286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0030 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0030  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 241 aa  493  9.999999999999999e-139  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3242  transcriptional regulator, AraC family  31.11 
 
 		 274 aa  89.4  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0462  helix-turn-helix domain-containing protein  27.52 
 
 		 277 aa  88.2  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1479  helix-turn-helix domain-containing protein  26.98 
 
 		 299 aa  86.7  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0993365  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3491  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25.55 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.873447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1835  helix-turn-helix domain-containing protein  26.98 
 
 		 277 aa  80.5  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.140482  normal  0.818318 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0433  transcriptional regulator, AraC family  29.49 
 
 		 274 aa  78.6  0.00000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0749  hypothetical protein  27.7 
 
 		 271 aa  68.9  0.00000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3797  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101891 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2715  putative regulatory protein  24.08 
 
 		 272 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5627  transcriptional regulator, AraC family  37 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1833  helix-turn-helix domain-containing protein  23.14 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0887778  normal  0.832681 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7200  AraC family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 297 aa  63.2  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0546  AraC family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7339  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 278 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.725809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1304  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.53 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.407333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4318  transcriptional regulator, AraC family  22.71 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.642666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5791  transcriptional regulator, AraC family  28.4 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1287  helix-turn-helix domain-containing protein  30.95 
 
 		 272 aa  58.5  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0575  transcriptional regulator, AraC family  33.02 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2483  AraC family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 273 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1962  transcriptional regulator, AraC family  25.58 
 
 		 271 aa  57  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17826 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0825  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3305  transcriptional regulator, AraC family  27.23 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000908006 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0676  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  23.76 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.425757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1097  AraC family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2793  transcriptional regulator, AraC family  28.78 
 
 		 219 aa  55.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.537681  hitchhiker  0.00108463 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1440  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 275 aa  54.7  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17370  hypothetical protein  23.21 
 
 		 275 aa  54.3  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.457096  normal  0.0989396 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0579  transcriptional regulator, AraC family  31.78 
 
 		 257 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4542  Helix-turn-helix, AraC domain protein  25.7 
 
 		 265 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3275  transcriptional regulator, AraC family  24.89 
 
 		 229 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.145248 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1632  AraC family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 291 aa  53.5  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0196517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1190  AraC family transcriptional regulator  21.7 
 
 		 271 aa  53.1  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2527  AraC family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 278 aa  52.8  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2594  AraC family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 278 aa  52.8  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 295 aa  52.8  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2141  two component AraC family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 260 aa  52.8  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2833  AraC family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 128 aa  52.4  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.360969  hitchhiker  0.00326998 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4562  AraC family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 409 aa  52  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00627934  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1375  transcriptional regulator, AraC family  32.61 
 
 		 275 aa  52  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.372829  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4969  transcriptional regulator, AraC family  32.08 
 
 		 409 aa  52  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0771  two component AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 355 aa  52  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000862622  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2693  AraC family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 278 aa  52  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6086  transcriptional regulator, AraC family  28.83 
 
 		 288 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.993456 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1425  AraC family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 271 aa  51.6  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.333229  normal  0.212879 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3448  transcriptional regulator, AraC family  39.74 
 
 		 281 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.327362  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0099  transcriptional regulator, AraC family  24.79 
 
 		 287 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2016  transcriptional regulator, AraC family  24.68 
 
 		 279 aa  50.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15370  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  32.18 
 
 		 415 aa  50.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1671  Helix-turn-helix, AraC domain protein  32.56 
 
 		 261 aa  50.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5387  transcriptional regulator, AraC family  26.67 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4467  helix-turn-helix domain-containing protein  28.43 
 
 		 252 aa  50.1  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0353023 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6692  transcriptional regulator, AraC family  30.12 
 
 		 260 aa  50.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4578  AraC family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 409 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0591899  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1224  Helix-turn-helix, AraC domain protein  25.49 
 
 		 289 aa  49.7  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.797309 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3282  two component AraC family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 535 aa  49.3  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2894  AraC family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 409 aa  49.3  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00223441  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3127  transcriptional regulator, AraC family  30.19 
 
 		 409 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3148  transcriptional regulator, AraC family  30.19 
 
 		 409 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.322003 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02106  transcriptional regulator AraC/xylS family  31.03 
 
 		 241 aa  49.3  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6750  transcriptional regulator, AraC family  23.74 
 
 		 327 aa  49.3  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 513 aa  49.3  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1384  transcriptional regulator, AraC family  28.18 
 
 		 269 aa  48.9  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.976076 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3110  transcriptional regulator, AraC family  24.53 
 
 		 189 aa  49.3  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567517 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1925  transcriptional regulator  24.75 
 
 		 252 aa  48.9  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0142  transcriptional regulator, AraC family  31.4 
 
 		 760 aa  48.9  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5603  AraC family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 409 aa  48.9  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5221  AraC family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 297 aa  48.9  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343965  normal  0.936054 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2241  helix-turn-helix domain-containing protein  32.38 
 
 		 277 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3115  helix-turn-helix domain-containing protein  27.56 
 
 		 412 aa  48.5  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4788  AraC family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 344 aa  48.1  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139915  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1762  AraC/XylS family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 278 aa  48.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1278  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  21.58 
 
 		 252 aa  48.1  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.711886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3282  transcriptional regulator, AraC family  32.61 
 
 		 271 aa  48.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0185565 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2206  AraC family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 303 aa  48.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000287978  normal  0.709471 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2167  AraC family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 261 aa  48.5  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.241927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0618  AraC family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 306 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0105124  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3952  AraC family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 262 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  29.07 
 
 		 530 aa  47.8  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2289  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 278 aa  48.1  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1097  AraC family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 306 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022105  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4026  AraC family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 276 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5306  transcriptional regulator, AraC family  30.53 
 
 		 244 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3966  AraC family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 276 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0381394 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2110  transcriptional regulator, AraC family  30.19 
 
 		 185 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.695339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4438  helix-turn-helix domain-containing protein  35.21 
 
 		 255 aa  48.5  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1318  AraC family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 294 aa  47.4  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.761239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0782  AraC family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 131 aa  47  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3383  AraC family transcriptional regulator  28 
 
 		 271 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.376352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1599  transcriptional regulator  30.95 
 
 		 361 aa  47.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.97604  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1111  AraC family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 506 aa  47  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000128485  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2711  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  26.87 
 
 		 319 aa  47.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0654  transcriptional regulator, AraC family  27.72 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0490278 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1568  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 278 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4320  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 427 aa  47.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0497  helix-turn-helix domain-containing protein  23.91 
 
 		 263 aa  47.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.516029  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2573  AraC/XylS family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 270 aa  47.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7852  AraC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 338 aa  47.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40387  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1112  transcriptional regulator, AraC family  32.61 
 
 		 296 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>