184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0034 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0034  Auxin Efflux Carrier  100 
 
 
307 aa  600  1.0000000000000001e-171  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0031  Auxin Efflux Carrier  57.52 
 
 
306 aa  349  3e-95  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02940  Auxin Efflux Carrier  28.57 
 
 
306 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1778  auxin efflux carrier  33.33 
 
 
306 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  30.61 
 
 
305 aa  125  1e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  30.2 
 
 
307 aa  124  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0946  Auxin Efflux Carrier  29.03 
 
 
312 aa  122  6e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51689  hitchhiker  0.000246572 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2049  auxin efflux carrier  30.03 
 
 
305 aa  117  3e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.633484  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1197  AEC family permease  28.67 
 
 
299 aa  104  2e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.626498  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1647  hypothetical protein  25.83 
 
 
310 aa  103  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  0.0750907 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0478  malate permease related permease  25.68 
 
 
313 aa  100  3e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.557877  normal  0.943371 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1433  Auxin Efflux Carrier  23.47 
 
 
320 aa  92.8  6e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1914  auxin efflux carrier  28.38 
 
 
309 aa  92.8  6e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1252  auxin efflux carrier  25.16 
 
 
361 aa  87.8  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  23.45 
 
 
306 aa  87.4  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  24.92 
 
 
315 aa  86.3  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2186  Auxin Efflux Carrier  26.95 
 
 
325 aa  82.4  0.000000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13080  predicted permease  24.92 
 
 
317 aa  80.5  0.00000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.638391  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  23.42 
 
 
316 aa  80.1  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1563  malate permease  24.92 
 
 
314 aa  77.8  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00482398  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0671  auxin efflux carrier  25.82 
 
 
299 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.181249 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0454  Auxin Efflux Carrier  26.83 
 
 
315 aa  75.5  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.815375  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0872  auxin efflux carrier  22.34 
 
 
312 aa  72  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0141  malate permease  24.07 
 
 
321 aa  72  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000545032  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  22.84 
 
 
314 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  23.95 
 
 
315 aa  68.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  22.58 
 
 
311 aa  67.4  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0231  Auxin Efflux Carrier  27.4 
 
 
353 aa  67  0.0000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  23.02 
 
 
372 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  25 
 
 
297 aa  66.2  0.0000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  22.15 
 
 
314 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  21.02 
 
 
313 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  21.15 
 
 
312 aa  65.5  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0419  putative citrate transporter  23.4 
 
 
327 aa  64.3  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2139  auxin efflux carrier  24.18 
 
 
294 aa  64.3  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.207426  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  25.4 
 
 
310 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0498  auxin efflux carrier family protein  20.66 
 
 
349 aa  63.5  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  29.15 
 
 
307 aa  63.2  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0509  auxin efflux carrier family protein  20.66 
 
 
349 aa  63.2  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0577752  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  27.16 
 
 
311 aa  62  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2443  Auxin Efflux Carrier  24.12 
 
 
305 aa  62  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  23.55 
 
 
332 aa  61.2  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2573  auxin efflux carrier  27.4 
 
 
293 aa  60.8  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1446  AEC family permease  22.51 
 
 
315 aa  60.5  0.00000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2093  auxin efflux carrier  23.28 
 
 
308 aa  60.1  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0633524 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3639  auxin efflux carrier  23.79 
 
 
316 aa  60.5  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  24.84 
 
 
312 aa  60.1  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0431  auxin efflux carrier  22.59 
 
 
295 aa  58.5  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  26.63 
 
 
317 aa  58.9  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1090  permease  26.4 
 
 
298 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48340  Auxin Efflux Carrier family protein  23.36 
 
 
299 aa  57.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23880  membrane protein  25.74 
 
 
296 aa  57.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3083  auxin efflux carrier  24.62 
 
 
291 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0706  Auxin Efflux Carrier  25.88 
 
 
326 aa  55.8  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2640  auxin efflux carrier  24.1 
 
 
291 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2492  auxin efflux carrier  20.79 
 
 
291 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  27.36 
 
 
302 aa  55.8  0.0000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0327  auxin efflux carrier  24.84 
 
 
304 aa  55.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  25.68 
 
 
321 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5018  auxin efflux carrier  25.26 
 
 
303 aa  55.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.320746  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0205  auxin efflux carrier  27.5 
 
 
295 aa  54.7  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.773418  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0767  auxin efflux carrier  22.26 
 
 
303 aa  54.3  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.223185  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1038  auxin efflux carrier  22.44 
 
 
291 aa  54.7  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01768  hypothetical protein  24.03 
 
 
318 aa  54.7  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2782  auxin efflux carrier  21.92 
 
 
291 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350869  normal  0.279709 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1249  auxin efflux carrier  23.81 
 
 
300 aa  53.5  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  20.92 
 
 
302 aa  53.5  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4586  auxin efflux carrier  26.36 
 
 
328 aa  53.1  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1918  Auxin Efflux Carrier  25.24 
 
 
297 aa  52.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.032673  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2151  Auxin Efflux Carrier  22.51 
 
 
302 aa  52.4  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0908  auxin efflux carrier  26.13 
 
 
293 aa  52.4  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0290  auxin efflux carrier  28.28 
 
 
294 aa  52.4  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.392401  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  25.24 
 
 
297 aa  52.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  23.89 
 
 
318 aa  52  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0622  auxin efflux carrier  20.86 
 
 
291 aa  52  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2040  Auxin Efflux Carrier  22.91 
 
 
291 aa  52.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3358  auxin efflux carrier  26.01 
 
 
325 aa  52.4  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  23.89 
 
 
318 aa  52  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0790  Auxin Efflux Carrier  24.14 
 
 
291 aa  52.4  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  25.66 
 
 
320 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  23.89 
 
 
318 aa  52  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0100  hypothetical protein  27.03 
 
 
295 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  25 
 
 
306 aa  51.2  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3912  Auxin Efflux Carrier  22.18 
 
 
302 aa  51.2  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03581  possible malate permease  25.17 
 
 
305 aa  51.6  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11981  hypothetical protein  22.78 
 
 
305 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.944523  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1605  auxin efflux carrier (AEC) family protein  27.03 
 
 
295 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1522  auxin efflux carrier (AEC) family protein  27.03 
 
 
295 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.919635  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0770  Auxin Efflux Carrier  22.98 
 
 
302 aa  51.6  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000531114  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0069  auxin efflux carrier  20.85 
 
 
293 aa  51.2  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130998 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0722  Auxin Efflux Carrier  27.75 
 
 
337 aa  50.8  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4479  hypothetical protein  27.73 
 
 
316 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0830  permease  19.64 
 
 
362 aa  50.8  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  23.05 
 
 
318 aa  50.8  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3807  auxin efflux carrier  27.32 
 
 
295 aa  50.8  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.826316  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  23.47 
 
 
322 aa  50.8  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0341  auxin efflux carrier  23.12 
 
 
302 aa  50.1  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00467226  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1479  Auxin Efflux Carrier  24.64 
 
 
307 aa  50.1  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  19.81 
 
 
319 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  24.24 
 
 
316 aa  50.1  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>