More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_3418 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_3418  peptidase M23B  100 
 
 		 245 aa  499  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0266  peptidase M23B  99.18 
 
 		 245 aa  495  1e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4303  peptidase M23B  99.18 
 
 		 245 aa  495  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.616883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2250  hypothetical protein  39.24 
 
 		 470 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0038093  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2425  hypothetical protein  41.9 
 
 		 439 aa  172  5.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000232327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2049  hypothetical protein  40.48 
 
 		 439 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.245619  normal  0.249878 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1234  hypothetical protein  40.48 
 
 		 439 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00307381  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1358  hypothetical protein  40.48 
 
 		 439 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370523 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2104  hypothetical protein  40.48 
 
 		 439 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.391602  normal  0.665324 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2044  hypothetical protein  40.48 
 
 		 439 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.713076  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01827  predicted peptidase  40.95 
 
 		 419 aa  169  3e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000774309  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1784  Peptidase M23  40.95 
 
 		 440 aa  169  3e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000497391  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1949  hypothetical protein  40.95 
 
 		 440 aa  169  3e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0407362  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0952  hypothetical protein  40.95 
 
 		 440 aa  169  3e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000381632  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1776  hypothetical protein  40.95 
 
 		 440 aa  169  3e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000317074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2592  hypothetical protein  40.95 
 
 		 440 aa  169  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000737786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1330  hypothetical protein  40.95 
 
 		 440 aa  169  3e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2086  hypothetical protein  40.95 
 
 		 440 aa  169  3e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000391864  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01815  hypothetical protein  40.95 
 
 		 440 aa  169  3e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000786117  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1828  hypothetical protein  39.34 
 
 		 440 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000168261  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2112  hypothetical protein  38.86 
 
 		 441 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000011239  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2141  hypothetical protein  36.71 
 
 		 486 aa  163  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.0000028881  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2772  hypothetical protein  37.14 
 
 		 440 aa  159  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000802583  hitchhiker  0.00694213 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0853  exported peptidase  38.11 
 
 		 446 aa  159  5e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.141822  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2416  hypothetical protein  37.14 
 
 		 410 aa  159  5e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000144361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2026  hypothetical protein  37.14 
 
 		 438 aa  159  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148125  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2139  hypothetical protein  37.14 
 
 		 438 aa  159  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000192356  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2504  peptidase M23B  38.79 
 
 		 423 aa  157  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.331029  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1678  peptidase M23B  36.36 
 
 		 433 aa  155  6e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0411923  normal  0.669465 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1656  peptidase M23B  36.36 
 
 		 433 aa  155  6e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000516182  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2702  Peptidase M23  36.36 
 
 		 433 aa  155  6e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000811311  hitchhiker  0.0000822209 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1641  peptidase M23B  36.36 
 
 		 433 aa  155  6e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000435092  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1269  M24/M37 family peptidase  37.44 
 
 		 419 aa  154  9e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.711589  hitchhiker  0.00022496 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2842  M24/M37 family peptidase  36.75 
 
 		 434 aa  154  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001428  cell wall endopeptidase family M23/M37  39.66 
 
 		 404 aa  152  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0015397  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1590  peptidase M23B  37.66 
 
 		 424 aa  152  4e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0596835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2448  peptidase M23B  35.06 
 
 		 431 aa  150  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.093884  hitchhiker  0.000000000665253 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2518  peptidase M23B  35.06 
 
 		 431 aa  150  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0290484  unclonable  0.0000200771 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2610  peptidase M23B  35.06 
 
 		 431 aa  150  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.326466  hitchhiker  0.000000038042 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2632  peptidase M23B  38.36 
 
 		 418 aa  149  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.252347  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3011  peptidase M23B  37.9 
 
 		 482 aa  149  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.698295 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1036  metalloprotease  35.25 
 
 		 458 aa  148  7e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0193125  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3225  peptidase M23B  36.97 
 
 		 443 aa  148  8e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.755339  normal  0.375504 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2450  peptidase M23B  34.84 
 
 		 428 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0060  hypothetical protein  35.68 
 
 		 430 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  5.86289e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06306  peptidase  37.83 
 
