More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0311 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0311  ABC transporter related  100 
 
 
490 aa  966    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00385444  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  39.29 
 
 
490 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1484  ABC transporter related  43.39 
 
 
471 aa  322  9.999999999999999e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  42.64 
 
 
495 aa  320  5e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0419  ABC transporter ATPase  40.97 
 
 
537 aa  317  4e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00765157  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25730  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  39.21 
 
 
479 aa  311  2e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4772  ABC transporter related  40.09 
 
 
500 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  36.01 
 
 
489 aa  293  4e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0315  ABC transporter related  44.83 
 
 
491 aa  286  5e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  37.81 
 
 
493 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0906  ABC transporter, ATP-binding protein  33.55 
 
 
491 aa  285  1.0000000000000001e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.464739  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2158  ABC transporter, ATP-binding protein  33.94 
 
 
502 aa  285  1.0000000000000001e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0430843  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0900  ABC transporter, ATP-binding protein  35.12 
 
 
474 aa  283  6.000000000000001e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.318753  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1598  ABC transporter, ATP-binding protein  32.47 
 
 
502 aa  282  8.000000000000001e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0331  ABC transporter related  41.03 
 
 
497 aa  282  1e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2305  ABC transporter related  40.16 
 
 
510 aa  281  2e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3087  ABC transporter related  39.11 
 
 
498 aa  280  3e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0679  Sigma 54 interacting domain protein  30.72 
 
 
463 aa  278  2e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0243  ABC transporter, ATP-binding protein  33.63 
 
 
491 aa  277  3e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0255  ABC transporter, ATP-binding protein  34.04 
 
 
474 aa  276  7e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0324  ABC transporter related  40.35 
 
 
493 aa  273  4.0000000000000004e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2622  ABC transporter, ATP-binding protein  33.76 
 
 
470 aa  270  4e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.42 
 
 
1091 aa  266  5.999999999999999e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2320  ABC transporter related  41.95 
 
 
514 aa  264  2e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.896424 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1494  ABC transporter related  37.56 
 
 
482 aa  262  8e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0334764  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23160  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  37.83 
 
 
473 aa  262  1e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.452104 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1603  ABC transporter, ATP-binding protein  35.96 
 
 
481 aa  256  7e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1434  ABC transporter related  40.2 
 
 
516 aa  256  7e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.305942  normal  0.80431 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0379  ABC transporter related  36.74 
 
 
464 aa  248  2e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4172  ABC transporter related  40.77 
 
 
490 aa  245  9.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00812866  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4598  ABC transporter related  40.23 
 
 
494 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0433816 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  35.05 
 
 
541 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  34.36 
 
 
501 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  32.99 
 
 
531 aa  229  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2424  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  28.83 
 
 
566 aa  220  6e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000216919  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2658  ABC transporter, ATP-binding protein  28.63 
 
 
566 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828131 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2668  ABC transporter, ATP-binding protein  28.31 
 
 
566 aa  218  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0711129  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  29.47 
 
 
605 aa  218  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2709  ABC transporter, ATP-binding protein  28.6 
 
 
566 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2641  ABC transporter ATP-binding protein  28.6 
 
 
566 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2385  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  28.43 
 
 
566 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0597  ABC transporter-related protein  34.77 
 
 
509 aa  212  1e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2461  ABC transporter ATP-binding protein  28.4 
 
 
566 aa  211  3e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000483746  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1046  ABC transporter related  30.33 
 
 
564 aa  210  4e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2499  ABC transporter related  28.16 
 
 
566 aa  209  7e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  32.86 
 
 
810 aa  209  7e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  32.49 
 
 
534 aa  208  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4124  ABC transporter related  33.87 
 
 
526 aa  206  5e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000316959 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  30.94 
 
 
568 aa  206  8e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1540  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  27.14 
 
 
562 aa  206  1e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.20129  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07510  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  33.7 
 
 
495 aa  205  1e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.568441 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3337  ABC transporter, ATP-binding protein  29.8 
 
 
551 aa  204  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2658  ABC transporter, ATP-binding protein  27.4 
 
 
566 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.558604  hitchhiker  0.000000784356 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  27.12 
 
 
574 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  34 
 
 
510 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2666  ABC transporter, ATP-binding protein  26.53 
 
 
566 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0347  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  28.8 
 
 
568 aa  201  3.9999999999999996e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  31.29 
 
 
497 aa  200  5e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  31.56 
 
 
553 aa  199  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  30.12 
 
 
557 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5273  ABC transporter related  37.5 
 
 
488 aa  196  7e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5362  ABC transporter related  37.5 
 
 
488 aa  196  7e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.529783  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2689  ABC transporter related protein  29.39 
 
 
530 aa  196  8.000000000000001e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  31.8 
 
 
571 aa  196  8.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3041  ABC transporter related  29.69 
 
 
553 aa  195  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0282297  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4400  ABC transporter related  32.55 
 
 
543 aa  194  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  0.828936 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0090  ABC transporter related  35.71 
 
 
574 aa  194  3e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0101014  normal  0.484977 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3105  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  30 
 
 
551 aa  194  4e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3317  ABC transporter, ATP-binding protein  29.22 
 
 
551 aa  193  5e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5652  ABC transporter related  37.93 
 
 
488 aa  193  5e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125126  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3364  ABC transporter ATP-binding protein  29.8 
 
 
551 aa  193  7e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.499953  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3118  ABC transporter ATP-binding protein  29.8 
 
 
553 aa  192  8e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209268  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1835  putative cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  26.38 
 
 
568 aa  192  9e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1555  ABC transporter  26.58 
 
 
568 aa  192  1e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100882  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  27.81 
 
 
518 aa  192  1e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001242  ABC transporter ATP-binding protein  29.98 
 
 
579 aa  192  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0259  hypothetical protein  30.91 
 
 
469 aa  191  2e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  29.61 
 
 
551 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8788  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  33.83 
 
 
550 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3008  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  29.41 
 
 
553 aa  190  5e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  28.63 
 
 
568 aa  189  9e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1033  ABC transporter related  29.18 
 
 
512 aa  189  1e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.264472  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1500  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  27.29 
 
 
573 aa  189  1e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2703  ABC transporter related  29.26 
 
 
576 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3323  ABC transporter, ATP-binding protein  29.47 
 
 
553 aa  187  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2045  ABC transporter related protein  35.13 
 
 
482 aa  187  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.777914  normal  0.886605 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1914  ABC transporter, ATP-binding protein  29.22 
 
 
551 aa  187  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3430  ABC transporter related  33.26 
 
 
530 aa  187  5e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.618683  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  30.3 
 
 
548 aa  186  7e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1895  ABC transporter related  31.61 
 
 
574 aa  186  9e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0190897  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1989  ABC transporter ATP-binding protein  28.04 
 
 
569 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0915836  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05108  ATP-binding ABC transporter  28.9 
 
 
593 aa  185  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0067  ABC transporter related  32.89 
 
 
528 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  30.42 
 
 
481 aa  184  4.0000000000000006e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0252  ABC transporter related protein  36.65 
 
 
541 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.062199 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2291  ABC transporter related  35.07 
 
 
535 aa  183  7e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180865  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2110  ABC transporter related protein  29.96 
 
 
571 aa  182  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.147486  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3100  ABC transporter related  32.17 
 
 
477 aa  182  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.503576  normal  0.57162 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1633  ABC transporter, ATP-binding protein  27.1 
 
 
558 aa  181  2e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.104044  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0945  ABC transporter related  34.52 
 
 
764 aa  181  2.9999999999999997e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>