation initiation factor IF-3  49.71 
 
 
204 aa  174  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1613  translation initiation factor IF-3  58.39 
 
 
145 aa  174  7e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  3.06668e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1161  translation initiation factor 3  55.33 
 
 
154 aa  174  7e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.930143 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1713  translation initiation factor IF-3  54.97 
 
 
156 aa  173  1e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225755  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1736  translation initiation factor IF-3  54.97 
 
 
156 aa  173  1e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0964  translation initiation factor IF-3  54.97 
 
 
156 aa  173  1e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.698743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>