62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_3889 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_5802  hypothetical protein  99.57 
 
 		 235 aa  488  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0396159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4823  hypothetical protein  99.57 
 
 		 235 aa  488  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3889  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  489  1e-137  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0452  hypothetical protein  46.19 
 
 		 229 aa  223  2e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0241337  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1500  OmpA/MotB domain protein  44.25 
 
 		 253 aa  201  9e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0007  hypothetical protein  41.81 
 
 		 248 aa  180  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.231859  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6677  hypothetical protein  32.33 
 
 		 222 aa  96.3  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000431405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3412  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like protein  27.4 
 
 		 220 aa  74.3  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1217  OmpA/MotB domain protein  36.31 
 
 		 385 aa  71.6  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000964512  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1663  hypothetical protein  28.78 
 
 		 575 aa  68.2  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3877  OmpA/MotB domain protein  27.23 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  30.67 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0872  OmpA/MotB  23.22 
 
 		 211 aa  52  0.000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00178766  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0911  chemotaxis protein MotB, putative  29.06 
 
 		 316 aa  50.4  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0745423  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0654  OmpA/MotB domain protein  33.81 
 
 		 275 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2959  hypothetical protein  26.15 
 
 		 450 aa  50.4  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.775689  normal  0.565326 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1218  putative chemotaxis protein MotB  30.5 
 
 		 337 aa  50.8  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0641  OmpA/MotB domain-containing protein  26.67 
 
 		 243 aa  48.5  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149088  normal  0.564941 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1070  chemotaxis protein MotB, putative  27.78 
 
 		 317 aa  48.5  0.00009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.98925  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4617  hypothetical protein  24.08 
 
 		 247 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179085 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  27.57 
 
 		 224 aa  48.5  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6041  flagellar motor protein  22.51 
 
 		 254 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2098  OmpA/MotB domain-containing protein  25.87 
 
 		 338 aa  48.5  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0859782  hitchhiker  0.000615141 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2336  OmpA/MotB domain protein  25.7 
 
 		 295 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.279433  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1073  OmpA/MotB domain protein  30.16 
 
 		 257 aa  48.1  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1181  OmpA/MotB domain protein  25.73 
 
 		 305 aa  48.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.156303 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1084  OmpA/MotB domain protein  26.02 
 
 		 241 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0702  chemotaxis protein MotB, putative  27.22 
 
 		 317 aa  47.4  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.66676  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  30.43 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  33.08 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4587  hypothetical protein  23.68 
 
 		 234 aa  47.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0880  OmpA/MotB  32.28 
 
 		 597 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270978  hitchhiker  0.000179778 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0627  chemotaxis protein MotB, putative  27.22 
 
 		 317 aa  46.6  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0238  OmpA/MotB domain protein  29.59 
 
 		 268 aa  46.6  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  28.39 
 
 		 294 aa  46.2  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1171  MotB-like flagellar protein  27.64 
 
 		 247 aa  46.2  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3786  chemotaxis protein MotB-related protein  23.95 
 
 		 243 aa  45.8  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1587  OmpA/MotB  28.28 
 
 		 259 aa  45.8  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000101337  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0835  OmpA/MotB domain protein  26.36 
 
 		 264 aa  45.8  0.0006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.376588  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  27.95 
 
 		 225 aa  45.4  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3595  OmpA/MotB domain-containing protein  32.56 
 
 		 202 aa  45.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  28.39 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0517  chemotaxis protein MotB, putative  27.15 
 
 		 334 aa  45.1  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  32.33 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0999  OmpA/MotB domain-containing protein  27.84 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31110  flagellar motor protein  24.67 
 
 		 295 aa  45.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.529946  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26560  putative outer membrane protein precursor  24.11 
 
 		 269 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.304401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  29.92 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4266  hypothetical protein  21.78 
 
 		 235 aa  44.3  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0432  OmpA/MotB domain-containing protein  30.65 
 
 		 200 aa  43.9  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.161803  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  30.43 
 
 		 319 aa  44.3  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_009656  PSPA7_2254  outer membrane protein  24.11 
 
 		 269 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374257  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  24.22 
 
 		 215 aa  43.5  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0782  OmpA/MotB  26.32 
 
 		 256 aa  42.7  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0172196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3914  OmpA/MotB  26.92 
 
 		 658 aa  42.7  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3617  OmpA/MotB domain-containing protein  26.98 
 
 		 228 aa  42.7  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  32.97 
 
 		 1987 aa  42.4  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3735  OmpA/MotB domain-containing protein  23.01 
 
 		 223 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0166523 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1741  OmpA/MotB  27.1 
 
 		 244 aa  42.4  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.595985 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0967  OmpA/MotB domain protein  27.27 
 
 		 313 aa  42.4  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4629  OmpA/MotB  23.01 
 
 		 223 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.313195  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0852  OmpA/MotB domain-containing protein  25.35 
 
 		 290 aa  42  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.755762  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>