More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0974 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0974  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 		 351 aa  690    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485964 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12840  Holliday junction DNA helicase, RuvB subunit  82.09 
 
 		 342 aa  554  1e-157  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07050  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  79.48 
 
 		 346 aa  551  1e-156  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0259708  normal  0.32105 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0893  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.48 
 
 		 355 aa  473  1e-132  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0248566  normal  0.109317 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.79 
 
 		 342 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1662  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.23 
 
 		 344 aa  437  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1334  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.58 
 
 		 336 aa  430  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00146189  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1111  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.91 
 
 		 336 aa  426  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0182  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.27 
 
 		 330 aa  422  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.107724  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1454  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.85 
 
 		 338 aa  422  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00617754  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0993  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.52 
 
 		 339 aa  421  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2173  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.28 
 
 		 338 aa  419  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1700  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.83 
 
 		 336 aa  421  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.979156 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1348  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.66 
 
 		 335 aa  419  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000729469  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2321  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.33 
 
 		 338 aa  420  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0801363  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1413  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.79 
 
 		 338 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000447105  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2295  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.6 
 
 		 354 aa  417  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.697474  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0930  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.09 
 
 		 337 aa  414  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08899e-19 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  60 
 
 		 338 aa  413  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.09 
 
 		 337 aa  414  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2338  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.98 
 
 		 341 aa  414  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.36 
 
 		 338 aa  414  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3053  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.38 
 
 		 347 aa  414  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00505613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01601  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.37 
 
 		 334 aa  411  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1914  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.19 
 
 		 346 aa  412  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.881397  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0606  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.68 
 
 		 349 aa  408  1e-113  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.622406  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_545  Holliday junction DNA helicase subunit  58.98 
 
 		 349 aa  410  1e-113  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2521  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.91 
 
 		 333 aa  410  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.32 
 
 		 345 aa  409  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2203  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.88 
 
 		 346 aa  409  1e-113  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1756  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.04 
 
 		 351 aa  409  1e-113  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.523828  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3124  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.01 
 
 		 346 aa  408  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0418  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.04 
 
 		 351 aa  409  1e-113  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1215  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.29 
 
 		 351 aa  409  1e-113  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.423128  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4315  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.38 
 
 		 336 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0417721  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4060  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.84 
 
 		 358 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01559  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.49 
 
 		 345 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192423  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0894  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.44 
 
 		 340 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00558721  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2533  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.57 
 
 		 344 aa  405  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.26511  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003922  holliday junction DNA helicase RuvB  59.75 
 
 		 355 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000262975  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0927  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.7 
 
 		 333 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0580  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.94 
 
 		 349 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.990444  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4500  Holliday junction DNA helicase RuvA  59.38 
 
 		 541 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049576 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2425  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.59 
 
 		 347 aa  405  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1431  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.95 
 
 		 344 aa  405  1.0000000000000001e-112  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000941483  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1223  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.94 
 
 		 345 aa  401  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4505  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.38 
 
 		 333 aa  403  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00121958  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2117  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.15 
 
 		 337 aa  403  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2145  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.69 
 
 		 334 aa  401  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4153  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.38 
 
 		 336 aa  404  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000576232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4164  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.38 
 
 		 336 aa  404  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000669292  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4267  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.69 
 
 		 333 aa  402  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000359024  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02690  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.77 
 
 		 334 aa  402  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000554774  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4539  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.38 
 
 		 333 aa  403  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000348871  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4650  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.38 
 
 		 333 aa  404  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000830982  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1362  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.54 
 
 		 344 aa  404  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0922453  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3137  Holliday junction DNA helicase RuvB  60 
 
 		 333 aa  402  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4554  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.38 
 
 		 333 aa  403  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3832  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.82 
 
 		 351 aa  403  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0696  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.38 
 
 		 333 aa  402  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000306713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0868  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.03 
 
 		 350 aa  403  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.281028  normal  0.0371389 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1116  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.49 
 
 		 338 aa  404  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.848994  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2234  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.67 
 
 		 353 aa  404  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0500  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.75 
 
 		 357 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0391  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.43 
 
 		 357 aa  398  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2254  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.69 
 
 		 336 aa  400  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.442395  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0944  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.51 
 
 		 343 aa  399  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4657  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.7 
 
 		 354 aa  399  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1848  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.27 
 
 		 350 aa  399  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9139  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1436  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.12 
 
 		 334 aa  398  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000380468  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2944  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.02 
 
 		 335 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000368947  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0376  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.43 
 
 		 357 aa  398  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0499  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.69 
 
 		 356 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.456698  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1704  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.18 
 
 		 343 aa  398  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0360063  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01831  Holliday junction DNA helicase B  59.75 
 
 		 336 aa  395  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1780  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.75 
 
 		 336 aa  395  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115623  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0531  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.79 
 
 		 348 aa  397  1e-109  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.899114  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0327  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.46 
 
 		 355 aa  395  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2090  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.75 
 
 		 336 aa  395  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000376613  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2213  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.21 
 
 		 346 aa  394  1e-109  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1227  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.44 
 
 		 361 aa  394  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1953  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.75 
 
 		 336 aa  395  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.128474  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2190  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.19 
 
 		 337 aa  396  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000182664  normal  0.290064 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3694  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.4 
 
 		 356 aa  398  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500554  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2719  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.76 
 
 		 347 aa  397  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0820  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.26 
 
 		 358 aa  397  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4093  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.52 
 
 		 354 aa  395  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0615  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.48 
 
 		 355 aa  396  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01819  hypothetical protein  59.75 
 
 		 336 aa  395  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1324  Holliday junction DNA helicase RuvB  60 
 
 		 355 aa  395  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.211473  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0512  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.06 
 
 		 356 aa  397  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0956  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.75 
 
 		 336 aa  395  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00553774  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2557  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.48 
 
 		 363 aa  395  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3346  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.79 
 
 		 354 aa  398  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729811  hitchhiker  0.00070323 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2362  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.13 
 
 		 337 aa  396  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00859369  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4070  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.68 
 
 		 354 aa  397  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1063  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.2 
 
 		 343 aa  396  1e-109  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1772  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.75 
 
 		 336 aa  395  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0145511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1630  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.88 
 
 		 347 aa  397  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.952442  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0719  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.27 
 
 		 334 aa  396  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.20782  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>