233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_4162 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_4367  hypothetical protein  99.51 
 
 
205 aa  418  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000932269  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4162  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  419  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0381893  hitchhiker  8.31038e-05 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5287  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  419  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00411387  hitchhiker  0.00913074 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4071  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  419  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.21216e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4318  hypothetical protein  99.51 
 
 
205 aa  418  1e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  6.8448e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4229  hypothetical protein  98.53 
 
 
204 aa  413  1e-115  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  2.19511e-05  normal  0.021598 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03688  hypothetical protein  99.51 
 
 
204 aa  414  1e-115  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.154507  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03739  predicted elongation factor  99.51 
 
 
204 aa  414  1e-115  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.190992  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4133  protein of unknown function UPF0029  99.02 
 
 
204 aa  413  1e-115  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0235776  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4311  hypothetical protein  92.16 
 
 
204 aa  357  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.521499  normal  0.36951 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4215  hypothetical protein  92.16 
 
 
204 aa  357  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000733457  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4371  hypothetical protein  92.16 
 
 
204 aa  357  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4192  hypothetical protein  91.67 
 
 
204 aa  355  4e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.121716  normal  0.896932 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4264  hypothetical protein  91.67 
 
 
204 aa  354  4e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3947  hypothetical protein  83.82 
 
 
204 aa  327  8e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.037804  decreased coverage  0.00180988 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0264  hypothetical protein  66.67 
 
 
204 aa  279  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00131939  normal  0.0250602 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0285  hypothetical protein  64.85 
 
 
203 aa  274  5e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.725e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1914  hypothetical protein  64.85 
 
 
203 aa  274  5e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00064118  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3931  hypothetical protein  64.85 
 
 
203 aa  274  5e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.457043  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4042  hypothetical protein  63.86 
 
 
203 aa  262  2e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0955788  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3745  hypothetical protein  59.8 
 
 
204 aa  251  4e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00302159  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3899  hypothetical protein  59.8 
 
 
204 aa  251  6e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00283954  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4232  hypothetical protein  62.38 
 
 
203 aa  251  7e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0996008  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2975  hypothetical protein  50.51 
 
 
204 aa  202  3e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00461  hypothetical protein  55.26 
 
 
207 aa  200  1e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001987  hypothetical protein  54.21 
 
 
207 aa  198  5e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0021  hypothetical protein  46.23 
 
 
204 aa  191  7e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0775164  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1571  hypothetical protein  53.81 
 
 
202 aa  189  2e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0023  hypothetical protein  47.24 
 
 
204 aa  187  8e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0020  hypothetical protein  46.23 
 
 
204 aa  187  8e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0022  protein of unknown function UPF0029  47.24 
 
 
204 aa  183  1e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  1.69816e-06 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0015  hypothetical protein  44.44 
 
 
204 aa  182  4e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.191945  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0023  hypothetical protein  46.97 
 
 
211 aa  181  6e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.815325  hitchhiker  0.000952494 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0018  hypothetical protein  46.23 
 
 
204 aa  181  8e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.919089  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0034  hypothetical protein  46.5 
 
 
206 aa  180  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0046667  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0196  elongation factor  45.18 
 
 
207 aa  180  1e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0020  hypothetical protein  45.73 
 
 
204 aa  180  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0743784  hitchhiker  0.000738865 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0022  hypothetical protein  46.23 
 
 
204 aa  179  3e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.977624  normal  0.0115925 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0018  hypothetical protein  45.23 
 
 
204 aa  178  6e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.464651  normal  0.0620683 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0605  hypothetical protein  51 
 
 
209 aa  177  7e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.313506  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0025  hypothetical protein  45.45 
 
 
204 aa  177  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.224364  normal  0.033343 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0015  hypothetical protein  44 
 
 
204 aa  176  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.536697  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0026  hypothetical protein  44.72 
 
 
204 aa  176  3e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0810004  hitchhiker  2.52745e-08 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0023  hypothetical protein  49.4 
 
 
176 aa  174  1e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0828384  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0017  hypothetical protein  42.93 
 
 
208 aa  172  3e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0014  hypothetical protein  46.83 
 
 
208 aa  171  6e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2535  hypothetical protein  50.25 
 
 
210 aa  169  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000701111  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2891  hypothetical protein  42 
 
 
205 aa  161  6e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373114  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0944  hypothetical protein  42.63 
 
