More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0740 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0740  hypothetical protein  100 
 
 		 309 aa  612  9.999999999999999e-175  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000338455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10570  hypothetical protein  42.41 
 
 		 305 aa  195  7e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1830  secretion protein HlyD  36.36 
 
 		 449 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2617  secretion protein HlyD  35.12 
 
 		 385 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000106145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1602  RND family efflux transporter MFP subunit  36.96 
 
 		 641 aa  70.5  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0198  RND family efflux transporter MFP subunit  33.12 
 
 		 521 aa  68.9  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2938  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 444 aa  68.2  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3445  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 401 aa  67.8  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.655677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.51 
 
 		 432 aa  67.4  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0319  RND family efflux transporter MFP subunit  31.65 
 
 		 417 aa  66.6  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4111  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.71 
 
 		 494 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1039  macrolide transporter subunit MacA  32.68 
 
 		 371 aa  65.9  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.184306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2718  macrolide transporter subunit MacA  32.68 
 
 		 371 aa  65.9  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2451  macrolide transporter subunit MacA  32.68 
 
 		 371 aa  65.9  0.0000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00913289  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0982  macrolide transporter subunit MacA  32.68 
 
 		 371 aa  65.9  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.44834  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0951  macrolide transporter subunit MacA  32.68 
 
 		 371 aa  65.9  0.0000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557503  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00883  macrolide transporter subunit, membrane fusion protein (MFP) component  32.68 
 
 		 371 aa  65.9  0.0000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00889  hypothetical protein  32.68 
 
 		 371 aa  65.9  0.0000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2764  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.79 
 
 		 371 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.161658  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3973  RND family efflux transporter MFP subunit  33.52 
 
 		 473 aa  64.7  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.181102 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0653  RND family efflux transporter MFP subunit  28.37 
 
 		 409 aa  64.7  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.356164  normal  0.176029 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3130  secretion protein HlyD  34.44 
 
 		 473 aa  63.9  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.308652  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3483  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.4 
 
 		 598 aa  63.9  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.807091  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2282  macrolide transporter subunit MacA  32.03 
 
 		 371 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000339116  normal  0.0134871 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3642  putative cation efflux system protein cusB precursor  31.46 
 
 		 475 aa  63.2  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.499465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1604  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.92 
 
 		 464 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.344035  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2214  secretion protein HlyD  32.69 
 
 		 382 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.06 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.61066  normal  0.83964 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2322  secretion protein HlyD  29.89 
 
 		 399 aa  60.8  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000756014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1102  secretion protein HlyD  30.62 
 
 		 470 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1339  RND family efflux transporter MFP subunit  34.97 
 
 		 384 aa  60.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1863  RND family efflux transporter MFP subunit  25.44 
 
 		 393 aa  60.1  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2264  secretion protein HlyD  33.33 
 
 		 546 aa  60.1  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2977  RND family efflux transporter MFP subunit  29.5 
 
 		 401 aa  60.5  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.540318  normal  0.494242 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1985  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.1 
 
 		 429 aa  60.1  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7982  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.11 
 
 		 486 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.318672  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4658  secretion protein HlyD  30 
 
 		 478 aa  59.7  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.211901 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1450  RND family efflux transporter MFP subunit  29.33 
 
 		 622 aa  59.3  0.00000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.125039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0412  secretion protein HlyD  32.43 
 
 		 537 aa  58.5  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3548  RND family efflux transporter MFP subunit  28.9 
 
 		 442 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2479  secretion protein HlyD  34.27 
 
 		 504 aa  58.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.518843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2095  secretion protein HlyD  31.25 
 
 		 354 aa  58.2  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1482  RND family efflux transporter MFP subunit  32.43 
 
 		 537 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2704  RND family efflux transporter MFP subunit  32.24 
 
 		 538 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.534684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2466  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.13 
 
 		 396 aa  58.2  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1101  RND family efflux transporter MFP subunit  32.14 
 
 		 414 aa  57.4  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0161  RND family efflux transporter MFP subunit  26.55 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1992  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.05 
 
 		 580 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.491967  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2263  heavy metal efflux pump membrane fusion protein, putative  25.49 
 
