More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_R0120 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_r00001  16S ribosomal RNA  99.61 
 
 		 1542 bp  2993    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.01898  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_r00006  16S ribosomal RNA  99.74 
 
 		 1542 bp  3009    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0446208  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_r00010  16S ribosomal RNA  99.35 
 
 		 1542 bp  2948    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00367496  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_r00011  16S ribosomal RNA  99.74 
 
 		 1542 bp  3009    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0360816  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_r00014  16S ribosomal RNA  99.22 
 
 		 1542 bp  2932    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0514001  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_r00017  16S ribosomal RNA  99.22 
 
 		 1542 bp  2932    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0241491  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_r00020  16S ribosomal RNA  99.74 
 
 		 1542 bp  3009    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0158539  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0003  16S ribosomal RNA  99.41 
 
 		 1530 bp  2962    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000874227  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0027  16S ribosomal RNA  99.48 
 
 		 1530 bp  2970    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000160494  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0078  16S ribosomal RNA  99.41 
 
 		 1530 bp  2948    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000571707  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0090  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1530 bp  3033    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000103004  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0098  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1530 bp  3033    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000143523  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0103  16S ribosomal RNA  99.93 
 
 		 1530 bp  3025    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00308735  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0113  16S ribosomal RNA  99.54 
 
 		 1530 bp  2977    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000562425  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r015  16S ribosomal RNA  88.84 
 
 		 1529 bp  1635    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0001  16S ribosomal RNA  89 
 
 		 1535 bp  1681    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000282718  hitchhiker  0.000910883 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0007  16S ribosomal RNA  88.88 
 
 		 1535 bp  1637    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000150491  normal  0.406366 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0016  16S ribosomal RNA  89.01 
 
 		 1535 bp  1653    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00201681  hitchhiker  0.0000000136741 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0071  16S ribosomal RNA  88.87 
 
 		 1535 bp  1651    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00148247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0123  16S ribosomal RNA  88.88 
 
 		 1535 bp  1637    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0163335  normal  0.34966 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0132  16S ribosomal RNA  89.01 
 
 		 1535 bp  1653    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0261242  normal  0.0671955 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0136  16S ribosomal RNA  88.82 
 
 		 1535 bp  1629    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000885648  hitchhiker  0.000140032 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0140  16S ribosomal RNA  89.01 
 
 		 1535 bp  1653    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00248839  normal  0.547637 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0143  16S ribosomal RNA  89.07 
 
 		 1535 bp  1675    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000577207  normal  0.0309772 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0001  16S ribosomal RNA  88.87 
 
 		 1535 bp  1651    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00134291  hitchhiker  0.00347665 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0016  16S ribosomal RNA  88.94 
 
 		 1535 bp  1659    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00459376  normal  0.131368 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0020  16S ribosomal RNA  88.75 
 
 		 1535 bp  1622    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000189863  hitchhiker  0.00241785 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0026  16S ribosomal RNA  89 
 
 		 1535 bp  1667    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0396739  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0071  16S ribosomal RNA  88.82 
 
 		 1535 bp  1629    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00107251  normal  0.159667 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0123  16S ribosomal RNA  88.88 
 
 		 1535 bp  1637    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00322133  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0144  16S ribosomal RNA  89.13 
 
 		 1535 bp  1683    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0816172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0001  16S ribosomal RNA  88.74 
 
 		 1535 bp  1635    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000442431  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0004  16S ribosomal RNA  88.81 
 
 		 1535 bp  1643    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000248814  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0013  16S ribosomal RNA  88.74 
 
 		 1535 bp  1635    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000146432  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0027  16S ribosomal RNA  88.74 
 
 		 1535 bp  1635    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000222685  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0030  16S ribosomal RNA  88.74 
 
 		 1535 bp  1635    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000656968  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0061  16S ribosomal RNA  88.74 
 
 		 1535 bp  1635    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000486947  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0121  16S ribosomal RNA  88.74 
 
 		 1535 bp  1635    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000475957  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0128  16S ribosomal RNA  88.74 
 
 		 1535 bp  1635    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000157224  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0133  16S ribosomal RNA  88.74 
 
 		 1535 bp  1635    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000510938  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0007  16S ribosomal RNA  88.74 
 
 		 1555 bp  1635    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0012678  normal  0.693673 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0016  16S ribosomal RNA  89.07 
 
 		 1555 bp  1675    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0251895  hitchhiker  0.00000000270434 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0130  16S ribosomal RNA  88.68 
 
 		 1555 bp  1628    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0100831  normal  0.116315 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0001  16S ribosomal RNA  89.08 
 
 		 1537 bp  1663    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00518638  normal  0.485409 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0004  16S ribosomal RNA  89.08 
 
 		 1537 bp  1663    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000279849  hitchhiker  0.00471183 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0014  16S ribosomal RNA  89.02 
 
 		 1537 bp  1655    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000324534  normal  0.0910098 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0019  16S ribosomal RNA  89.08 
 
 		 1537 bp  1663    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000962307  normal  0.557456 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0022  16S ribosomal RNA  89.08 
 
 		 1537 bp  1663    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00001194  unclonable  0.0000109151 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0050  16S ribosomal RNA  89.08 
 
 		 1537 bp  1663    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0125127  normal  0.898769 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0112  16S ribosomal RNA  89.02 
 
