More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0693 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0693  ApbE family lipoprotein  100 
 
 
379 aa  743    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  37.3 
 
 
360 aa  217  2e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  39.56 
 
 
353 aa  214  2.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  39 
 
 
348 aa  207  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  34.11 
 
 
381 aa  207  3e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  34.36 
 
 
380 aa  202  9e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  43.54 
 
 
363 aa  199  9e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  35.74 
 
 
350 aa  191  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  35.33 
 
 
345 aa  191  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  37.62 
 
 
308 aa  187  3e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000198345  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  33.22 
 
 
339 aa  186  5e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  33.22 
 
 
342 aa  181  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  32.49 
 
 
366 aa  181  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21260  thiamine biosynthesis lipoprotein  36.75 
 
 
306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0350  ApbE family lipoprotein  37.54 
 
 
339 aa  179  7e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  30.77 
 
 
343 aa  178  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  36.5 
 
 
336 aa  177  3e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2654  ApbE family lipoprotein  37.62 
 
 
326 aa  171  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.131589 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05200  thiamine biosynthesis lipoprotein  37.68 
 
 
332 aa  169  8e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.666118  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  37.95 
 
 
371 aa  161  2e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2215  ApbE family lipoprotein  31.43 
 
 
330 aa  158  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0332053  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00140  thiamine biosynthesis lipoprotein  34.05 
 
 
313 aa  157  2e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.594186 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21060  thiamine biosynthesis lipoprotein  36.36 
 
 
320 aa  158  2e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1217  membrane-associated lipoprotein for thiamine biosynthesis  28.12 
 
 
361 aa  156  5.0000000000000005e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000151125  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  35.56 
 
 
351 aa  156  6e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  39.17 
 
 
349 aa  152  7e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  38.75 
 
 
349 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3494  ApbE family lipoprotein  34.31 
 
 
323 aa  151  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.960386  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3569  membrane protein  34.18 
 
 
336 aa  150  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2557  ApbE family lipoprotein  35.23 
 
 
321 aa  149  7e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0513612 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  34.83 
 
 
355 aa  149  9e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2093  ApbE family lipoprotein  31.09 
 
 
333 aa  145  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.11656e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  32.6 
 
 
317 aa  144  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1461  ApbE family lipoprotein  33.82 
 
 
345 aa  144  3e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  35.53 
 
 
386 aa  143  5e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5637  ApbE-like lipoprotein, membrane-associated lipoprotein involved in thiamine biosynthesis  37.04 
 
 
337 aa  143  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3758  ApbE family lipoprotein  29.37 
 
 
316 aa  143  6e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.390614  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2624  ApbE family lipoprotein  32.82 
 
 
323 aa  142  7e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2326  ApbE family protein  39.33 
 
 
352 aa  142  7e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.211712  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0976  ApbE family lipoprotein  34.09 
 
 
346 aa  142  8e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.402435  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1244  ApbE family lipoprotein  31.82 
 
 
348 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0936  ApbE family lipoprotein  33.33 
 
 
349 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0317624  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  36.97 
 
 
350 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  33.47 
 
 
349 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0996  ApbE family protein  39.33 
 
 
352 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.167823  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2113  ApbE family protein  39.33 
 
 
352 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2253  ApbE family protein  39.33 
 
 
291 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2058  ApbE family protein  39.33 
 
 
370 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.673444  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3125  ApbE family lipoprotein  33.98 
 
 
325 aa  140  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.779525  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1081  ApbE family protein  27.8 
 
 
312 aa  140  4.999999999999999e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0283392  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  34.07 
 
 
336 aa  139  6e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0788  thiamine biosynthesis lipoprotein  34.67 
 
 
297 aa  139  7.999999999999999e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  28.25 
 
 
328 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0541  ApbE family lipoprotein  30.88 
 
 
343 aa  138  1e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00751  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  33.47 
 
 
350 aa  138  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.182367  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2350  ApbE family lipoprotein  31.34 
 
 
323 aa  138  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  30.13 
 
 
350 aa  138  2e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1597  ApbE family lipoprotein  32.22 
 
 
308 aa  138  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1601  thiamine biosynthesis membrane-associated lipoprotein  26.46 
 
 
358 aa  138  2e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1717  ApbE family lipoprotein  31 
 
 
337 aa  137  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.0292335 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14650  thiamine biosynthesis lipoprotein  31.98 
 
 
337 aa  137  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0353  ApbE family lipoprotein  32.2 
 
 
350 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315811  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  26.26 
 
 
335 aa  137  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2563  ApbE family lipoprotein  33.71 
 
 
329 aa  136  7.000000000000001e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0982  ApbE family lipoprotein  36.82 
 
 
353 aa  135  9.999999999999999e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5212  ApbE-like lipoprotein  35.17 
 
 
335 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1160  thiamine biosynthesis lipoprotein  35.57 
 
 
337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483438  normal  0.262417 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0129  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  30.34 
 
 
361 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.791974  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3727  thiamine biosynthesis protein  37 
 
 
345 aa  133  5e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2875  ApbE family lipoprotein  32.47 
 
 
338 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3418  ApbE-like lipoprotein  31.17 
 
 
343 aa  132  7.999999999999999e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.999205 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5054  ApbE family lipoprotein  34.38 
 
 
362 aa  132  7.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.288464  normal  0.124828 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2411  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE, putative  35.89 
 
 
310 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.39462  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05540  hypothetical protein  31.44 
 
 
323 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  33.58 
 
 
344 aa  132  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3425  ApbE family lipoprotein  32.84 
 
 
338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0264  ApbE family lipoprotein  28.68 
 
 
320 aa  130  3e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.398879  normal  0.351019 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  34.07 
 
 
336 aa  130  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2771  ApbE family lipoprotein  29.17 
 
 
354 aa  130  5.0000000000000004e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3147  twin-arginine translocation pathway signal  35.42 
 
 
344 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  34.87 
 
 
331 aa  129  6e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3097  ApbE family lipoprotein  33.05 
 
 
338 aa  130  6e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2363  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  31 
 
 
351 aa  129  8.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643512  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3611  ApbE family lipoprotein  32.76 
 
 
338 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0092  ApbE family lipoprotein  33.33 
 
 
308 aa  129  9.000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0025456  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1569  ApbE family protein  35.04 
 
 
306 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.339212  normal  0.0160978 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3233  ApbE family lipoprotein  35.37 
 
 
344 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000188784  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1484  ApbE family lipoprotein  33.21 
 
 
369 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0759035 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1803  thiamine biosynthesis lipoprotein  31.7 
 
 
349 aa  128  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4057  ApbE family lipoprotein  39.3 
 
 
346 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.807087  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1563  carboxynorspermidine decarboxylase  29.93 
 
 
312 aa  127  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4169  ApbE family lipoprotein  39.3 
 
 
346 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2232  ApbE family lipoprotein  31.42 
 
 
341 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02141  predicted thiamine biosynthesis lipoprotein  30.63 
 
 
351 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.912657  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1444  ApbE family lipoprotein  30.63 
 
 
351 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.116267  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02100  hypothetical protein  30.63 
 
 
351 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.873608  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1436  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  30.63 
 
 
351 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.208237 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3352  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  30.63 
 
 
351 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0822228  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2513  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  30.63 
 
 
351 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00204686  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2816  ApbE-like lipoprotein  33.47 
 
 
338 aa  126  5e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>