More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0002 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0002  chromosomal replication initiator protein DnaA  100 
 
 
520 aa  1081    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000222997  hitchhiker  0.00000014852 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  52.29 
 
 
506 aa  547  1e-154  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.993036  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  51.05 
 
 
501 aa  543  1e-153  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000175242  decreased coverage  0.000074483 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.57 
 
 
509 aa  274  2.0000000000000002e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  40.35 
 
 
457 aa  252  1e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1436  chromosomal replication initiation protein  33.67 
 
 
500 aa  250  5e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  40.06 
 
 
457 aa  249  6e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000597417  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.39 
 
 
489 aa  247  3e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.35 
 
 
454 aa  248  3e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.27 
 
 
534 aa  247  4.9999999999999997e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  37.71 
 
 
446 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  37.71 
 
 
446 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0001  chromosomal replication initiation protein  30.49 
 
 
495 aa  245  9.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0827  chromosomal replication initiation protein  30.56 
 
 
492 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  37.79 
 
 
446 aa  244  3e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  37.79 
 
 
446 aa  243  7e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000244098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  37.79 
 
 
446 aa  243  7e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000163866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  37.79 
 
 
446 aa  243  7e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000459109  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  37.79 
 
 
446 aa  243  7e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000425777  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  37.79 
 
 
446 aa  243  7e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  37.79 
 
 
446 aa  243  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  37.79 
 
 
446 aa  243  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  37.9 
 
 
443 aa  242  9e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0045  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.44 
 
 
539 aa  242  1e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  37.79 
 
 
446 aa  242  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000325337  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  37.33 
 
 
442 aa  241  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0001  chromosomal replication initiation protein  30.62 
 
 
492 aa  241  2e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.943807  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0001  initiation of chromosome replication  39.15 
 
 
436 aa  241  2e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  36.59 
 
 
450 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.12 
 
 
480 aa  239  9e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.48 
 
 
506 aa  239  1e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0003  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.95 
 
 
519 aa  239  1e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118183  unclonable  1.2245600000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0001  chromosomal replication initiation protein  30.6 
 
 
481 aa  238  3e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000056365  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  36.29 
 
 
450 aa  237  3e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447845  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0001  chromosomal replication initiation protein  34.03 
 
 
465 aa  237  4e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000010295  decreased coverage  0.002869 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.37 
 
 
480 aa  237  5.0000000000000005e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0206444  normal  0.0774659 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.54 
 
 
721 aa  236  6e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000423182  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0001  chromosomal replication initiation protein  31.18 
 
 
483 aa  236  6e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0001  chromosomal replication initiation protein  31.52 
 
 
495 aa  236  6e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0001  chromosomal replication initiation protein  31.52 
 
 
495 aa  236  6e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0454037 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0009  chromosomal replication initiation protein  31.52 
 
 
495 aa  236  6e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166715  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.81 
 
 
453 aa  236  7e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000208022  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.03 
 
 
490 aa  236  9e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2133  chromosomal replication initiation protein  30.62 
 
 
489 aa  236  9e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000845727  normal  0.662665 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.35 
 
 
469 aa  236  9e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280164  normal  0.937405 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  38.53 
 
 
453 aa  235  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  38.53 
 
 
453 aa  235  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0001  chromosomal replication initiation protein  30.41 
 
 
480 aa  234  3e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000170377  unclonable  0.000000000650471 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2507  chromosomal replication initiation protein  31.74 
 
 
472 aa  233  5e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251721  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.8 
 
 
464 aa  233  5e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00240104  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.36 
 
 
458 aa  233  7.000000000000001e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0008  chromosomal replication initiation protein  30.25 
 
 
460 aa  232  1e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12738  chromosomal replication initiation protein  29.35 
 
 
475 aa  232  1e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.843582  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.59 
 
 
518 aa  232  1e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.7384  hitchhiker  0.00538334 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0009  chromosomal replication initiation protein  30.68 
 
 
460 aa  232  1e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000281375  unclonable  0.0000000000600935 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0001  chromosomal replication initiation protein  30.08 
 
