More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_4147 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_4391  nitrogen regulation protein NR(II)  100 
 
 
349 aa  701    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.132536  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03754  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with GlnG  100 
 
 
349 aa  701    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4096  nitrogen regulation protein NR(II)  100 
 
 
349 aa  701    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4117  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  100 
 
 
349 aa  701    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03703  hypothetical protein  100 
 
 
349 aa  701    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5315  nitrogen regulation protein NR(II)  100 
 
 
349 aa  701    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.962522  normal  0.565649 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4097  nitrogen regulation protein NR(II)  91.98 
 
 
349 aa  650    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.744488 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4217  nitrogen regulation protein NR(II)  92.55 
 
 
349 aa  657    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.732813  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4334  nitrogen regulation protein NR(II)  92.55 
 
 
349 aa  657    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4254  nitrogen regulation protein NR(II)  99.43 
 
 
349 aa  698    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.388785 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4238  nitrogen regulation protein NR(II)  92.55 
 
 
349 aa  657    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.893304  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4288  nitrogen regulation protein NR(II)  92.26 
 
 
349 aa  655    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.15903  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4345  nitrogen regulation protein NR(II)  99.43 
 
 
349 aa  696    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4395  nitrogen regulation protein NR(II)  92.26 
 
 
349 aa  655    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4147  nitrogen regulation protein NR(II)  100 
 
 
349 aa  701    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.208237 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0028  nitrogen regulation protein NR(II)  86.53 
 
 
349 aa  618  1e-176  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.533996  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0026  nitrogen regulation protein NR(II)  86.53 
 
 
349 aa  618  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.968773  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4190  nitrogen regulation protein NR(II)  86.53 
 
 
349 aa  618  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.497456  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4882  nitrogen regulation protein NR(II)  85.39 
 
 
349 aa  614  1e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.191848  hitchhiker  0.00011549 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3961  nitrogen regulation protein NR(II)  85.1 
 
 
349 aa  586  1e-166  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138406  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4158  nitrogen regulation protein NR(II)  85.67 
 
 
349 aa  586  1e-166  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.128409  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4504  nitrogen regulation protein NR(II)  84.81 
 
 
349 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.456995  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4221  nitrogen regulation protein NR(II)  84.53 
 
 
349 aa  580  1e-164  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.314539  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001907  nitrogen regulation protein NR(II)  60.29 
 
 
348 aa  414  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00585  nitrogen regulation protein NR(II)  60.42 
 
 
336 aa  410  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2320  nitrogen regulation protein NR(II)  58.82 
 
 
354 aa  395  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0321  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  51.16 
 
 
345 aa  345  8.999999999999999e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0267  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  53.64 
 
 
348 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0262  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  53.35 
 
 
348 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.507954 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0267  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  53.64 
 
 
348 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0259  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  53.06 
 
 
348 aa  333  2e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0258  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  52.48 
 
 
348 aa  333  2e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000414466 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3763  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  52.48 
 
 
348 aa  333  2e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0259  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  52.48 
 
 
348 aa  333  3e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.627159  hitchhiker  0.00000191471 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3457  ATP-binding region, ATPase-like protein  48.84 
 
 
345 aa  332  8e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0871385  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4471  nitrogen regulation protein  51.9 
 
 
348 aa  328  8e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3487  sensor histidine kinase  48.41 
 
 
356 aa  327  2.0000000000000001e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0596493 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0283  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  49.28 
 
 
346 aa  325  5e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000323653 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3929  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  51.3 
 
 
346 aa  324  2e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4650  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  48.7 
 
 
348 aa  323  2e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.617913 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0372  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  52.77 
 
 
348 aa  322  8e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3426  nitrogen regulation protein  50.58 
 
 
348 aa  319  5e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.204004 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3560  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  49.57 
 
 
351 aa  318  7e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1027  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  49.28 
 
 
359 aa  316  4e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.296373  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01589  nitrogen regulation protein NR(II)  47.04 
 
