41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0065 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0065  hypothetical protein  100 
 
 
492 aa  999    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.950662  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22890  Methyl-accepting chemotaxis protein  31.59 
 
 
487 aa  230  4e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3164  hypothetical protein  29.35 
 
 
487 aa  219  1e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26590  hypothetical protein  30.12 
 
 
515 aa  207  4e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4005  hypothetical protein  30.98 
 
 
489 aa  202  9.999999999999999e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0110668 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03537  hypothetical protein  30.06 
 
 
490 aa  199  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.206866  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0870  hypothetical protein  27.97 
 
 
490 aa  170  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.282403  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0737  hypothetical protein  24.69 
 
 
482 aa  118  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.509556  normal  0.0133056 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0518  hypothetical protein  23.27 
 
 
482 aa  113  8.000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.566512  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3740  hypothetical protein  25.62 
 
 
485 aa  113  9e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2296  hypothetical protein  22.92 
 
 
478 aa  108  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.357562  normal  0.109764 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1630  hypothetical protein  22.52 
 
 
486 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3942  hypothetical protein  25.67 
 
 
482 aa  105  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03600  hypothetical protein  24.06 
 
 
510 aa  101  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1811  hypothetical protein  22.6 
 
 
481 aa  95.5  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2222  hypothetical protein  29.64 
 
 
499 aa  94.7  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2029  hypothetical protein  29.9 
 
 
490 aa  95.1  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0780  hypothetical protein  23.85 
 
 
481 aa  94.4  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0901  hypothetical protein  23.49 
 
 
483 aa  93.2  9e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0797032  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17220  hypothetical protein  26.09 
 
 
477 aa  92  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.96015  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0838  hypothetical protein  23.14 
 
 
480 aa  91.7  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0017  hypothetical protein  23.08 
 
 
484 aa  90.5  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1446  hypothetical protein  23.4 
 
 
482 aa  90.5  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0742  hypothetical protein  24.32 
 
 
412 aa  87.8  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2066  hypothetical protein  23.01 
 
 
502 aa  87  8e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0285936  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2185  hypothetical protein  24.62 
 
 
510 aa  83.6  0.000000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0222  hypothetical protein  22.86 
 
 
488 aa  80.1  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00993068 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2278  hypothetical protein  22.27 
 
 
494 aa  77.8  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1567  hypothetical protein  23.49 
 
 
522 aa  74.7  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0271  hypothetical protein  25.69 
 
 
507 aa  72.4  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  decreased coverage  0.00169568 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03250  hypothetical protein  23.27 
 
 
538 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000127047  unclonable  2.10051e-21 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5157  hypothetical protein  22.68 
 
 
496 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265097  normal  0.0750185 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1131  hypothetical protein  21.24 
 
 
489 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1174  hypothetical protein  22.89 
 
 
485 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.180277  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49830  hypothetical protein  22.75 
 
 
450 aa  50.8  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0882  hypothetical protein  23.04 
 
 
480 aa  50.4  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104692  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0865  hypothetical protein  23.04 
 
 
480 aa  50.4  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0871  hypothetical protein  21.19 
 
 
480 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.566977  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2511  hypothetical protein  20.73 
 
 
511 aa  48.1  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.398866  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3698  hypothetical protein  21.9 
 
 
499 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268851  decreased coverage  0.000278839 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0627  hypothetical protein  24.54 
 
 
176 aa  43.5  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>