More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0148 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0148  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 720 aa  1436    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2031  putative amino acid antiporter/acid resistance protein  58.42 
 
 		 472 aa  549  1e-155  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2317  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter family protein  56.85 
 
 		 472 aa  547  1e-154  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1412  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  53.21 
 
 		 503 aa  474  1e-132  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0796975  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1681  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  51.18 
 
 		 511 aa  473  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01463  hypothetical protein  50.96 
 
 		 511 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01450  predicted glutamate:gamma-aminobutyric acid antiporter  50.96 
 
 		 511 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1681  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  50.96 
 
 		 511 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2155  glutamate/g-aminobutyrate antiporter  50.96 
 
 		 511 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.316259  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2165  glutamate/g-aminobutyrate antiporter  50.96 
 
 		 511 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0669643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2105  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  50.96 
 
 		 511 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.902861  normal  0.230296 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1577  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  50.96 
 
 		 511 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1755  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  50.96 
 
 		 511 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.489766  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1507  glutamate:gamma-aminobutyrate antiporter family protein  50.53 
 
 		 485 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0581388  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1297  putative amino acid antiporter/acid resistance protein  50.32 
 
 		 485 aa  467  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00362427  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0883  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  40.04 
 
 		 511 aa  328  3e-88  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1050  hypothetical protein  33.19 
 
 		 473 aa  277  5e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.95455 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0047  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  33.98 
 
 		 494 aa  260  6e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0037  amino acid permease-associated region  34.61 
 
 		 494 aa  246  9.999999999999999e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.877998 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0470  hypothetical protein  30.85 
 
 		 467 aa  223  9.999999999999999e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0446  hypothetical protein  30.85 
 
 		 467 aa  222  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2342  amino acid permease-associated region  32.95 
 
 		 508 aa  216  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0123104  normal  0.200985 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1654  hypothetical protein  32.26 
 
 		 464 aa  199  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1660  hypothetical protein  32.48 
 
 		 464 aa  199  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0552  glutamate/GABA antiporter  32.07 
 
 		 506 aa  198  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0708  amino acid permease-associated region  29.39 
 
 		 480 aa  198  4.0000000000000005e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000156631 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3825  glutamate/gamma-aminobutyrate anti-porter  32.39 
 
 		 506 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0145  amino acid permease-associated region  31.66 
 
 		 474 aa  196  1e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.270718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0047  amino acid permease-associated region  31.78 
 
 		 499 aa  195  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0046  amino acid permease-associated region  28.36 
 
 		 495 aa  182  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4375  amino acid permease-associated region  30.08 
 
 		 495 aa  180  7e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1501  amino acid permease family protein  29.68 
 
 		 474 aa  177  8e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1434  glutamate/gamma-aminobutyrate antiporter  29.68 
 
 		 474 aa  177  9e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0488  amino acid antiporter  28.95 
 
 		 466 aa  170  7e-41  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.557891  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2121  glutamate/gamma-aminobutyrate antiporter  27.1 
 
 		 476 aa  165  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2318  amino acid permease-associated region  27.08 
 
 		 469 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0063  amino acid antiporter  27.08 
 
 		 470 aa  165  3e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02485  hypothetical protein  29.92 
 
 		 475 aa  164  6e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1892  hypothetical protein  30.5 
 
 		 473 aa  163  1e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003630  amino acid/polyamine  28.96 
 
 		 475 aa  161  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6600  amino acid permease-associated region  28.96 
 
 		 490 aa  158  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1881  hypothetical protein  30.26 
 
 		 473 aa  157  5.0000000000000005e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2710  putative amino acid transporter  28.81 
 
 		 473 aa  154  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.484559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2601  putative amino acid transporter  28.57 
 
 		 473 aa  153  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2547  putative amino acid transporter  28.57 
 
 		 473 aa  153  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2589  putative amino acid transporter  28.57 
 
 		 473 aa  153  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.462 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2501  putative amino acid transporter  28.57 
 
 		 473 aa  153  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.957619  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0217  amino acid antiporter  29.97 
 
 		 782 aa  127  1e-27  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0653  amino acid permease family protein  26.54 
 
 		 472 aa  125  3e-27  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0159  amino acid permease family protein  27.34 
 
 		 495 aa  109  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0155  amino acid permease  27.34 
 
 		 495 aa  110  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1629  hypothetical protein  26.02 
 
