82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0941 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0941  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 
141 aa  284  2.9999999999999996e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.551097  normal  0.0671843 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19180  predicted transcriptional regulator  46.81 
 
 
141 aa  136  1e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.433834  normal  0.0717748 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1529  transcriptional regulator, XRE family  50.71 
 
 
139 aa  131  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.17746 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0422  transcriptional regulator  35.25 
 
 
146 aa  82.4  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0194  hypothetical protein  35.71 
 
 
187 aa  51.6  0.000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375729 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2371  transcriptional regulator, XRE family  50.94 
 
 
165 aa  48.9  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.111191  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  37.14 
 
 
123 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  39.66 
 
 
114 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  39.66 
 
 
114 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  45 
 
 
346 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1445  transcriptional regulator, XRE family  32.14 
 
 
147 aa  47  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.275315  normal  0.432426 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4130  prophage lambdaba02, repressor protein  34.67 
 
 
114 aa  47.4  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.05101  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3833  prophage LambdaBa02, repressor protein  34.67 
 
 
114 aa  47.4  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2408  transcriptional regulator, XRE family  32.5 
 
 
129 aa  47  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0754748  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3482  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 
104 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.411907  normal  0.584278 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0082  DNA-binding protein  39.66 
 
 
67 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.815457  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6747  XRE family transcriptional regulator  37.33 
 
 
115 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5234  DNA-binding protein  37.93 
 
 
67 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000302998 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0073  DNA-binding protein  37.93 
 
 
67 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1887  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 
104 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603654  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0074  DNA-binding protein  37.93 
 
 
67 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0858  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 
243 aa  44.7  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.949499  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0733  putative transcriptional regulator  28.74 
 
 
161 aa  44.7  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0086  DNA-binding protein  37.93 
 
 
67 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.786766  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0070  transcriptional regulator  37.93 
 
 
67 aa  44.7  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0083  DNA-binding protein  37.93 
 
 
67 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440854 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0074  DNA-binding protein  37.93 
 
 
67 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0070  transcriptional regulator  37.93 
 
 
67 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  40 
 
 
144 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2142  XRE family transcriptional regulator  41.82 
 
 
175 aa  44.3  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4032  prophage LambdaBa02, repressor protein  32.1 
 
 
114 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00194689  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1458  transcriptional regulator, XRE family  39.71 
 
 
114 aa  44.7  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3450  transcriptional regulator protein-like protein  37.5 
 
 
489 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168406  normal  0.18413 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  34.33 
 
 
321 aa  44.3  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0075  transcriptional regulator, XRE family  36.76 
 
 
73 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1286  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 
197 aa  44.3  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0709374  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3877  helix-turn-helix domain protein  37.31 
 
 
383 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.862285 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 
128 aa  44.3  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  40 
 
 
200 aa  43.9  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000578065  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0070  XRE family transcriptional regulator  36.21 
 
 
67 aa  43.9  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  38.33 
 
 
196 aa  43.5  0.0009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18420  predicted transcriptional regulator  36.92 
 
 
149 aa  43.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.189768  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2256  Cro/CI family transcriptional regulator  37.74 
 
 
104 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.033693 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0013  XRE family transcriptional regulator  35.23 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0072  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 
73 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0666  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 
150 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  39.66 
 
 
263 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3536  helix-turn-helix domain protein  35.53 
 
 
513 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.948286 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1448  transcriptional regulator, XRE family  31.03 
 
 
117 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  34.18 
 
 
206 aa  42.7  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 
68 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  39.62 
 
 
347 aa  42.4  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0718  transcriptional regulator, XRE family  40.38 
 
 
224 aa  42  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.439384  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1077  hypothetical protein  38.81 
 
 
84 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  34.48 
 
 
436 aa  42  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4152  helix-turn-helix domain-containing protein  25.62 
 
 
191 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0591  XRE family transcriptional regulator  30.19 
 
 
113 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2021  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 
500 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1543  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 
359 aa  41.6  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1405  hypothetical protein  45.31 
 
 
68 aa  41.2  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00110719  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0858  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
497 aa  41.6  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.359757  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3505  transcriptional regulator, XRE family  37.04 
 
 
97 aa  41.6  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 
163 aa  41.6  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1265  transcriptional regulator, putative  33.73 
 
 
182 aa  41.6  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1330  XRE family transcriptional regulator  28.07 
 
 
404 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3248  transcriptional regulator, XRE family  31.76 
 
 
110 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2104  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 
95 aa  41.2  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0694198  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1981  helix-turn-helix domain-containing protein  42.31 
 
 
237 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323188  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1801  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  34.78 
 
 
171 aa  41.2  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1361  EPSP synthase (3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase)  40.38 
 
 
516 aa  40.8  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419571  normal  0.53858 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0589  helix-turn-helix domain-containing protein  40.38 
 
 
239 aa  41.2  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0165  hypothetical protein  40.68 
 
 
227 aa  40.4  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 
816 aa  40.8  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1430  transcriptional regulator, XRE family  34.72 
 
 
490 aa  40.4  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236575  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0807  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 
82 aa  40.4  0.009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000393126  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1662  XRE family transcriptional regulator  42.31 
 
 
242 aa  40.4  0.009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.126051  hitchhiker  0.00273483 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0147  hypothetical protein  40.68 
 
 
234 aa  40.4  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3684  transcriptional regulator, XRE family  27.88 
 
 
180 aa  40  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000437538  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0689  XRE family transcriptional regulator  42.31 
 
 
237 aa  40  0.01  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2071  Cro/CI family transcriptional regulator  37.5 
 
 
137 aa  40  0.01  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0247654  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2159  Cro/CI family transcriptional regulator  37.5 
 
 
137 aa  40  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.00000314405  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0255  transcriptional regulator, putative  33.33 
 
 
308 aa  40  0.01  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>