More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0081 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0081  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 211 aa  436  1e-121  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1633  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 210 aa  177  8e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.124131  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  36.32 
 
 		 204 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0536  transcriptional regulator, TetR family  33.98 
 
 		 204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.613933  normal  0.25181 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1837  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 202 aa  106  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0322  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 223 aa  106  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.541277 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1692  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 224 aa  102  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1444  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 225 aa  99.8  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0101817  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04360  transcriptional regulator  31.32 
 
 		 194 aa  96.3  3e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3293  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 200 aa  95.1  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000151669  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2456  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 211 aa  94.7  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0797268  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3295  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 208 aa  87  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03730  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03740  transcriptional regulator, TetR family  47.13 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3834  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000963392 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0969  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.19098 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0191  TetR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1584  transcriptional regulator, TetR family  25.84 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2592  transcriptional regulator, TetR family  23.7 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000712719  hitchhiker  0.00165626 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0457  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2067  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.855193  normal  0.580158 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  25.43 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3503  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8489  putative transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280909  normal  0.379927 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13490  transcriptional regulator  40.68 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0414  TetR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0167  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3140  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3500  transcriptional regulator, TetR family  25.62 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00016281 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6256  Transcriptional regulator  27.88 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109242  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  22.03 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5593  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.531399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23280  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 225 aa  53.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1307  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0245614  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0290  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 198 aa  53.1  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0511  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 225 aa  52.8  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3834  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 218 aa  53.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5181  TetR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 190 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.752009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 221 aa  52.8  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  22.89 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 201 aa  52.4  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 202 aa  52.4  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5570  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 198 aa  52.4  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 219 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 222 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 		 207 aa  52  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 218 aa  52  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 		 222 aa  51.6  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0286  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 186 aa  51.6  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2430  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 207 aa  51.6  0.000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 221 aa  51.6  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 217 aa  51.6  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4014  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 225 aa  51.6  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 217 aa  51.6  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4343  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0349599  decreased coverage  0.000000750918 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1941  transcriptional regulator, TetR family  22.49 
 
 		 189 aa  50.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.842083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 275 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3363  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 244 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0676561  hitchhiker  0.0000000000000226443 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2209  TetR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.539658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1526  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 189 aa  50.8  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000234923  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0970  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3699  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  36.21 
 
 		 239 aa  50.1  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  22.03 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 238 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3469  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 258 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4522  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.828993  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0726  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 283 aa  50.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1597  transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 187 aa  50.4  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0577868  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 193 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  35.62 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1656  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0515046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 275 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25080  Transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 191 aa  49.7  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>