More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_4136 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009800  EcHS_A4107  major facilitator transporter  100 
 
 		 477 aa  947    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.338047  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1045  major facilitator transporter  69.98 
 
 		 478 aa  655    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4136  major facilitator transporter  100 
 
 		 477 aa  947    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0025  major facilitator family transporter  33.41 
 
 		 454 aa  263  4e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2161  major facilitator transporter  32.73 
 
 		 514 aa  232  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2481  major facilitator transporter  32.12 
 
 		 496 aa  227  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6518  major facilitator transporter  29.94 
 
 		 475 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6752  major facilitator transporter  29.94 
 
 		 475 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0303663 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0113  major facilitator transporter  33.12 
 
 		 499 aa  226  6e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6341  major facilitator transporter  29.72 
 
 		 475 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7502  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 475 aa  223  7e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0253072  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1172  MFS transporter  30.54 
 
 		 489 aa  209  9e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.537598  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1432  major facilitator family transporter  30.54 
 
 		 489 aa  209  9e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1518  major facilitator superfamily permease  30.54 
 
 		 489 aa  209  9e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28243  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1443  major facilitator transporter  31.96 
 
 		 493 aa  209  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0027  putative sugar transport protein  30.54 
 
 		 489 aa  207  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.225858  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1122  major facilitator transporter  31.97 
 
 		 482 aa  183  5.0000000000000004e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4579  major facilitator transporter  32.54 
 
 		 487 aa  178  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4363  major facilitator superfamily MFS_1  32.03 
 
 		 478 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5446  putative MFS superfamily transport protein  29.68 
 
 		 484 aa  176  6e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2083  major facilitator transporter  31.52 
 
 		 507 aa  172  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.835156  normal  0.347938 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2459  major facilitator transporter  30.13 
 
 		 471 aa  171  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489656  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0325  major facilitator superfamily MFS_1  28.81 
 
 		 477 aa  127  6e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.184754  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0730  General substrate transporter  29.36 
 
 		 464 aa  125  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  25.48 
 
 		 476 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2255  general substrate transporter  25.06 
 
 		 446 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000684239  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1804  major facilitator transporter  25.68 
 
 		 470 aa  113  7.000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000239079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3234  general substrate transporter  26.37 
 
 		 445 aa  105  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4043  general substrate transporter  25.85 
 
 		 452 aa  104  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1829  General substrate transporter  25.35 
 
 		 480 aa  99  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.392144  normal  0.18053 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  28.94 
 
 		 438 aa  99  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  27.55 
 
 		 438 aa  97.4  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3608  general substrate transporter  26.42 
 
 		 469 aa  97.4  5e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  26.94 
 
 		 526 aa  95.1  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.521864 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0861  major facilitator superfamily MFS_1  25.87 
 
 		 483 aa  95.1  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2681  general substrate transporter  25.07 
 
 		 438 aa  94.4  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.31051 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0049  major facilitator family transporter  24.93 
 
 		 443 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00049  predicted transporter  24.93 
 
 		 443 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3610  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 443 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0100231 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3554  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 		 443 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0051  major facilitator family transporter  24.93 
 
 		 443 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00048  hypothetical protein  24.93 
 
 		 443 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0047  major facilitator family transporter  24.93 
 
 		 443 aa  92  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.454742 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0049  major facilitator family transporter  24.93 
 
 		 443 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2518  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 437 aa  90.5  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1759  major facilitator superfamily MFS_1  23.49 
 
 		 472 aa  89.4  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  25.25 
 
 		 446 aa  88.6  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2828  major facilitator transporter  25.45 
 
 		 457 aa  88.6  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  23.39 
 
 		 451 aa  88.6  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6930  major facilitator superfamily MFS_1  24.88 
 
 		 460 aa  87.4  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0278  major facilitator transporter  24.17 
 
 		 441 aa  87  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.672912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2277  major facilitator family transporter  25.97 
 
 		 465 aa  86.7  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1924  major facilitator superfamily MFS_1  25.97 
 
 		 465 aa  86.7  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  25.89 
 
 		 459 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0578  general substrate transporter  26.74 
 
 		 458 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0089  putative metabolite transport protein YaaU  25.06 
 
 		 468 aa  84  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.343682  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0086  putative metabolite transport protein YaaU  25.06 
 
 		 468 aa  84  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.509383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0085  putative metabolite transport protein YaaU  24.51 
 
 		 468 aa  84  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0088  putative metabolite transport protein YaaU  25.06 
 
 		 468 aa  84  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0085  putative metabolite transport protein YaaU  24.51 
 
 		 468 aa  84  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2467  major facilitator transporter  25.69 
 
 		 453 aa  82.4  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2238  glucose transport protein  24.15 
 
 		 471 aa  82.8  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3564  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 436 aa  82  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0694  General substrate transporter  24.03 
 
 		 459 aa  82.4  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  26.16 
 
 		 455 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  27.11 
 
 		 472 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4111  major facilitator transporter  25.96 
 
 		 442 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  25.51 
 
 		 448 aa  80.5  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  23.33 
 
 		 457 aa  80.5  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3193  major facilitator transporter  23.24 
 
 		 472 aa  80.1  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.9008 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  26.63 
 
 		 472 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02616  predicted transporter  26.33 
 
 		 445 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3073  major facilitator family transporter  26.33 
 
 		 445 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.392352  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0917  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 		 469 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0532  major facilitator family transporter  25 
 
 		 436 aa  79.7  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0462  major facilitator family transporter  25 
 
 		 436 aa  79.7  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0941  major facilitator transporter  26.33 
 
 		 445 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3102  major facilitator family transporter  26.33 
 
 		 445 aa  79.3  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000189575  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02579  hypothetical protein  26.33 
 
 		 445 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1094  major facilitator transporter  22.33 
 
 		 427 aa  78.6  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3364  major facilitator superfamily MFS_1  24.19 
 
 		 463 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09740  putative MFS transporter  26.09 
 
 		 442 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00809883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1408  major facilitator transporter  25.39 
 
 		 484 aa  78.2  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0000966462  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3655  major facilitator superfamily MFS_1  26.01 
 
 		 447 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.304643  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4664  sugar transporter  25.38 
 
 		 475 aa  78.2  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2911  major facilitator family transporter  26.33 
 
 		 445 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  22.95 
 
 		 423 aa  77.4  0.0000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2900  major facilitator family transporter  26.32 
 
 		 445 aa  77.4  0.0000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9266  major facilitator transporter  28.14 
 
 		 479 aa  77  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.248133 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  25.92 
 
 		 455 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 473 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1373  major facilitator transporter  26.34 
 
 		 443 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4699  sugar transporter  23.01 
 
 		 477 aa  75.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  24.23 
 
 		 474 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2499  major facilitator transporter  25.35 
 
 		 465 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728984 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  23.14 
 
 		 451 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  25.51 
 
 		 474 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2628  major facilitator transporter  25.35 
 
 		 465 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0717  major facilitator transporter  26.83 
 
 		 530 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.320017 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1809  major facilitator family protein  26.15 
 
 		 499 aa  73.9  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>