58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0430 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0430  ATP-binding region ATPase domain protein  100 
 
 
313 aa  623  1e-177  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  1.57774e-05 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2346  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  24.35 
 
 
609 aa  88.6  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.600899 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0499  sensor histidine kinase  20.85 
 
 
431 aa  85.1  1e-15  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  2.46195e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2269  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  23.11 
 
 
442 aa  81.6  2e-14  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0487  sensor histidine kinase  20.43 
 
 
431 aa  80.1  5e-14  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0885624  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1601  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.45 
 
 
446 aa  79.3  7e-14  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00658825  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2424  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.27 
 
 
423 aa  79  1e-13  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1751  sensor histidine kinase VirS  20.64 
 
 
440 aa  76.6  5e-13  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0035916  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2647  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  24.54 
 
 
426 aa  74.7  2e-12  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1481  sensor histidine kinase VirS  20.74 
 
 
441 aa  74.3  2e-12  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  1.61061e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2641  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25.1 
 
 
423 aa  73.6  4e-12  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2401  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  24.9 
 
 
456 aa  73.6  4e-12  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.283788  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1814  ATP-binding region ATPase domain protein  30.54 
 
 
614 aa  70.5  4e-11  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.211625  normal  0.35963 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0582  signal transduction protein  23.3 
 
 
431 aa  68.6  1e-10  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3117  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  23.1 
 
 
342 aa  67.8  2e-10  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.853672  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2545  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  23.92 
 
 
361 aa  62.4  8e-09  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.290644  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0032  histidine kinase-related ATPase, putative  25.17 
 
 
248 aa  60.1  5e-08  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  7.37644e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0469  ATP-binding region ATPase domain protein  26.29 
 
 
444 aa  58.5  1e-07  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3688  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  22.22 
 
 
280 aa  57.4  3e-07  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1870  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  24.17 
 
 
470 aa  57.4  3e-07  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  3.1179e-08  normal  0.169965 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02250  histidine kinase  26.61 
 
 
450 aa  56.2  6e-07  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0975  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  21.56 
 
 
242 aa  56.2  8e-07  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2258  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  37.61 
 
 
542 aa  55.8  1e-06  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0498367  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4399  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.73 
 
 
525 aa  52.8  8e-06  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262296  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4243  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.73 
 
 
525 aa  52.4  1e-05  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0209492  normal  0.158943 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4177  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.73 
 
 
525 aa  52.4  1e-05  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0530735  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0904  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25.71 
 
 
241 aa  50.1  5e-05  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0401  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  21.58 
 
 
479 aa  49.7  6e-05  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0745  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25.65 
 
 
460 aa  49.7  7e-05  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0516  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  38.4 
 
 
551 aa  49.3  8e-05  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.494756  normal  0.0577704 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3869  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.21 
 
 
540 aa  49.3  9e-05  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0780654  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4697  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.72 
 
 
527 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.269439  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1622  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25.74 
 
 
275 aa  48.9  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0511  sensor histidine kinase  18.1 
 
 
516 aa  48.5  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0500  sensor histidine kinase  18.55 
 
 
516 aa  47.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2898  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.15 
 
 
553 aa  47.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01630  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  24.87 
 
 
325 aa  47.4  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2337  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.08 
 
 
564 aa  46.6  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139979  normal  0.523633 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4414  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.48 
 
 
558 aa  46.6  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0183  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.79 
 
 
390 aa  46.6  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0385  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  21.95 
 
 
280 aa  46.2  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  34.13 
 
 
396 aa  46.2  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2036  ATP-binding region ATPase domain protein  30 
 
 
536 aa  45.4  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1492  accessory gene regulator protein C  21.7 
 
 
429 aa  45.8  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.108947  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3188  histidine kinase  35.14 
 
 
456 aa  45.4  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10722  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1089  histidine kinase  29.56 
 
 
353 aa  44.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0982705 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1875  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  23.75 
 
 
501 aa  44.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3596  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.64 
 
 
519 aa  44.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1175  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.88 
 
 
412 aa  44.3  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0245607  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.88 
 
 
412 aa  43.9  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  3.97625e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2258  cyclic nucleotide-binding protein  27.7 
 
 
487 aa  43.9  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 
633 aa  44.3  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.20984  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2914  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 
533 aa  43.5  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1598  histidine kinase  27.7 
 
 
487 aa  43.1  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0186  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 
476 aa  43.1  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1839  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 
423 aa  42.7  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00841086  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37840  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.15 
 
 
527 aa  42.4  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.183307 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3198  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  23.08 
 
 
456 aa  42.4  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  7.28956e-05 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>