 
524 aa  231  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0237228  normal  0.131634 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0001  chromosomal replication initiation protein  30.12 
 
 
487 aa  231  2e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00605191  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0001  chromosomal replication initiation protein  30.29 
 
 
494 aa  231  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.124904  normal  0.26229 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002009  chromosomal replication initiator protein dnaA  30.88 
 
 
468 aa  231  3e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000552796  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  29.79 
 
 
470 aa  231  4e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000133107  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0001  chromosomal replication initiation protein  30.49 
 
 
460 aa  230  4e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000179736  unclonable  0.0000000000313535 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0001  chromosomal replication initiation protein  30.49 
 
 
460 aa  230  4e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000724276  unclonable  0.0000176 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.04 
 
 
591 aa  230  4e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000633656  unclonable  0.0000000292755 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00442  chromosomal replication initiation protein  31.2 
 
 
468 aa  230  4e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  37.5 
 
 
451 aa  230  5e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4177  chromosomal replication initiation protein  31.3 
 
 
462 aa  230  6e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4153  chromosomal replication initiation protein  31.3 
 
 
462 aa  230  6e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.6269e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0089  chromosomal replication initiation protein  31.19 
 
 
533 aa  229  7e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0001  chromosomal replication initiation protein  29.63 
 
 
462 aa  229  7e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000281438  unclonable  0.0000000118337 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0301  chromosomal replication initiation protein  31.19 
 
 
533 aa  229  7e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0001  chromosomal replication initiation protein  29.88 
 
 
472 aa  229  7e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000368077  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0006  chromosomal replication initiation protein  30.54 
 
 
462 aa  229  8e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000403403  unclonable  0.000000000136332 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2357  chromosomal replication initiator protein DnaA  29.19 
 
 
476 aa  229  9e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.048166  normal  0.586326 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  29.04 
 
 
456 aa  229  9e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0001  chromosomal replication initiation protein  31.3 
 
 
450 aa  229  9e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000634969  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.81 
 
 
587 aa  229  9e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00000000718914  hitchhiker  0.000588843 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.24 
 
 
527 aa  228  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0861644  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3442  chromosomal replication initiation protein  30.41 
 
 
522 aa  229  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.807856  normal  0.719643 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  36.71 
 
 
440 aa  229  1e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000118947  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.03 
 
 
462 aa  229  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138659  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.74 
 
 
444 aa  229  1e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.27 
 
 
528 aa  229  1e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.561876  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2848  chromosomal replication initiation protein  31 
 
 
533 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0001  chromosomal replication initiation protein  29.3 
 
 
451 aa  228  2e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123931  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  29.45 
 
 
503 aa  228  2e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  36.75 
 
 
443 aa  228  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0103  chromosomal replication initiation protein  31 
 
 
533 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0001  chromosomal replication initiation protein  29.3 
 
 
451 aa  228  2e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00187127  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0001  chromosomal replication initiation protein  32.22 
 
 
470 aa  228  2e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000177247  normal  0.980205 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.88 
 
 
468 aa  227  3e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0001  chromosomal replication initiation protein  31 
 
 
518 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0001  chromosomal replication initiation protein  30.21 
 
 
462 aa  227  3e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000257358  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0001  chromosomal replication initiation protein  30.21 
 
 
462 aa  227  3e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000562887  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0001  chromosomal replication initiation protein  30.21 
 
 
462 aa  227  3e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000157699  unclonable  0.0000121376 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0001  chromosomal replication initiation protein  29.37 
 
 
511 aa  228  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.424003  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2237  chromosomal replication initiation protein  31 
 
 
533 aa  228  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1938  chromosomal replication initiation protein  30.29 
 
 
473 aa  228  3e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0001  chromosomal replication initiation protein  30.21 
 
 
462 aa  227  3e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000998931  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0001  chromosomal replication initiation protein  31 
 
 
533 aa  228  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.9 
 
 
467 aa  227  4e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000136922  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>