 
242 aa  160  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.404461 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0899  protein of unknown function UPF0029  41.38 
 
 
211 aa  154  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  1.86376e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2481  hypothetical protein  38.12 
 
 
219 aa  149  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  39.36 
 
 
206 aa  149  4e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  38.5 
 
 
198 aa  147  1e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  1.27558e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1310  hypothetical protein  38.81 
 
 
205 aa  143  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00619746  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3177  protein of unknown function UPF0029  41.99 
 
 
274 aa  142  4e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1317  hypothetical protein  40.7 
 
 
208 aa  139  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000207664  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0638  hypothetical protein  41.58 
 
 
194 aa  136  3e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134379 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2192  hypothetical protein  37.43 
 
 
198 aa  133  2e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0770  hypothetical protein  39.9 
 
 
197 aa  132  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.634391  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  37.78 
 
 
198 aa  132  5e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0084  protein of unknown function UPF0029  41.62 
 
 
212 aa  131  5e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24840  hypothetical protein  40.76 
 
 
225 aa  131  6e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.070142  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0674  hypothetical protein  38.81 
 
 
197 aa  129  2e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  37.22 
 
 
198 aa  129  4e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  1.64661e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4570  hypothetical protein  38.95 
 
 
194 aa  128  5e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  5.82787e-07  normal  0.0106541 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06100  conserved hypothetical protein TIGR00257  44.17 
 
 
210 aa  126  2e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  36.67 
 
 
207 aa  125  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  6.70968e-07  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2757  hypothetical protein  39.44 
 
 
213 aa  123  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3126  hypothetical protein  35 
 
 
209 aa  123  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1191  hypothetical protein  36.22 
 
 
211 aa  121  8e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.952586  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2174  hypothetical protein  36.81 
 
 
201 aa  120  1e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.279701  normal  0.249309 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0593  hypothetical protein  40.53 
 
 
194 aa  120  2e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.195431  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0633  hypothetical protein  40.53 
 
 
194 aa  120  2e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  1.02941e-11  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3825  hypothetical protein  37 
 
 
245 aa  118  5e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366225  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5502  protein of unknown function UPF0029  37.5 
 
 
209 aa  118  6e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3700  hypothetical protein  38.66 
 
 
194 aa  118  7e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  35.48 
 
 
208 aa  117  1e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2867  hypothetical protein  32.98 
 
 
201 aa  117  1e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5111  hypothetical protein  38.74 
 
 
213 aa  117  2e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0248  hypothetical protein  38.54 
 
 
196 aa  117  2e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.895952  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01194  thymidylate synthase  39.25 
 
 
212 aa  116  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.43796  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8747  predicted protein  37.36 
 
 
190 aa  115  5e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.336863  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3148  protein of unknown function UPF0029  38.1 
 
 
194 aa  115  6e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3475  protein of unknown function UPF0029  37.7 
 
 
194 aa  115  6e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0246  hypothetical protein  32.29 
 
 
211 aa  115  6e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0682  hypothetical protein  36.7 
 
 
193 aa  114  7e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  3.48018e-11  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2485  protein of unknown function UPF0029  42.62 
 
 
204 aa  113  2e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.228916 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02100  hypothetical protein  37.97 
 
 
196 aa  113  2e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.482389 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2969  hypothetical protein  38.17 
 
 
200 aa  112  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3277  hypothetical protein  37.57 
 
 
195 aa  112  4e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.78794  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2225  protein of unknown function UPF0029  36.51 
 
 
195 aa  112  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1335  hypothetical protein  32.45 
 
 
221 aa  110  1e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  2.75512e-07  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1832  hypothetical protein  36.11 
 
 
195 aa  110  2e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971114  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2244  hypothetical protein  34.87 
 
 
194 aa  109  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891523  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3242  protein of unknown function UPF0029  34.59 
 
 
213 aa  109  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0695  hypothetical protein  38.58 
 
 
207 aa  109  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114041  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4048  hypothetical protein  36.41 
 
 
209 aa  109  4e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  decreased coverage  0.000882934 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6009  protein of unknown function UPF0029  33.85 
 
 
239 aa  108  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0733  hypothetical protein  34.66 
 
 
212 aa  108  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  3.37539e-08  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2223  protein of unknown function UPF0029  34.95 
 
 
200 aa  107  9e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.238524  normal  0.0468847 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>