 		 422 aa  57  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7080  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.17 
 
 		 416 aa  57  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1695  secretion protein HlyD  30.66 
 
 		 360 aa  57  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4592  RND family efflux transporter MFP subunit  32 
 
 		 477 aa  57  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1759  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.95 
 
 		 457 aa  57  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2220  RND family efflux transporter MFP subunit  25.96 
 
 		 399 aa  57  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1062  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.51 
 
 		 448 aa  56.6  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3274  putative multidrug efflux system transmembrane protein  31.41 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.668414  normal  0.104011 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4405  secretion protein HlyD  31.67 
 
 		 550 aa  56.2  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.164815  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1059  macrolide transporter subunit MacA  30.46 
 
 		 372 aa  56.2  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.75011  normal  0.992508 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0976  macrolide transporter subunit MacA  30.46 
 
 		 372 aa  55.8  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0942  macrolide transporter subunit MacA  30.46 
 
 		 372 aa  55.8  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1039  macrolide transporter subunit MacA  30.46 
 
 		 372 aa  55.8  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  32.64 
 
 		 400 aa  55.8  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0748  putative PAS/PAC sensor protein  34.01 
 
 		 607 aa  55.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3812  RND family efflux transporter MFP subunit  31.46 
 
 		 498 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.999648  normal  0.340628 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2564  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.96 
 
 		 509 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.430144 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2740  secretion protein HlyD  28.09 
 
 		 462 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.135625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2456  hypothetical protein  26.37 
 
 		 431 aa  55.1  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0228  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.74 
 
 		 465 aa  55.8  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  31.01 
 
 		 376 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8877  Membrane-fusion protein-like protein  30.25 
 
 		 598 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0841399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1020  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.96 
 
 		 508 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2325  RND family efflux transporter MFP subunit  30.13 
 
 		 513 aa  54.3  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.757874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1877  RND family efflux transporter MFP subunit  29.63 
 
 		 405 aa  54.7  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0175  hypothetical protein  28.87 
 
 		 380 aa  55.1  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.109936  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.43 
 
 		 537 aa  55.1  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.580159  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3977  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.99 
 
 		 512 aa  54.7  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1617  secretion protein HlyD  30.07 
 
 		 408 aa  53.9  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0160623  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2611  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.02 
 
 		 549 aa  53.9  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  29.93 
 
 		 431 aa  53.9  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00603978  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1671  HlyD family secretion protein  30.07 
 
 		 408 aa  54.3  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  25.53 
 
 		 405 aa  53.9  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0307  RND family efflux transporter MFP subunit  28 
 
 		 413 aa  53.9  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0899354  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1349  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.25 
 
 		 409 aa  53.1  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0580213 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4050  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  28.67 
 
 		 517 aa  53.1  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3185  secretion protein HlyD  26.69 
 
 		 446 aa  53.1  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.67 
 
 		 377 aa  53.1  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1008  macrolide transporter subunit MacA  29.8 
 
 		 372 aa  52.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.622007  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1666  RND family efflux transporter MFP subunit  28.68 
 
 		 368 aa  52.8  0.000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4041  hypothetical protein  28.29 
 
 		 366 aa  52.8  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0513022 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2454  RND family efflux transporter MFP subunit  32.65 
 
 		 393 aa  52.8  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3171  RND family efflux transporter MFP subunit  28.11 
 
 		 416 aa  52.4  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000224755  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2603  secretion protein HlyD  29.63 
 
 		 389 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.22725  normal  0.133946 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3427  cation efflux system protein cusB precursor  28.25 
 
 		 474 aa  51.6  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0753  secretion protein HlyD  31.46 
 
 		 370 aa  52  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1571  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.29 
 
 		 435 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.334008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0364  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.34 
 
 		 362 aa  52.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.405995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0739  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.82 
 
 		 362 aa  52.4  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.941037  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06365  hypothetical protein  28.74 
 
 		 577 aa  52  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4832  RND family efflux transporter MFP subunit  29.83 
 
 		 472 aa  52.4  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0873289 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  28.89 
 
 		 409 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000285815  normal  0.0164702 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>