183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0369 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0369  N-6 DNA methylase  100 
 
 
764 aa  1528    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2908  N-6 DNA methylase  29.86 
 
 
523 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1086  type I restriction-modification system, M subunit  27.4 
 
 
576 aa  108  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0005  type I restriction-modification system, M subunit  29.12 
 
 
528 aa  108  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3128  N-6 DNA methylase  30.71 
 
 
518 aa  107  9e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.465456  decreased coverage  0.00982418 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0224  Type I restriction-modification system, M subunit  27.17 
 
 
519 aa  105  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2743  type I restriction system adenine methylase  30.07 
 
 
518 aa  102  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0483  N-6 DNA methylase  27.42 
 
 
568 aa  102  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0283562  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2789  N-6 DNA methylase  29.86 
 
 
532 aa  102  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0039  N-6 DNA methylase  28.25 
 
 
501 aa  102  3e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.250679  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0019  N-6 DNA methylase  28.25 
 
 
501 aa  101  4e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00151011 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1940  N-6 DNA methylase  26.86 
 
 
535 aa  101  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0625168  normal  0.0625802 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12769  type I restriction/modification system DNA methylase hsdM  28.72 
 
 
540 aa  101  6e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2453  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  27.74 
 
 
538 aa  100  8e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.53896  normal  0.845275 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1858  N-6 DNA methylase  28.33 
 
 
540 aa  100  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1539  type I restriction-modification system, M subunit  27.18 
 
 
500 aa  99.8  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000154488  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4240  N-6 DNA methylase  27.83 
 
 
567 aa  99  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.386659  hitchhiker  0.00142847 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2017  N-6 DNA methylase  29.75 
 
 
517 aa  98.6  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.54323  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2509  site-specific DNA-methyltransferase  27.76 
 
 
540 aa  98.2  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.642426 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3758  N-6 DNA methylase  27.64 
 
 
511 aa  97.1  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.921564  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0034  N-6 DNA methylase  27.16 
 
 
544 aa  97.1  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.966218 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4777  N-6 DNA methylase  27.53 
 
 
517 aa  97.1  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.797401  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1102  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  29.18 
 
 
548 aa  96.3  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.358797  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3006  N-6 DNA methylase  30.36 
 
 
520 aa  95.5  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.809429  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0032  N-6 DNA methylase  28.62 
 
 
544 aa  95.1  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.885751  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1096  N-6 DNA methylase  30.18 
 
 
543 aa  94.7  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0286  N4/N6-methyltransferase family protein  26.42 
 
 
569 aa  93.2  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3915  N-6 DNA methylase  29.39 
 
 
541 aa  91.3  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2418  N-6 DNA methylase  28.07 
 
 
525 aa  90.5  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.572428  normal  0.0719197 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1409  N-6 DNA methylase  33.57 
 
 
698 aa  90.1  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2793  type I restriction-modification system, M subunit  28.07 
 
 
525 aa  90.5  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4473  N-6 DNA methylase  27.1 
 
 
567 aa  89  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.844286 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0961  N-6 DNA methylase  34.8 
 
 
677 aa  89  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3148  N-6 DNA methylase  27.84 
 
 
540 aa  89  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.303766 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2248  N-6 DNA methylase  27.91 
 
 
521 aa  89.4  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0522014  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0869  N-6 DNA methylase  27.64 
 
 
510 aa  89  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1349  putative type I restriction system adenine methylase  30.43 
 
 
558 aa  88.6  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1644  N-6 DNA methylase  26.5 
 
 
498 aa  88.6  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0286  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  26.15 
 
 
497 aa  88.6  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1120  type I restriction-modification system specificity subunit  26.33 
 
 
527 aa  87.8  7e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1222  N-6 DNA methylase  25.52 
 
 
519 aa  87.4  9e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3380  N-6 DNA methylase  24.5 
 
 
570 aa  86.7  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.368642  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0261  hypothetical protein  30.62 
 
 
680 aa  85.9  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.746292  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0036  type I restriction enzyme  23.87 
 
 
510 aa  85.1  0.000000000000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.27058  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3080  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  28 
 
 
549 aa  85.1  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.801077 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1917  N-6 DNA methylase  33.91 
 
 
673 aa  84.7  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00444003  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4006  N-6 DNA methylase  26.21 
 
 
514 aa  83.2  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2909  N4/N6-methyltransferase family protein  23.97 
 
 
515 aa  82.8  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3767  N-6 DNA methylase  26.32 
 
 
564 aa  82.8  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0877  putative type I restriction-modification system, M subunit  24.21 
 
 
529 aa  81.6  0.00000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.528701 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  25.45 
 
