13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0634 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0634  O-antigen polymerase  100 
 
 		 415 aa  818    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.60095 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2022  O-antigen polymerase  28.77 
 
 		 340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2741  O-antigen polymerase  28.96 
 
 		 333 aa  131  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.448774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4567  O-antigen polymerase  26.98 
 
 		 717 aa  52.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.79744  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3696  O-antigen polymerase  26.89 
 
 		 461 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4579  O-antigen polymerase  31.31 
 
 		 448 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.17078 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0462  polysaccharide polymerase, putative  21.21 
 
 		 391 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000183254  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3094  O-antigen polymerase  27.45 
 
 		 444 aa  45.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1764  O-antigen polymerase  31.25 
 
 		 560 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5667  putative O-antigen ligase  30.43 
 
 		 427 aa  44.3  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304337  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2338  O-antigen polymerase  24.18 
 
 		 425 aa  43.5  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0582  O-antigen polymerase  28.07 
 
 		 454 aa  43.1  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.814347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3437  O-antigen polymerase  31.94 
 
 		 456 aa  43.1  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000533693  normal  0.14602 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>