 		 439 aa  146  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1533  peptidase M23B  34.63 
 
 		 431 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00239746  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3059  peptidase M23B  37.23 
 
 		 438 aa  144  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00145951  normal  0.0144005 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2455  peptidase M23B  36.36 
 
 		 418 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0186992  unclonable  0.00000341195 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1134  peptidase M23B  35.59 
 
 		 550 aa  136  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000017693  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05603  hypothetical protein  34.74 
 
 		 439 aa  135  5e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1077  Peptidase M23  37.37 
 
 		 507 aa  135  8e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.391765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002595  membrane protein  34.55 
 
 		 353 aa  122  8e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000185495  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03413  hypothetical protein  33.18 
 
 		 429 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0159  hypothetical protein  32.73 
 
 		 433 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424474  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05623  hypothetical protein  28.81 
 
 		 328 aa  113  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2881  peptidase M23B  30.41 
 
 		 466 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000532238  hitchhiker  0.00000791404 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1127  peptidase M23B  30.09 
 
 		 468 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000608337  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2963  peptidase M23B  29.95 
 
 		 491 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00002101  normal  0.0112469 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3059  peptidase M23B  29.95 
 
 		 466 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000244164  normal  0.0231551 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3144  Peptidase M23  30.09 
 
 		 468 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0015226  normal  0.847017 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1169  peptidase M23B  30.09 
 
 		 468 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000504545  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1246  peptidase M23B  30.09 
 
 		 468 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00321659  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1213  peptidase M23B  29.63 
 
 		 468 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0214324  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2811  peptidase M23B  30.88 
 
 		 472 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000654378  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1868  peptidase M23B  43.31 
 
 		 460 aa  108  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0849  M24/M37 family peptidase  33.97 
 
 		 462 aa  108  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0168749  normal  0.445111 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1314  M24/M37 family peptidase  29.63 
 
 		 482 aa  107  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2030  Peptidase M23  34.8 
 
 		 470 aa  106  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2972  peptidase M23B  29.29 
 
 		 512 aa  105  5e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000246824  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  28.7 
 
 		 470 aa  105  6e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1103  peptidase M23B  29.17 
 
 		 475 aa  105  9e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.123313 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000457  peptidase M23  30.84 
 
 		 325 aa  102  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2568  putative membrane associated peptidase  30.59 
 
 		 436 aa  102  6e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0102631  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1211  peptidase M23B  27.98 
 
 		 475 aa  100  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0168861  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2472  metalloendopeptidase-like membrane protein  33.5 
 
 		 441 aa  100  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000271454  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  30.22 
 
 		 377 aa  98.6  7e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3063  peptidase M23B  42.5 
 
 		 377 aa  97.1  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000502081  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1021  peptidase M23B  27.16 
 
 		 491 aa  97.4  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000137565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23480  peptidase M23B  41.8 
 
 		 334 aa  96.7  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  31.25 
 
 		 498 aa  96.7  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  39.52 
 
 		 430 aa  95.9  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  37.98 
 
 		 367 aa  95.5  7e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  30 
 
 		 475 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0472  Peptidase M23  41.32 
 
 		 223 aa  94.7  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2504  Peptidase M23  37.04 
 
 		 290 aa  94.7  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.241623  normal  0.0435896 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  29.31 
 
 		 490 aa  92.8  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  30.13 
 
 		 470 aa  92.4  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4692  peptidase M23B  37.4 
 
 		 302 aa  92  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574974  normal  0.126416 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  40.46 
 
 		 352 aa  92  8e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  39.68 
 
 		 445 aa  92  8e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  30.1 
 
 		 439 aa  91.3  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  37.7 
 
 		 423 aa  91.7  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  38.1 
 
 		 346 aa  90.5  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  37.5 
 
 		 238 aa  90.5  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  37.82 
 
 		 363 aa  90.1  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  26.41 
 
 		 480 aa  90.1  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1087  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  28.45 
 
 		 460 aa  90.1  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00818194  normal  0.118313 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  39.66 
 
 		 233 aa  90.1  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  37.4 
 
 		 442 aa  89.7  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>