More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0301 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0301  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 304 aa  629  1e-179  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17740  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  32.85 
 
 		 322 aa  125  7e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.743146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2321  transcriptional regulator, AraC family  31.58 
 
 		 317 aa  121  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.612609 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4771  transcriptional regulator, AraC family  28.72 
 
 		 317 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0325  transcriptional regulator, AraC family  30.72 
 
 		 325 aa  102  7e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22320  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  30.28 
 
 		 328 aa  98.6  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000320877  normal  0.335599 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3978  transcriptional regulator, AraC family  23.76 
 
 		 318 aa  90.1  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.250001  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0100  AraC family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2509  AraC family transcriptional regulator  20.97 
 
 		 294 aa  75.1  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00177278  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12970  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  30.51 
 
 		 306 aa  75.1  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.149965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1147  AraC family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1813  transcription regulator protein  37.78 
 
 		 303 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.881353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0971  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000205729  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3983  transcriptional regulator, AraC family  36.67 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1456  AraC family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 320 aa  68.9  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1484  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2694  AraC family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 332 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.899645 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1820  AraC family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 284 aa  67.8  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0360  transcriptional regulator, AraC family  34.29 
 
 		 131 aa  67  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2358  AraC family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.738853  normal  0.890173 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0236  transcriptional regulator, AraC family  39 
 
 		 273 aa  66.6  0.0000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  32.32 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3721  AraC family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0850692  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4647  AraC family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.951834 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0117  AraC family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 342 aa  63.9  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0879  AraC family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 347 aa  63.9  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5657  AraC family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.760832 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2271  transcriptional regulator, AraC family  24.22 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22580  AraC family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000567306  hitchhiker  0.000118862 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1659  transcriptional regulator, AraC family  34.58 
 
 		 348 aa  62.8  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.278996 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01697  hypothetical protein  34.12 
 
 		 286 aa  62.8  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1906  putative transcriptional regulator  42.17 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42390  transcriptional regulator ExsA  33.33 
 
 		 278 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.732807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003334  type III secretion thermoregulatory protein (LcrF,VirF,transcription regulation of virulence plasmid)  32.94 
 
 		 286 aa  62.4  0.000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0946  helix-turn-helix domain-containing protein  37.19 
 
 		 307 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2858  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  34.78 
 
 		 323 aa  61.6  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.113519 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1670  transcriptional regulator, AraC family  31.53 
 
 		 338 aa  62.4  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.135739 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2267  AraC family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 334 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0311911  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2448  AraC family transcription regulator  41.38 
 
 		 299 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0683308  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3368  AraC family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 313 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.325017  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2411  transcriptional regulator, AraC family  40.48 
 
 		 333 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.382897  normal  0.850127 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4999  AraC family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 313 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0916348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4383  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 332 aa  62.4  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433153  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4578  AraC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 409 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0591899  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0674  transcriptional regulator, AraC family  32.41 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03650  transcriptional regulator  33.75 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0572  AraC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2415  transcriptional regulator, AraC family  43.24 
 
 		 368 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.125553 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5288  AraC family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0305089  normal  0.89359 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0873  transcriptional regulator PchR  38.71 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1829  AraC family transcription regulator  35.24 
 
 		 323 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2284  transcriptional regulator, AraC family  36.9 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  36.84 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0072  transcriptional regulator, AraC family  33.15 
 
 		 322 aa  61.6  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.783427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  36.84 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4591  two component transcriptional regulator, AraC family  26.53 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1428  helix-turn-helix domain-containing protein  30.19 
 
 		 329 aa  61.6  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6071  two component AraC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1575  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  36.84 
 
 		 325 aa  60.5  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000250184  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0934  AraC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 365 aa  60.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2274  AraC family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348217  normal  0.470943 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  35.79 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2611  AraC family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0430862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2099  yersiniabactin transcriptional regulator YbtA  35.48 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7173  two component AraC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.495812 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0360  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000460662  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0423  transcriptional regulator, AraC family  45.21 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6368  two component AraC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.434467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09260  transcriptional regulator PchR  36.19 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.372084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1362  transcriptional regulator, AraC family  43.59 
 
 		 332 aa  60.5  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00431533  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0844  transcriptional regulator, AraC family  34.83 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3170  transcriptional regulator, AraC family  33.73 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.777646  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1013  AraC family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.126228  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2498  transcriptional regulator, AraC family  35.42 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0467728  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2492  transcriptional regulator, AraC family  34.41 
 
 		 322 aa  60.1  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1271  transcriptional regulator, AraC family  35.79 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2262  AraC family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.155717 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1958  helix-turn-helix domain-containing protein  33.64 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3301  transcriptional regulator, AraC family  39.29 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1608  transcriptional regulator, AraC family  33.59 
 
 		 334 aa  59.7  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5151  AraC family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2755  transcriptional regulator, AraC family  37.18 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.877904 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0914  transcriptional regulator, AraC family  24.07 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.294163  normal  0.0677642 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5240  AraC family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5532  AraC family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.501091 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2438  transcriptional regulator, AraC family  36.25 
 
 		 328 aa  59.7  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000013643 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  35.96 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23720  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  27.59 
 
 		 347 aa  59.3  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01433  transcriptional regulator  31.82 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.738294  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5603  AraC family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 409 aa  59.3  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1575  AraC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 339 aa  59.7  0.00000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1432  transcriptional regulator, AraC family  42.25 
 
 		 387 aa  59.3  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.185359  normal  0.618503 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3366  transcriptional regulator, AraC family  29.78 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.608408  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5741  helix-turn-helix domain-containing protein  37.63 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>