 
503 aa  81.3  0.00000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3354  type I restriction-modification system, M subunit  27.78 
 
 
528 aa  80.9  0.00000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.501947  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1809  hypothetical protein  25.47 
 
 
849 aa  80.5  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7556  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  25.07 
 
 
544 aa  80.1  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1359  N-6 DNA methylase  22.89 
 
 
529 aa  78.2  0.0000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1580  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  36.97 
 
 
636 aa  77  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3300  N-6 DNA methylase  26.57 
 
 
537 aa  76.6  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000500405 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2033  N-6 DNA methylase  32.82 
 
 
775 aa  73.9  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.599209  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0988  N-6 DNA methylase  26.89 
 
 
527 aa  73.2  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3440  N-6 DNA methylase  24.91 
 
 
629 aa  72.8  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000836739  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1104  type I restriction-modification system, M subunit  28.62 
 
 
519 aa  72.4  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1915  type I restriction-modification system, M subunit  25.72 
 
 
853 aa  72.4  0.00000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.93858  hitchhiker  0.00587021 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5009  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  28.83 
 
 
860 aa  71.6  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.235997 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0850  N-6 DNA methylase  36.36 
 
 
675 aa  71.6  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.149563 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4931  type I restriction-modification system, M subunit  22.9 
 
 
539 aa  71.2  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.748503  normal  0.593383 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0821  type I restriction-modification system, M subunit  28.97 
 
 
515 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1545  type I restriction-modification system, M subunit  24.91 
 
 
522 aa  70.1  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.648114  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03120  type I restriction system adenine methylase HsdM  26.02 
 
 
856 aa  69.7  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0118515  hitchhiker  7.147270000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3470  type I restriction-modification system, M subunit  28.63 
 
 
523 aa  68.6  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1637  N-6 DNA methylase  28.42 
 
 
625 aa  68.6  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.579596 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2472  type I restriction-modification system, M subunit  24.48 
 
 
518 aa  67.8  0.0000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0275864  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1850  type I restriction-modification system, M subunit  26.87 
 
 
489 aa  68.2  0.0000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1860  type I restriction-modification system, M subunit  23.3 
 
 
518 aa  67.8  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.876278  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1895  type I restriction-modification system, M subunit  23.3 
 
 
518 aa  67.8  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.646372  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0454  type I restriction-modification system, M subunit  23.3 
 
 
518 aa  67.8  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0466  type I restriction-modification system, M subunit  23.3 
 
 
518 aa  67.8  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01115  type I restriction-modification system, methyltransferase subunit  25.48 
 
 
862 aa  67.8  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2725  type I restriction-modification system, M subunit  22.07 
 
 
525 aa  67.4  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3954  type I restriction-modification system, M subunit  24.9 
 
 
525 aa  67  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1499  type I restriction-modification system, M subunit  26.38 
 
 
521 aa  66.6  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.1762  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0753  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  23.65 
 
 
534 aa  66.2  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0079  type I restriction-modification system, M subunit  27.6 
 
 
520 aa  66.6  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  24.74 
 
 
495 aa  66.2  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0505  type I restriction-modification system, M subunit  27.88 
 
 
524 aa  66.2  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2731  N-6 DNA methylase  36.42 
 
 
626 aa  65.9  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.427246 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0942  Type I restriction-modification system M subunit  25.94 
 
 
495 aa  65.5  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2689  N-6 DNA methylase  34.88 
 
 
709 aa  65.5  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.227134 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0990  type I restriction-modification system, M subunit  23.88 
 
 
501 aa  65.1  0.000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.555022  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4458  type I restriction-modification system, M subunit  31.25 
 
 
863 aa  64.7  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2274  type I restriction-modification system DNA methylase  25.06 
 
 
527 aa  64.3  0.000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1959  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  26.64 
 
 
855 aa  64.3  0.000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2253  type I restriction-modification system, M subunit  26.8 
 
 
523 aa  64.3  0.000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.475184  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1843  type I restriction-modification system, M subunit  25.1 
 
 
554 aa  63.5  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  25.63 
 
 
574 aa  63.5  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0614  type I restriction-modification system, M subunit  25.78 
 
 
494 aa  63.5  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0763672  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0952  type I restriction-modification system, M subunit  24.54 
 
 
809 aa  63.5  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000609916 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4162  type I restriction-modification system, M subunit  32.05 
 
 
874 aa  63.2  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.235487 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4082  type I restriction-modification system, M subunit  31.94 
 
 
863 aa  62.8  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  25 
 
 
585 aa  62.4  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3672  type I restriction-modification system, M subunit  30.46 
 
 
910 aa  62.4  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>