More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0911 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0911  DNA topoisomerase  100 
 
 
741 aa  1501    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0351  topoisomerase III  40.82 
 
 
719 aa  479  1e-134  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0752  DNA topoisomerase III  38.91 
 
 
701 aa  416  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0611429  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0974  DNA topoisomerase III  34.67 
 
 
799 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0922  DNA topoisomerase III  37.1 
 
 
722 aa  395  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4786  DNA topoisomerase III  36.77 
 
 
729 aa  385  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000176541  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1760  DNA topoisomerase III  35.9 
 
 
731 aa  385  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1489  DNA topoisomerase III  35.44 
 
 
731 aa  385  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1853  DNA topoisomerase III  34.86 
 
 
695 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.989434  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2001  DNA topoisomerase III  35.63 
 
 
721 aa  372  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0468853  normal  0.227685 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1451  DNA topoisomerase III  37.37 
 
 
620 aa  365  2e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000215899  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1822  DNA topoisomerase type IA central domain protein  36.64 
 
 
573 aa  365  2e-99  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6109  DNA topoisomerase III  35.68 
 
 
867 aa  362  1e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0497  DNA topoisomerase  34.8 
 
 
686 aa  355  2e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.167665  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0358  DNA topoisomerase III  32.42 
 
 
729 aa  353  5e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0418  DNA topoisomerase III  33.08 
 
 
729 aa  353  8.999999999999999e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.198302 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0361  DNA topoisomerase III  33.08 
 
 
729 aa  353  8.999999999999999e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0351  DNA topoisomerase III  33.08 
 
 
729 aa  353  8.999999999999999e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0375  DNA topoisomerase III  33.08 
 
 
729 aa  353  8.999999999999999e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0485  DNA topoisomerase III  32.47 
 
 
729 aa  351  2e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0347  DNA topoisomerase III  33.18 
 
 
729 aa  351  3e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4887  DNA topoisomerase III  33.03 
 
 
729 aa  350  8e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0356  DNA topoisomerase III  32.32 
 
 
729 aa  349  1e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0474  DNA topoisomerase III  32.42 
 
 
729 aa  345  1e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0099  DNA topoisomerase III  34.14 
 
 
854 aa  345  1e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1803  DNA topoisomerase III  33.24 
 
 
754 aa  345  2e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0431  DNA topoisomerase III  32.47 
 
 
729 aa  344  4e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128239  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2520  DNA topoisomerase III  33.84 
 
 
697 aa  339  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0349  DNA topoisomerase  37.54 
 
 
689 aa  336  9e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.26912  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3602  DNA topoisomerase III  32.11 
 
 
719 aa  334  3e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.358507  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0272  DNA topoisomerase III  32.68 
 
 
707 aa  334  4e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.369574 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2044  DNA topoisomerase type IA central domain protein  34.72 
 
 
608 aa  330  4e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0995937  hitchhiker  0.00726991 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3176  DNA topoisomerase III  35.13 
 
 
873 aa  331  4e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0104  DNA topoisomerase III  31.88 
 
 
675 aa  328  2.0000000000000001e-88  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000375285 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0018  DNA topoisomerase III  33.02 
 
 
839 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.143927 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3021  DNA topoisomerase  32.43 
 
 
689 aa  327  3e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2289  DNA topoisomerase III  31.48 
 
 
768 aa  327  5e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0229  DNA topoisomerase III  33.42 
 
 
876 aa  327  5e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00108901 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2998  DNA topoisomerase III  34.72 
 
 
939 aa  327  6e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.535221  normal  0.170765 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0396  DNA topoisomerase III  33.67 
 
 
846 aa  325  2e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3223  DNA topoisomerase III  31.25 
 
 
730 aa  325  2e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1341  DNA topoisomerase III  30.68 
 
 
712 aa  324  3e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0265  DNA topoisomerase III  33.33 
 
 
879 aa  324  4e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.948213  normal  0.0296543 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2238  DNA topoisomerase  31.6 
 
 
720 aa  321  1.9999999999999998e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.735062  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1950  DNA topoisomerase  31.6 
 
 
720 aa  321  3e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.419457  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0125  DNA topoisomerase III  32.53 
 
 
891 aa  320  9e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3068  DNA topoisomerase III  32.32 
 
 
865 aa  319  1e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3127  DNA topoisomerase III  32.17 
 
 
865 aa  319  1e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.588519  normal  0.127052 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3955  DNA topoisomerase III  32.72 
 
 
1002 aa  319  1e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.236337  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3185  DNA topoisomerase III  32.32 
 
 
865 aa  319  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0139  DNA topoisomerase III  34.07 
 
