More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0926 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0926  integrase family protein  100 
 
 
438 aa  892    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  27.48 
 
 
370 aa  109  9.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  32.89 
 
 
392 aa  109  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0546  integrase family protein  27.65 
 
 
403 aa  107  4e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.849888  hitchhiker  0.000145945 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  26.06 
 
 
369 aa  106  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  25.76 
 
 
369 aa  105  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  30.55 
 
 
477 aa  104  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  25.25 
 
 
373 aa  100  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  29.86 
 
 
389 aa  99  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  28.97 
 
 
363 aa  99.4  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  23.3 
 
 
374 aa  98.2  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  23.3 
 
 
374 aa  98.2  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26510  site-specific recombinase XerD  30.42 
 
 
443 aa  98.6  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  25.35 
 
 
369 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  28.37 
 
 
435 aa  97.8  4e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  33.49 
 
 
400 aa  97.1  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  25.25 
 
 
370 aa  97.4  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  29.79 
 
 
377 aa  96.7  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  28.81 
 
 
371 aa  95.5  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  23.06 
 
 
381 aa  95.1  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  29.33 
 
 
378 aa  93.6  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  29.63 
 
 
413 aa  93.6  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  27.46 
 
 
383 aa  92.8  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  26.32 
 
 
368 aa  92.4  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  27.15 
 
 
385 aa  92  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  29.6 
 
 
305 aa  92.4  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  27.46 
 
 
390 aa  91.7  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  25.24 
 
 
443 aa  90.5  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  24.11 
 
 
451 aa  90.5  6e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  25.42 
 
 
325 aa  90.1  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  25.33 
 
 
376 aa  90.1  8e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  29.66 
 
 
416 aa  89.7  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  30.42 
 
 
385 aa  89  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0926  phage integrase family site specific recombinase  25.19 
 
 
354 aa  88.6  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000719898  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  30.42 
 
 
506 aa  88.2  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000591844  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  27.36 
 
 
379 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  30.96 
 
 
391 aa  88.2  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  27.36 
 
 
379 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  30.42 
 
 
378 aa  87.4  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  28.65 
 
 
383 aa  87  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  25.78 
 
 
386 aa  85.9  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  29.27 
 
 
414 aa  85.1  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  27.85 
 
 
392 aa  85.5  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3145  integrase family protein  27.59 
 
 
438 aa  84.3  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00138908  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0567  integrase family protein  23.47 
 
 
391 aa  84  0.000000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.563798  hitchhiker  0.00485057 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  24.5 
 
 
378 aa  83.2  0.000000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  25.53 
 
 
391 aa  82  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  30.14 
 
 
431 aa  80.1  0.00000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  31.78 
 
 
377 aa  79.7  0.00000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  27.13 
 
 
379 aa  79.7  0.00000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  27.48 
 
 
404 aa  78.6  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3350  integrase  25.28 
 
 
308 aa  78.2  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00359362  decreased coverage  0.00980373 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  25.65 
 
 
387 aa  78.2  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  23.58 
 
 
393 aa  77.4  0.0000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  27.75 
 
 
426 aa  77.8  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06819  integrase  24 
 
 
341 aa  77.4  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  24.66 
 
 
386 aa  76.6  0.0000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0915  Tn916, transposase  22.55 
 
 
405 aa  77  0.0000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  29.95 
 
 
302 aa  77  0.0000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  27.35 
 
 
390 aa  75.9  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2786  phage integrase family protein  33.33 
 
 
471 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3747  phage integrase family protein  33.33 
 
 
471 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51033  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08320  site-specific recombinase XerD  24.42 
 
 
460 aa  75.5  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.113738 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4219  phage integrase family protein  26.71 
 
 
463 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  27.76 
 
 
387 aa  74.3  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  24.4 
 
 
391 aa  73.6  0.000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2505  integrase family protein  30.3 
 
 
201 aa  73.9  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.355532 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2797  phage integrase family protein  26.46 
 
 
451 aa  73.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  28.95 
 
 
365 aa  73.6  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2264  integrase family protein  24.72 
 
 
428 aa  73.2  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12232  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  29.95 
 
 
409 aa  73.2  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  24.75 
 
 
388 aa  73.2  0.000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2393  phage integrase family site specific recombinase  25.97 
 
 
412 aa  73.2  0.000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.682709  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  29.39 
 
 
313 aa  73.2  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  29.31 
 
 
384 aa  73.2  0.000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2851  integrase family protein  22.15 
 
 
391 aa  73.2  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3701  integrase family protein  29.24 
 
 
392 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2121  Phage integrase  24.25 
 
 
433 aa  73.2  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  31.09 
 
 
402 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28710  site-specific recombinase XerD  28.94 
 
 
370 aa  71.6  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.870092  normal  0.942592 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  28.51 
 
 
300 aa  71.6  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  27.86 
 
 
397 aa  71.6  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  31.85 
 
 
367 aa  71.6  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  27.14 
 
 
376 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0623  Bbp50  25.66 
 
 
356 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951969  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2315  integrase family protein  25.83 
 
 
255 aa  70.1  0.00000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0961638  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  27.43 
 
 
301 aa  70.1  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2275  integrase  24.66 
 
 
393 aa  70.1  0.00000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  31.09 
 
 
422 aa  70.1  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0457  integrase family protein  31.91 
 
 
487 aa  70.1  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0688  integrase family protein  26.94 
 
 
336 aa  70.1  0.00000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0638  lipoprotein  22.62 
 
 
297 aa  69.7  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.713246  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  24.66 
 
 
401 aa  69.3  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0706  site-specific recombinase, phage integrase family protein  22.62 
 
 
297 aa  69.7  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.76 
 
 
376 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.76 
 
 
376 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0772  phage integrase  29.69 
 
 
304 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  27.4 
 
 
376 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1440  phage integrase family protein  28.72 
 
 
393 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  26.1 
 
 
454 aa  68.2  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>