More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0963 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0963  ribosomal protein L4/L1e  100 
 
 		 207 aa  422  1e-117  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000403747  hitchhiker  0.0000000000267396 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16230  ribosomal protein L4  78.16 
 
 		 207 aa  335  2.9999999999999997e-91  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.308573  decreased coverage  0.0000000146284 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10010  LSU ribosomal protein L4P  80.19 
 
 		 207 aa  333  7.999999999999999e-91  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000045126  hitchhiker  0.00000000148432 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1160  ribosomal protein L4/L1e  62.5 
 
 		 208 aa  268  4e-71  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000738717  hitchhiker  0.000000590673 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0292  50S ribosomal protein L4  52.17 
 
 		 205 aa  214  5.9999999999999996e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000472593  unclonable  1.9716100000000001e-28 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0108  50S ribosomal protein L4  48.31 
 
 		 207 aa  213  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0287  50S ribosomal protein L4  50.72 
 
 		 206 aa  213  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0371511  hitchhiker  0.00627174 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0112  50S ribosomal protein L4  49.28 
 
 		 207 aa  212  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000123482  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0596  50S ribosomal protein L4P  48.54 
 
 		 207 aa  211  4.9999999999999996e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000475036  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2317  50S ribosomal protein L4  50.97 
 
 		 207 aa  211  5.999999999999999e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000134967  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2276  50S ribosomal protein L4  50.97 
 
 		 207 aa  211  5.999999999999999e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000009811  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0106  50S ribosomal protein L4  46.86 
 
 		 207 aa  209  3e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000544936  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1830  50S ribosomal protein L4  49.28 
 
 		 207 aa  208  4e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0478396  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0111  50S ribosomal protein L4  46.38 
 
 		 207 aa  207  7e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000572324  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0111  50S ribosomal protein L4  46.38 
 
 		 207 aa  207  7e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000900585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0107  50S ribosomal protein L4  46.38 
 
 		 207 aa  207  7e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.56557e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0105  50S ribosomal protein L4  46.38 
 
 		 207 aa  207  7e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000256275  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0132  50S ribosomal protein L4  46.38 
 
 		 207 aa  207  7e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000136863  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5194  50S ribosomal protein L4  46.38 
 
 		 207 aa  207  7e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  unclonable  1.98377e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0142  50S ribosomal protein L4  46.38 
 
 		 207 aa  207  7e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000690155  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0111  50S ribosomal protein L4  46.38 
 
 		 207 aa  207  7e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000163463  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0123  50S ribosomal protein L4  46.38 
 
 		 207 aa  207  7e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.21989e-61 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0868  50S ribosomal protein L4  47.83 
 
 		 206 aa  206  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000685593  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01180  ribosomal protein L4/L1e  52.74 
 
 		 209 aa  206  3e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000715314  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0628  ribosomal protein L4/L1e  53.03 
 
 		 232 aa  204  5e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1482  50S ribosomal protein L4  47.34 
 
 		 207 aa  202  2e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000984788  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0105  50S ribosomal protein L4  45.89 
 
 		 207 aa  203  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000104823  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0563  50S ribosomal protein L4/L1e  51.49 
 
 		 216 aa  202  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3142  ribosomal protein L4/L1e  51 
 
 		 221 aa  201  5e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.083105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2710  ribosomal protein L4/L1e  48.56 
 
 		 206 aa  200  9.999999999999999e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000254915  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1708  50S ribosomal protein L4  50.25 
 
 		 218 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00274066  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2658  ribosomal protein L4/L1e  52.53 
 
 		 228 aa  197  9e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0226  ribosomal protein L4/L1e  47.83 
 
 		 207 aa  197  1.0000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  45.41 
 
 		 206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000305367  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2401  50S ribosomal protein L4  47.85 
 
 		 208 aa  196  2.0000000000000003e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2904  50S ribosomal protein L4  46.15 
 
 		 208 aa  193  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000879055  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2398  50S ribosomal protein L4  49.04 
 
 		 204 aa  194  1e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000730975  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29730  LSU ribosomal protein L4P  50.51 
 
 		 234 aa  193  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.379343 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1183  ribosomal protein L4/L1e  44.93 
 
 		 208 aa  193  2e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000599505  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0197  50S ribosomal protein L4  44.93 
 
 		 207 aa  193  2e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00203095  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1087  50S ribosomal protein L4  48.28 
 
 		 215 aa  192  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10489 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0216  50S ribosomal protein L4  47.34 
 
 		 206 aa  192  4e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4314  ribosomal protein L4/L1e  50.5 
 
 		 216 aa  191  5e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2713  50S ribosomal protein L4  48.56 
 
 		 204 aa  191  6e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1906  50S ribosomal protein L4  43.96 
 
 		 207 aa  191  7e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000335339  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0059  50S ribosomal protein L4  43 
 
 		 207 aa  190  1e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0599605  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3922  ribosomal protein L4/L1e  49.75 
 
 		 216 aa  189  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2645  50S ribosomal protein L4  49.25 
 
