More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0328 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0328  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 
323 aa  659    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1770  transcriptional regulator, AraC family  40.65 
 
 
320 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0308  transcriptional regulator, AraC family  34.62 
 
 
324 aa  139  7.999999999999999e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0162295  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0304  transcriptional regulator, AraC family  31.54 
 
 
336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0920  AraC family transcriptional regulator  24.66 
 
 
313 aa  109  8.000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0175793  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0626  AraC family transcriptional regulator  26.84 
 
 
330 aa  108  2e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.653952  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0706  transcriptional regulator, AraC family  26.47 
 
 
330 aa  97.8  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0374737  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1482  transcriptional regulator, AraC family  32.89 
 
 
345 aa  95.5  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  33.88 
 
 
331 aa  84  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2415  transcriptional regulator, AraC family  27.35 
 
 
368 aa  83.2  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.125553 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2680  transcriptional regulator, AraC family  26.64 
 
 
329 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3170  transcriptional regulator, AraC family  36.54 
 
 
332 aa  79.3  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.777646  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  38.46 
 
 
304 aa  77.8  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 
299 aa  77.4  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3316  helix-turn-helix domain-containing protein  32.59 
 
 
330 aa  77  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.606896  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  36.48 
 
 
322 aa  76.6  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2225  AraC family transcriptional regulator  31.45 
 
 
337 aa  76.3  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.120601  normal  0.705003 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0771  AraC family transcriptional regulator  38.05 
 
 
288 aa  75.1  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.472166 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  32.67 
 
 
537 aa  75.5  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  38.54 
 
 
513 aa  74.7  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2365  transcriptional regulator, AraC family  29.68 
 
 
317 aa  74.3  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.417221  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6795  transcriptional regulator, AraC family  36.11 
 
 
306 aa  74.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.312804  hitchhiker  0.00000309577 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4346  transcriptional regulator, AraC family  28.93 
 
 
326 aa  73.9  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324951  normal  0.0157196 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3159  AraC family transcriptional regulator  32.67 
 
 
296 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  33.99 
 
 
304 aa  73.2  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0937  transcriptional regulator, AraC family  37.96 
 
 
291 aa  73.2  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127184  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0125  transcriptional regulator, AraC family  25.85 
 
 
300 aa  72.8  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4032  transcriptional regulator, AraC family  34.48 
 
 
283 aa  72.8  0.000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1432  transcriptional regulator, AraC family  24.45 
 
 
387 aa  72.8  0.000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.185359  normal  0.618503 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2212  AraC family transcriptional regulator  28.03 
 
 
302 aa  72.8  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4400  AraC family transcriptional regulator  34.48 
 
 
283 aa  72.8  0.000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.370971  normal  0.467233 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03839  predicted DNA-binding transcriptional regulator  34.48 
 
 
283 aa  72.4  0.000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4062  AraC family transcriptional regulator  34.48 
 
 
283 aa  72.4  0.000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4492  AraC family transcriptional regulator  34.48 
 
 
283 aa  72.4  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.494011  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03788  hypothetical protein  34.48 
 
 
283 aa  72.4  0.000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4188  AraC family transcriptional regulator  34.48 
 
 
283 aa  72.4  0.000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5413  transcriptional regulator, AraC family  34.48 
 
 
283 aa  72.4  0.000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0895  AraC family transcriptional regulator  27.78 
 
 
315 aa  72.4  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0923  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 
331 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147864  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1205  AraC family transcriptional regulator  33.06 
 
 
440 aa  71.6  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.909691  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  34.19 
 
 
299 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2157  two component AraC family transcriptional regulator  38.68 
 
 
250 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0322408 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1472  AraC family transcriptional regulator  29.51 
 
 
292 aa  71.2  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.327977  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0210  AraC family transcriptional regulator  36.21 
 
 
274 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1250  AraC family transcriptional regulator  38.39 
 
 
263 aa  71.6  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3532  AraC family transcriptional regulator  31.13 
 
 
320 aa  71.6  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0113977 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2168  transcriptional regulator, AraC family  28.05 
 
 
325 aa  71.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2634  DNA-binding transcriptional regulator AraC  32.69 
 
 
294 aa  71.2  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0737  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  34.58 
 