 		 445 aa  92.8  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1623  hypothetical protein  25.77 
 
 		 445 aa  91.7  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1143  amino acid permease-associated region  25.96 
 
 		 464 aa  87.4  9e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1012  amino acid permease family protein  24.87 
 
 		 489 aa  82.8  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000367074  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3446  amino acid permease-associated region  22.72 
 
 		 455 aa  83.2  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1181  amino acid permease family protein  24.62 
 
 		 489 aa  79.3  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0293618  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2190  amino acid permease-associated region  21.16 
 
 		 497 aa  76.3  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1382  amino acid permease-associated region  24.95 
 
 		 501 aa  75.1  0.000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.320464  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0677  amino acid permease-associated region  20.93 
 
 		 500 aa  75.1  0.000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.148387 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1311  amino acid transporter  24.85 
 
 		 516 aa  73.6  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000130405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2961  amino acid permease-associated region  22.46 
 
 		 481 aa  72  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.408205 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4640  arginine:agmatin antiporter  24.39 
 
 		 445 aa  70.5  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4689  arginine:agmatin antiporter  24.39 
 
 		 445 aa  70.5  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4715  amino acid permease family protein  24.59 
 
 		 500 aa  70.1  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.212622  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4556  arginine:agmatin antiporter  24.39 
 
 		 445 aa  70.5  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5674  amino acid permease family protein  24.73 
 
 		 514 aa  70.1  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.270283  normal  0.215143 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4640  arginine:agmatin antiporter  24.39 
 
 		 445 aa  70.5  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04028  predicted transporter  24.73 
 
 		 500 aa  69.7  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.853032  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3834  amino acid permease-associated region  24.73 
 
 		 514 aa  69.7  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4400  amino acid permease family protein  24.73 
 
 		 500 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3854  amino acid permease-associated region  24.45 
 
 		 500 aa  68.9  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146223 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4627  amino acid permease family protein  24.45 
 
 		 514 aa  68.9  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.592733  normal  0.0531629 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4549  arginine:agmatin antiporter  24.39 
 
 		 445 aa  68.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226613  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03990  hypothetical protein  24.73 
 
 		 489 aa  68.6  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.826607  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4612  arginine:agmatin antiporter  23.34 
 
 		 445 aa  68.6  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0671  amino acid permease-associated region  21.92 
 
 		 500 aa  68.2  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122494  hitchhiker  0.0000196904 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03986  arginine:agmatin  23.34 
 
 		 445 aa  68.2  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3877  amino acid permease-associated region  23.34 
 
 		 445 aa  68.2  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4580  arginine:agmatin antiporter  23.34 
 
 		 445 aa  68.2  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.721219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5628  arginine:agmatin antiporter  23.34 
 
 		 445 aa  68.2  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03947  hypothetical protein  23.34 
 
 		 445 aa  68.2  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4669  arginine:agmatin antiporter  23.34 
 
 		 445 aa  68.2  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3912  arginine:agmatin antiporter  23.34 
 
 		 445 aa  68.2  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.27107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4355  arginine:agmatin antiporter  23.34 
 
 		 445 aa  67.8  0.0000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.705479  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1995  amino acid transporter  22.36 
 
 		 507 aa  66.2  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0293042  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04003  predicted lysine/cadaverine transporter  25.93 
 
 		 444 aa  64.3  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3895  lysine/cadaverine antiporter  25.93 
 
 		 444 aa  64.3  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03965  hypothetical protein  25.93 
 
 		 444 aa  64.3  0.000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4373  lysine/cadaverine antiporter  25.93 
 
 		 444 aa  64.3  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0915774  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4687  lysine/cadaverine antiporter  25.93 
 
 		 444 aa  64.3  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4601  lysine/cadaverine antiporter  25.93 
 
 		 444 aa  64.3  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000619747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5648  lysine/cadaverine antiporter  25.93 
 
 		 444 aa  64.3  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.742778  normal  0.745814 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  26.16 
 
 		 471 aa  64.3  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  26.16 
 
 		 471 aa  64.3  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  26.16 
 
 		 471 aa  64.3  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  26.16 
 
 		 471 aa  64.3  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  26.16 
 
 		 471 aa  64.3  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0828  amino acid transporter  25 
 
 		 502 aa  63.9  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000137053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5194  putrescine transporter  24.3 
 
 		 452 aa  63.5  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.330864 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>