 
361 aa  316  5e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0398  nitrogen regulation protein NR(II)  49.13 
 
 
371 aa  314  9.999999999999999e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.737334  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5858  two-component sensor NtrB  47.85 
 
 
358 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5100  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  47.56 
 
 
361 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4922  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  47.56 
 
 
361 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4821  sensor histidine kinase  46.7 
 
 
361 aa  300  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5047  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  47.28 
 
 
361 aa  299  4e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0353  nitrogen regulation protein NtrB  46.42 
 
 
361 aa  299  4e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4143  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.57 
 
 
362 aa  299  4e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67670  two-component sensor NtrB  47.56 
 
 
358 aa  299  4e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45890  histidine protein kinase, nitrogen regulation protein NtrB (NR(II))  46.8 
 
 
361 aa  296  4e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0340  Signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  46.31 
 
 
361 aa  294  1e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0416  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  46.99 
 
 
361 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.994306 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0735  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  45.53 
 
 
385 aa  293  3e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0331289  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0015  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  46.7 
 
 
350 aa  287  2e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.327507  normal  0.905375 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3261  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  46.63 
 
 
355 aa  286  4e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0767  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  45.24 
 
 
374 aa  283  3.0000000000000004e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911717  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2542  nitrogen regulation protein NR(II)  46.96 
 
 
364 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0500  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.6 
 
 
357 aa  280  2e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000409707  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0245  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  46.04 
 
 
365 aa  280  2e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3759  sensor histidine kinase  45.77 
 
 
356 aa  280  3e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.211414 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2449  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  44.74 
 
 
365 aa  275  7e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000168694  normal  0.861586 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1216  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  45.53 
 
 
357 aa  270  2e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3650  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  46.44 
 
 
358 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.051036  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1260  nitrogen regulation(sensor protein kinase transcription regulator  44.96 
 
 
361 aa  256  6e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.578512  normal  0.700442 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0049  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  43.84 
 
 
365 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5000  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  42.3 
 
 
358 aa  245  6.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2501  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  41.83 
 
 
363 aa  245  8e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2778  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  41.03 
 
 
365 aa  242  6e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.549805  normal  0.0478149 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2902  nitrogen regulation protein NR(II)  40.75 
 
 
361 aa  241  1e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2520  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  40.75 
 
 
361 aa  241  1e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3152  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  42.17 
 
 
363 aa  236  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.806618 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2055  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  41.29 
 
 
393 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.512531  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1444  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  39.89 
 
 
361 aa  236  4e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.852628  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1809  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  41.13 
 
 
366 aa  235  9e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.7833  hitchhiker  0.0000312288 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1088  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  50.2 
 
 
400 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.943644  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2981  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  39.03 
 
 
368 aa  232  6e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1634  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  39.22 
 
 
359 aa  230  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1254  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  39.34 
 
 
377 aa  229  4e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00721446  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0257  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  40.06 
 
 
381 aa  229  4e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1123  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  42.45 
 
 
393 aa  229  4e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.25113 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1181  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  49.4 
 
 
399 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2074  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  47.6 
 
 
373 aa  228  1e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.673281 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2060  signal transduction histidine kinase NtrB  41.21 
 
 
387 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.281359  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1845  nitrogen regulation protein  41.76 
 
 
395 aa  226  6e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2166  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  41.6 
 
 
380 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5929  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  41.6 
 
 
380 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.516447  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2148  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  41.6 
 
 
380 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3583  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  49 
 
 
357 aa  225  7e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.998246 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1111  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  47.81 
 
 
362 aa  225  9e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2058  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  41.88 
 
 
380 aa  225  9e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.778281  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2185  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  41.88 
 
 
380 aa  225  9e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.374753  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1191  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  47.81 
 
 
362 aa  225  9e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.310962  normal  0.462311 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5457  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  41.88 
 
 
380 aa  225  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1741  nitrogen regulation protein  42.17 
 
 
357 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.546015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1523  nitrogen regulation protein NR(II)  42.17 
 
 
380 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>