 
290 aa  70.9  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.359471  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0401  transcriptional regulator, AraC family  36.63 
 
 
310 aa  71.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  29.65 
 
 
303 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4087  two component transcriptional regulator, AraC family  34.04 
 
 
350 aa  70.9  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2123  AraC family transcriptional regulator  38.61 
 
 
287 aa  70.9  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.184363  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  34.74 
 
 
515 aa  70.5  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1602  transcriptional regulator  35.29 
 
 
330 aa  70.5  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1906  putative transcriptional regulator  39.25 
 
 
254 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  32.54 
 
 
316 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3497  AraC family transcriptional regulator  28.76 
 
 
198 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.27794  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0540  transcriptional regulator, AraC family  32.35 
 
 
289 aa  69.7  0.00000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29140  response regulator containing CheY-like receiver domain and AraC-type DNA-binding domain  37 
 
 
279 aa  69.3  0.00000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3840  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  26.8 
 
 
198 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0066  DNA-binding transcriptional regulator AraC  29.23 
 
 
281 aa  69.3  0.00000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.269311  normal  0.445846 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1714  AraC-type transcriptional regulator-like protein  35 
 
 
289 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00197834  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2890  transcriptional regulator, AraC family  29.29 
 
 
300 aa  69.3  0.00000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.178075  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00066  DNA-binding transcriptional dual regulator  29.23 
 
 
292 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3535  transcriptional regulator, AraC family  29.23 
 
 
292 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2411  transcriptional regulator, AraC family  27.15 
 
 
333 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.382897  normal  0.850127 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3088  AraC family transcriptional regulator  33.66 
 
 
296 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.530109  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1197  transcriptional regulator, AraC family  27.34 
 
 
335 aa  68.9  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00505676  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2907  transcriptional regulator, AraC family  40.57 
 
 
289 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0560618  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 
291 aa  68.9  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0069  DNA-binding transcriptional regulator AraC  29.23 
 
 
309 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0068  DNA-binding transcriptional regulator AraC  29.23 
 
 
292 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0056  DNA-binding transcriptional regulator AraC  29.23 
 
 
292 aa  68.6  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00065  hypothetical protein  29.23 
 
 
292 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22580  AraC family transcriptional regulator  38.32 
 
 
254 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000567306  hitchhiker  0.000118862 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2339  AraC family transcriptional regulator  34.29 
 
 
303 aa  68.6  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.295664 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  35.78 
 
 
1201 aa  68.9  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0071  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 
288 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0066  DNA-binding transcriptional regulator AraC  29.23 
 
 
292 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3593  DNA-binding transcriptional regulator AraC  29.23 
 
 
292 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.50445  hitchhiker  0.000000316606 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4445  AraC family transcriptional regulator  32.76 
 
 
278 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00788504 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1528  AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 
284 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1459  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  26.8 
 
 
198 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000164097 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4327  transcriptional regulator, AraC family protein  32.76 
 
 
278 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3508  AraC family transcriptional regulator  26.14 
 
 
196 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0210792  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2556  AraC-like transcriptional regulator  33.33 
 
 
297 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.496188  normal  0.238367 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4358  transcriptional regulator, AraC family protein  32.76 
 
 
278 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0589  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 
335 aa  67.8  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.564804  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4522  AraC family transcriptional regulator  32.76 
 
 
283 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000425632 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2401  transcriptional regulator, AraC family  34.31 
 
 
202 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4448  AraC family transcriptional regulator  32.76 
 
 
283 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.172214 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0611  DNA-binding transcriptional regulator AraC  29.23 
 
 
280 aa  68.2  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.88985  normal  0.0110602 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5008  putative transcriptional regulator  38.38 
 
 
332 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  31.21 
 
 
311 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0108  DNA-binding transcriptional regulator AraC  29.23 
 
 
281 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0115  DNA-binding transcriptional regulator AraC  29.23 
 
 
281 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3197  DNA-binding transcriptional regulator AraC  30.1 
 
 
325 aa  67.4  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0504834 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2581  AraC family transcriptional regulator  25.74 
 
 
319 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0247972  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4321  helix-turn-helix domain-containing protein  28.3 
 
 
357 aa  67.8  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>