More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0068 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_01330  Na+/proline symporter  71.91 
 
 
525 aa  679    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0068  Na+/solute symporter  100 
 
 
512 aa  1014    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3090  Na+/solute symporter  59.55 
 
 
508 aa  585  1e-166  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000664536  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0612  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  48.71 
 
 
503 aa  412  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000214976  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3191  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  46.49 
 
 
504 aa  393  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.205305  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1220  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  41.2 
 
 
489 aa  362  1e-98  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0735  Na+/solute symporter  41.6 
 
 
489 aa  362  1e-98  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1464  Na+/solute symporter  41.72 
 
 
489 aa  360  5e-98  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.675757  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2279  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  44.33 
 
 
504 aa  344  2e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.257788  hitchhiker  0.0000218485 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1759  Na+ symporter  42.71 
 
 
531 aa  325  2e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1326  Sodium/proline symporter  32.29 
 
 
488 aa  169  1e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0529188  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1134  Na+/solute symporter  28.32 
 
 
527 aa  169  1e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2326  Na+/solute symporter  30.68 
 
 
520 aa  161  3e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02712  proline/sodium symporter  30.96 
 
 
493 aa  157  6e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.076903  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05510  SSS sodium solute transporter  28.65 
 
 
536 aa  156  7e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1396  Na+/proline symporter  29.96 
 
 
553 aa  155  2e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2137  SSS sodium solute transporter superfamily  29.76 
 
 
528 aa  151  3e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00565072  normal  0.610314 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0734  sodium/proline symporter  29.5 
 
 
492 aa  150  6e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3721  sodium:proline symporter (proline permease)  26.3 
 
 
553 aa  150  7e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1221  sodium/proline symporter  29.03 
 
 
492 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0425  Na+/solute symporter  28.89 
 
 
530 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  27.27 
 
 
492 aa  147  6e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  26.87 
 
 
492 aa  145  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54150  sodium/proline symporter PutP  29.64 
 
 
506 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1465  sodium/proline symporter  28.94 
 
 
492 aa  144  4e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09750  sodium/proline symporter  29.32 
 
 
520 aa  144  4e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000003829  hitchhiker  0.000045945 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4736  sodium/proline symporter PutP  29.64 
 
 
506 aa  143  6e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.865445  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  28.5 
 
 
493 aa  143  9e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  25.6 
 
 
492 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  31.24 
 
 
488 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  27.92 
 
 
484 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1063  hypothetical protein  31.75 
 
 
526 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.771513 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1002  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.57 
 
 
533 aa  141  3e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  26.1 
 
 
492 aa  141  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  26.1 
 
 
492 aa  141  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  26.1 
 
 
492 aa  141  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1542  sodium/proline symporter  29.17 
 
 
502 aa  141  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.13082 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  26.1 
 
 
492 aa  141  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1756  sodium/proline symporter  27.38 
 
 
513 aa  141  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1653  sodium/proline symporter  28.7 
 
 
511 aa  141  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4147  sodium/proline symporter  28.86 
 
 
497 aa  141  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  26.1 
 
 
492 aa  141  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  25.79 
 
 
492 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4818  sodium/proline symporter  28.33 
 
 
492 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.88778  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1248  Sodium/proline symporter  32.46 
 
 
496 aa  140  4.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.126391  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  30 
 
 
483 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2627  sodium/proline symporter  30.36 
 
 
502 aa  140  6e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.516748  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0522  sodium/proline symporter  28.81 
 
 
492 aa  140  7e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550728  normal  0.0854838 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4946  sodium/proline symporter  28.1 
 
 
492 aa  140  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  27.88 
 
 
492 aa  140  7.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0949  sodium/proline symporter  27.29 
 
 
488 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000419009  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0148  sodium/proline symporter  28.54 
 
 
499 aa  139  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.720955  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1200  sodium/proline symporter  28.6 
 
 
502 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.133838  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1235  sodium/proline symporter  28.6 
 
 
502 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0211084  normal  0.60164 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1220  sodium/proline symporter  28.6 
 
 
502 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.405046 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  27.04 
 
 
492 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1190  sodium/proline symporter  28.6 
 
 
502 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.969329  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0036  Na+ symporter  26.25 
 
 
537 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.90526  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1716  GTP-binding protein, HSR1-releated protein  28.11 
 
 
498 aa  139  1e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.066858  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3766  sodium/proline symporter  30.33 
 
 
499 aa  139  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.525061  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0453  Sodium/proline symporter  28.34 
 
 
494 aa  138  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  27.45 
 
 
487 aa  139  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3752  sodium/proline symporter family protein  26.9 
 
 
492 aa  139  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4995  sodium/proline symporter  27.92 
 
 
492 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7582  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4018  sodium/proline symporter  29.86 
 
 
494 aa  138  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01018  proline:sodium symporter  30.08 
 
 
502 aa  138  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2580  sodium/proline symporter  30.08 
 
 
502 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0213742 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2108  sodium/proline symporter  30.08 
 
 
502 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.275652  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1135  sodium/proline symporter  30.08 
 
 
502 aa  138  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0465761  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  26.56 
 
 
492 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1253  sodium/proline symporter  30.08 
 
 
502 aa  138  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.325594 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1131  sodium/proline symporter  30.08 
 
 
502 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.276577  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1085  sodium/proline symporter  28.37 
 
 
503 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01675  proline/sodium symporter  30.57 
 
 
504 aa  137  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.068924  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1242  sodium/proline symporter  28.97 
 
 
491 aa  137  4e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  27.18 
 
 
492 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  26.51 
 
 
492 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1415  SSS family Na(+)/proline symporter  29.38 
 
 
499 aa  136  9e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.631202 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4210  sodium/proline symporter  29.05 
 
 
494 aa  136  9e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0149  Sodium/proline symporter  30.02 
 
 
498 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2302  sodium/proline symporter  30.08 
 
 
502 aa  136  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1957  high affinity proline permease  27.66 
 
 
512 aa  135  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1991  high affinity proline permease  27.66 
 
 
512 aa  135  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1209  sodium/panthothenate symporter  27.23 
 
 
484 aa  136  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00169799  normal  0.818802 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0389  sodium/panthothenate symporter  27.23 
 
 
484 aa  136  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00229851  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0468  Na+/solute symporter  26.16 
 
 
528 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.280127  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0455  sodium/panthothenate symporter  27.23 
 
 
484 aa  136  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  26.86 
 
 
493 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  26.86 
 
 
493 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  29.84 
 
 
483 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  26.7 
 
 
482 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2608  sodium/proline symporter  30.23 
 
 
483 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0498264  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3463  proline/sodium symporter  29.36 
 
 
495 aa  135  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  26.71 
 
 
493 aa  134  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  26.86 
 
 
492 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  26.71 
 
 
492 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3553  sodium/panthothenate symporter  27.37 
 
 
483 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000280994  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1854  sodium/proline permease  27.53 
 
 
489 aa  134  3.9999999999999996e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.794377  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1675  sodium/proline permease  27.76 
 
 
489 aa  134  5e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  26.38 
 
 
518 aa  134  6e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>