 		 1537 bp  1655    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000370609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0132  16S ribosomal RNA  89.02 
 
 		 1537 bp  1655    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000703057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0001  16S ribosomal RNA  89.03 
 
 		 1537 bp  1637    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000407555  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0004  16S ribosomal RNA  88.75 
 
 		 1537 bp  1637    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000257645  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0008  16S ribosomal RNA  89.16 
 
 		 1537 bp  1653    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000302643  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0022  16S ribosomal RNA  88.9 
 
 		 1537 bp  1635    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000152089  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0073  16S ribosomal RNA  89.16 
 
 		 1537 bp  1653    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000705466  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0117  16S ribosomal RNA  88.75 
 
 		 1537 bp  1637    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000829511  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0121  16S ribosomal RNA  88.9 
 
 		 1537 bp  1635    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000422881  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0129  16S ribosomal RNA  88.9 
 
 		 1537 bp  1635    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000475348  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0138  16S ribosomal RNA  89.16 
 
 		 1537 bp  1653    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000622632  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0142  16S ribosomal RNA  89.03 
 
 		 1537 bp  1637    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000521528  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0001  16S ribosomal RNA  89.52 
 
 		 1555 bp  1744    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00717512  normal  0.153342 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0009  16S ribosomal RNA  89.08 
 
 		 1557 bp  1677    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000155519  normal  0.051604 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0085  16S ribosomal RNA  89.08 
 
 		 1557 bp  1677    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000147539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0104  16S ribosomal RNA  89.08 
 
 		 1557 bp  1663    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00262578  normal  0.0215304 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0111  16S ribosomal RNA  89.08 
 
 		 1557 bp  1677    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0483873  hitchhiker  0.00158714 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0118  16S ribosomal RNA  89.08 
 
 		 1557 bp  1677    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00013046  hitchhiker  0.000312087 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0122  16S ribosomal RNA  89.08 
 
 		 1557 bp  1677    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0113922  normal  0.0328677 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0125  16S ribosomal RNA  89.46 
 
 		 1556 bp  1731    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000165481  normal  0.0694768 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0007  16S ribosomal RNA  95.76 
 
 		 1545 bp  2510    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.010889  decreased coverage  0.00540958 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0019  16S ribosomal RNA  95.7 
 
 		 1545 bp  2502    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000981314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0068  16S ribosomal RNA  95.76 
 
 		 1545 bp  2510    Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000738133  normal  0.0138382 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0088  16S ribosomal RNA  95.76 
 
 		 1545 bp  2510    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00544276  normal  0.065042 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0093  16S ribosomal RNA  95.76 
 
 		 1545 bp  2510    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0247267  decreased coverage  0.00226048 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0104  16S ribosomal RNA  95.76 
 
 		 1545 bp  2510    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000542682  decreased coverage  0.0046973 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0108  16S ribosomal RNA  95.76 
 
 		 1545 bp  2510    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0133586  normal  0.0202407 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0001  16S ribosomal RNA  88.69 
 
 		 1555 bp  1614    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000995354  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0009  16S ribosomal RNA  88.75 
 
 		 1555 bp  1622    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000407076  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0130  16S ribosomal RNA  88.69 
 
 		 1555 bp  1614    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0256321  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0241  16S ribosomal RNA  90.49 
 
 		 1536 bp  1863    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000165146  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2076  16S ribosomal RNA  90.62 
 
 		 1535 bp  1879    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000346352  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2332  16S ribosomal RNA  90.56 
 
 		 1535 bp  1871    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0176289  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2338  16S ribosomal RNA  90.43 
 
 		 1535 bp  1855    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000750964  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2460  16S ribosomal RNA  90.43 
 
 		 1535 bp  1855    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000585775  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2540  16S ribosomal RNA  90.49 
 
 		 1536 bp  1863    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000260054  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2706  16S ribosomal RNA  90.62 
 
 		 1536 bp  1879    Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000399166  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2799  16S ribosomal RNA  90.43 
 
 		 1536 bp  1855    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000312291  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0001  16S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 1537 bp  1639    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000018503  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0006  16S ribosomal RNA  88.95 
 
 		 1537 bp  1647    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000817728  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0015  16S ribosomal RNA  88.9 
 
 		 1537 bp  1622    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00010598  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0019  16S ribosomal RNA  88.82 
 
 		 1537 bp  1631    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000102694  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0027  16S ribosomal RNA  88.76 
 
 		 1537 bp  1624    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000499346  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0033  16S ribosomal RNA  89.03 
 
 		 1537 bp  1637    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.48131  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0082  16S ribosomal RNA  88.97 
 
 		 1537 bp  1629    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000820075  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0129  16S ribosomal RNA  88.83 
 
 		 1537 bp  1628    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000152153  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0140  16S ribosomal RNA  88.95 
 
 		 1537 bp  1647    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.471894  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4189  16S ribosomal RNA  94.79 
 
 		 1543 bp  2401    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000402751  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4193  16S ribosomal RNA  94.85 
 
 		 1543 bp  2409    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000141803  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4203  16S ribosomal RNA  94.85 
 
 		 1543 bp  2409    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000007625  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4215  16S ribosomal RNA  94.85 
 
 		 1555 bp  2409    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000328918  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>