 
869 aa  318  3e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.968276  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0343  DNA topoisomerase III  34.07 
 
 
869 aa  318  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0306  DNA topoisomerase III  32.74 
 
 
889 aa  318  3e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4713  DNA topoisomerase III  32.23 
 
 
992 aa  318  3e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000244341  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2271  DNA topoisomerase III  34.07 
 
 
869 aa  318  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2348  DNA topoisomerase III  34.07 
 
 
869 aa  318  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2810  DNA topoisomerase III  34.07 
 
 
869 aa  318  3e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0146  DNA topoisomerase III  34.07 
 
 
869 aa  318  3e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0155  DNA topoisomerase III  34.07 
 
 
906 aa  317  4e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0072  DNA topoisomerase  30.31 
 
 
720 aa  316  9.999999999999999e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0884  DNA topoisomerase III  32.3 
 
 
975 aa  315  1.9999999999999998e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.979089 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4627  DNA topoisomerase III  31.61 
 
 
982 aa  315  1.9999999999999998e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.957836  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6481  DNA topoisomerase III  32.32 
 
 
865 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.987815 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5409  DNA topoisomerase III  29.49 
 
 
714 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4419  DNA topoisomerase III  32.42 
 
 
888 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0873603 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3146  DNA topoisomerase III  32.19 
 
 
865 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186369  normal  0.583492 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2517  DNA topoisomerase III  32.19 
 
 
865 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3130  DNA topoisomerase III  32.19 
 
 
865 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.81773  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1495  DNA topoisomerase III  32.93 
 
 
697 aa  313  1e-83  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0210844 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2322  DNA topoisomerase III  29.47 
 
 
711 aa  312  1e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0191867  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2281  DNA topoisomerase III  29.47 
 
 
711 aa  312  1e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00290966  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0032  DNA topoisomerase III  31.91 
 
 
908 aa  312  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3963  DNA topoisomerase III  32.21 
 
 
990 aa  312  1e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.107223  normal  0.0620528 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0066  DNA topoisomerase III  33.38 
 
 
877 aa  310  4e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3360  DNA topoisomerase III  32.14 
 
 
876 aa  311  4e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.96718  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3339  DNA topoisomerase III  32.08 
 
 
981 aa  310  6.999999999999999e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1836  DNA topoisomerase III  29.92 
 
 
711 aa  310  6.999999999999999e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000000886336  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3683  DNA topoisomerase III  32.14 
 
 
876 aa  309  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5202  DNA topoisomerase III  31.61 
 
 
980 aa  308  3e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221506  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4150  DNA topoisomerase III  34.93 
 
 
670 aa  305  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0356061  normal  0.0728569 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0063  DNA topoisomerase III  34.76 
 
 
730 aa  304  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3412  DNA topoisomerase III  32.6 
 
 
896 aa  304  5.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210579  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3236  DNA topoisomerase  30.61 
 
 
777 aa  304  5.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4319  DNA topoisomerase III  33.77 
 
 
687 aa  304  5.000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.535821  normal  0.574882 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3569  DNA topoisomerase III  32.7 
 
 
891 aa  303  8.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3990  DNA topoisomerase III  31.77 
 
 
981 aa  303  9e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.250381  normal  0.105693 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2081  DNA topoisomerase III  31.04 
 
 
876 aa  303  1e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.795726  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3295  DNA topoisomerase III  35.12 
 
 
655 aa  302  1e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.17428  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2823  DNA topoisomerase III  33.78 
 
 
671 aa  301  2e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172324  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3177  DNA topoisomerase III  32.45 
 
 
920 aa  301  3e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.272894  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1780  DNA topoisomerase III  31.31 
 
 
920 aa  300  5e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.778999 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2624  DNA topoisomerase III  31.9 
 
 
718 aa  298  2e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0990  DNA topoisomerase III  33.58 
 
 
671 aa  298  2e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.585612  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2478  DNA topoisomerase III  35.15 
 
 
662 aa  298  3e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0401  DNA topoisomerase  33.48 
 
 
851 aa  297  5e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0152197  decreased coverage  0.0000578583 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1311  DNA topoisomerase III  33.88 
 
 
670 aa  297  5e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.617817  normal  0.472468 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6523  DNA topoisomerase III  34.36 
 
 
687 aa  296  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.728561  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6614  DNA topoisomerase III  34.36 
 
 
687 aa  296  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.668751  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3364  DNA topoisomerase III  35.22 
 
 
647 aa  295  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1445  DNA topoisomerase III  33.63 
 
 
670 aa  295  2e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.159298  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>