 		 222 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264538  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2332  ribosomal protein L4/L1e  46.38 
 
 		 207 aa  189  2.9999999999999997e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000847375  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0932  ribosomal protein L4/L1e  51.63 
 
 		 217 aa  188  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3994  ribosomal protein L4/L1e  47.64 
 
 		 212 aa  186  2e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1523  ribosomal protein L4/L1e  46.86 
 
 		 207 aa  186  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.790483  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1573  ribosomal protein L4/L1e  43.69 
 
 		 207 aa  186  3e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000791532  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1014  50S ribosomal protein L4  47.74 
 
 		 219 aa  185  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1031  50S ribosomal protein L4  47.74 
 
 		 219 aa  185  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.658773 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1041  50S ribosomal protein L4  47.74 
 
 		 219 aa  185  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03990  LSU ribosomal protein L4P  50.51 
 
 		 228 aa  185  4e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1124  ribosomal protein L4/L1e  46.8 
 
 		 248 aa  184  6e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0759  50S ribosomal protein L4  43 
 
 		 207 aa  184  9e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000566858  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0423  50S ribosomal protein L4  43.96 
 
 		 207 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000203712  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2459  50S ribosomal protein L4P  45.41 
 
 		 207 aa  184  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0863955 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5048  50S ribosomal protein L4  46.97 
 
 		 218 aa  182  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.5122  normal  0.277146 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0716  ribosomal protein L4/L1e  45.1 
 
 		 223 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0583  50S ribosomal protein L4  47.47 
 
 		 245 aa  181  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4506  ribosomal protein L4/L1e  46.7 
 
 		 292 aa  181  6e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6048  50S ribosomal protein L4  48.99 
 
 		 247 aa  180  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.239817 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1306  50S ribosomal protein L4  45.69 
 
 		 219 aa  180  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.265076  normal  0.163333 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3434  ribosomal protein L4/L1e  46.46 
 
 		 217 aa  179  2.9999999999999997e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1764  50S ribosomal protein L4  44.17 
 
 		 206 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00135584  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0195  LSU ribosomal protein L4P  40.58 
 
 		 207 aa  177  7e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00135777  normal  0.0747506 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0954  50S ribosomal protein L4  42.99 
 
 		 221 aa  177  7e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000111144  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5125  ribosomal protein L4/L1e  45.45 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10716  50S ribosomal protein L4  46.19 
 
 		 223 aa  176  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.311364 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20860  LSU ribosomal protein L4P  47 
 
 		 223 aa  176  2e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.699759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4025  ribosomal protein L4/L1e  45.64 
 
 		 221 aa  176  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000717748 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0193  ribosomal protein L4/L1e  43.06 
 
 		 214 aa  176  3e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0307  50S ribosomal protein L4P  51.34 
 
 		 220 aa  176  3e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224676 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2422  50S ribosomal protein L4  44.39 
 
 		 208 aa  175  4e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00578828  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1184  ribosomal protein L4/L1e  45.88 
 
 		 223 aa  175  5e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0689  ribosomal protein L4/L1e  45.96 
 
 		 234 aa  173  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.443511 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0256  ribosomal protein L4/L1 family protein  45.32 
 
 		 221 aa  174  9.999999999999999e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1744  50S ribosomal protein L4  42.58 
 
 		 208 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000318286  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1186  50S ribosomal protein L4/L1e  50.25 
 
 		 217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4916  ribosomal protein L4/L1e  45.32 
 
 		 209 aa  171  5e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.1186  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23800  50S ribosomal protein L4  47.74 
 
 		 312 aa  171  5.999999999999999e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1341  ribosomal protein L4/L1e  48.65 
 
 		 210 aa  171  5.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl124  50S ribosomal protein L4  43.69 
 
 		 208 aa  171  7.999999999999999e-42  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000604234  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2228  50S ribosomal protein L4  47.62 
 
 		 208 aa  171  9e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169782  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3904  50S ribosomal protein L4P  51.65 
 
 		 259 aa  170  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2064  50S ribosomal protein L4  42.23 
 
 		 206 aa  169  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000384651  normal  0.231159 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1137  50S ribosomal protein L4  42.79 
 
 		 223 aa  169  4e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000824266  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0396  50S ribosomal protein L4  42.23 
 
 		 209 aa  168  5e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4320  ribosomal protein L4/L1e  50 
 
 		 204 aa  168  6e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17150  LSU ribosomal protein L4P  50.56 
 
 		 211 aa  168  6e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05720  50S ribosomal protein L4  41.75 
 
 		 208 aa  168  6e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.316206  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0702  50S ribosomal protein L4  42.23 
 
 		 206 aa  167  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000569503  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2256  50S ribosomal protein L4  42.23 
 
 		 206 aa  167  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000129639  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0695  50S ribosomal protein L4  42.72 
 
 		 208 aa  167  1e-40  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0848  50S ribosomal protein L4P  43.96 
 
 		 207 aa  167  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000392239  decreased coverage  0.0000122182 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1616  ribosomal protein L4/L1e  42.44 
 
 		 212 aa  166  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>