More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_3391 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_3378  type III secretion FHIPEP protein  97.56 
 
 
579 aa  1140    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3430  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.69 
 
 
705 aa  658    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0622  flagellar biosynthesis protein FlhA  67.25 
 
 
698 aa  964    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3988  flagellar biosynthesis protein FlhA  59.12 
 
 
697 aa  744    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3485  flagellar biosynthesis protein FlhA  60.06 
 
 
693 aa  756    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001176  flagellar biosynthesis protein FlhA  60.5 
 
 
696 aa  764    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4644  type III secretion FHIPEP protein  57.97 
 
 
696 aa  768    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207433  normal  0.243836 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0263  protein FhiA  98.08 
 
 
579 aa  1147    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0093  flagellar biosynthesis protein FlhA  58.13 
 
 
693 aa  765    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0243  flagellar biosynthesis protein FlhA  66.96 
 
 
698 aa  961    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0111317 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0163  flagellar biosynthesis protein FlhA  57.96 
 
 
696 aa  796    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0259  FHIPEP family type III secretion protein  98.08 
 
 
579 aa  1144    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0211  flagellar biosynthesis protein FlhA  58.11 
 
 
696 aa  813    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0241  lateral flagellar export/assembly protein LfhA  99.43 
 
 
697 aa  1399    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04963  flagellar biosynthesis pathway, component FlhA  60 
 
 
696 aa  779    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3668  flagellar biosynthesis protein FlhA  58.3 
 
 
693 aa  712    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0274  type III secretion protein, FHIPEP family  98.6 
 
 
579 aa  1154    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.807219 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4426  flagellar biosynthesis protein FlhA  63.9 
 
 
698 aa  897    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.47767 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00228  hypothetical protein  98.6 
 
 
570 aa  1146    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6779  type III secretion FHIPEP protein  58.41 
 
 
696 aa  779    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.702443  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3391  type III secretion FHIPEP protein  100 
 
 
697 aa  1408    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0087  flagellar biosynthesis protein FlhA  58.3 
 
 
693 aa  795    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0364653 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3597  type III secretion FHIPEP protein  53.07 
 
 
695 aa  747    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.69729  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0702  flagellar biosynthesis protein FlhA  67.1 
 
 
697 aa  964    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.628209  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3875  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.71 
 
 
707 aa  629  1e-179  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.547904  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1560  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.14 
 
 
709 aa  627  1e-178  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.253962 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45680  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.71 
 
 
707 aa  628  1e-178  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.589215 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3670  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.28 
 
 
709 aa  627  1e-178  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2808  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.85 
 
 
715 aa  620  1e-176  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18652  normal  0.0746951 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1523  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.51 
 
 
748 aa  619  1e-176  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.403932  normal  0.346987 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4344  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.36 
 
 
709 aa  616  1e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.265021 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3033  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.48 
 
 
700 aa  615  1e-175  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1296  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.52 
 
 
699 aa  616  1e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1363  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.52 
 
 
699 aa  616  1e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.960302 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1356  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.52 
 
 
699 aa  616  1e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.212501 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0744  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.4 
 
 
697 aa  612  9.999999999999999e-175  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2293  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.71 
 
 
697 aa  605  9.999999999999999e-173  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02873  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.47 
 
 
699 aa  607  9.999999999999999e-173  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.656306  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1632  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.48 
 
 
699 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3052  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.71 
 
 
700 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0382146 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2283  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.75 
 
 
699 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2912  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.65 
 
 
699 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3054  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.65 
 
 
699 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.921062  normal  0.080885 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2562  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.02 
 
 
699 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1451  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.65 
 
 
699 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2922  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.65 
 
 
699 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.268541  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1978  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.4 
 
 
724 aa  602  1.0000000000000001e-171  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03147  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.71 
 
 
699 aa  600  1e-170  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1865  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.73 
 
 
702 aa  599  1e-170  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.443827  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1340  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.36 
 
 
699 aa  597  1e-169  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1375  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.68 
 
 
699 aa  597  1e-169  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.361202  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0982  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.2 
 
 
706 aa  595  1e-169  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.121658 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1393  flagellar biosynthesis FlhA transmembrane protein  45.39 
 
 
696 aa  595  1e-168  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.203699  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1516  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.91 
 
 
700 aa  592  1e-168  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1976  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.5 
 
 
709 aa  593  1e-168  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0869734  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002829  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.71 
 
 
710 aa  594  1e-168  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.192005  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3213  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.96 
 
 
699 aa  590  1e-167  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3440  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.35 
 
 
709 aa  590  1e-167  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.520758 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2158  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.56 
 
 
690 aa  589  1e-167  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1172  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.31 
 
 
703 aa  591  1e-167  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.167459 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1380  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.92 
 
 
699 aa  587  1e-166  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.329367 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5616  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.51 
 
 
693 aa  588  1e-166  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114145  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3913  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.98 
 
 
709 aa  585  1e-166  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.11934  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1749  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.09 
 
 
692 aa  585  1.0000000000000001e-165  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1749  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.72 
 
 
692 aa  584  1.0000000000000001e-165  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1335  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.31 
 
 
697 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1196  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.06 
 
 
699 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1657  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.07 
 
 
697 aa  582  1.0000000000000001e-165  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0357682  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2167  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.45 
 
 
755 aa  577  1.0000000000000001e-163  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1945  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.05 
 
 
690 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4179  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.03 
 
 
708 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4067  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.03 
 
 
708 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67458  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3699  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.51 
 
 
695 aa  574  1.0000000000000001e-162  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0172867 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1520  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.56 
 
 
698 aa  569  1e-161  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1548  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.2 
 
 
698 aa  570  1e-161  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1863  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.34 
 
 
693 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.707218  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06205  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.88 
 
 
684 aa  560  1e-158  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.127059  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2976  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.87 
 
 
692 aa  560  1e-158  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00961  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.88 
 
 
684 aa  560  1e-158  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.21205  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3093  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.24 
 
 
694 aa  556  1e-157  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.753258  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0599  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.7 
 
 
699 aa  556  1e-157  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3820  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.09 
 
 
694 aa  555  1e-156  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.136206 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2015  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.33 
 
 
695 aa  551  1e-155  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.372336  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1246  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.67 
 
 
692 aa  548  1e-154  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.932165  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1761  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.82 
 
 
692 aa  542  1e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.98256  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3803  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.92 
 
 
700 aa  543  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3169  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.77 
 
 
700 aa  543  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3056  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.14 
 
 
696 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3129  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.77 
 
 
700 aa  542  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3924  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.77 
 
 
700 aa  542  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.932271  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2846  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.77 
 
 
700 aa  542  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0740  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.7 
 
 
694 aa  540  9.999999999999999e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0062  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.77 
 
 
700 aa  542  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3843  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.77 
 
 
700 aa  542  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0426  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.28 
 
 
694 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3707  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.63 
 
 
693 aa  542  9.999999999999999e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.306788  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3767  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.57 
 
 
692 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3851  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.57 
 
 
692 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167765 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4413  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.27 
 
 
693 aa  539  9.999999999999999e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.402008  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3422  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.77 
 
 
700 aa  542  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.545221  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>