119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_3380 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_3380  flagellar assembly protein H  100 
 
 		 236 aa  477  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.972464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0252  flagellar assembly protein H  98.73 
 
 		 236 aa  473  1e-133  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0713  flagellar assembly protein H  46.09 
 
 		 238 aa  218  7e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0232  flagellar assembly protein H  46.09 
 
 		 238 aa  218  7.999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.310336 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0633  flagellar assembly protein H  45.65 
 
 		 238 aa  216  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4415  flagellar assembly protein H  46.35 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.127482 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001188  flagellar assembly protein FliH  38.86 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04975  flagellar assembly protein H  39.3 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0075  flagellar assembly protein H  36.21 
 
 		 252 aa  143  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3657  flagellar assembly protein H  36.04 
 
 		 235 aa  138  7e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3474  flagellar assembly protein H  34.19 
 
 		 235 aa  132  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3977  flagellar assembly protein H  33.62 
 
 		 236 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0225  flagellar assembly protein H  35.91 
 
 		 242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0173  flagellar assembly protein H  35 
 
 		 241 aa  125  7e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0081  flagellar assembly protein H  30.8 
 
 		 251 aa  124  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4657  flagellar assembly protein FliH  33.53 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.275761 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0711  flagellar assembly protein FliH  29.95 
 
 		 295 aa  89  6e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487054 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1995  flagellar assembly protein FliH  28.63 
 
 		 296 aa  85.1  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1504  flagellar assembly protein H  27.62 
 
 		 262 aa  84.7  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3563  flagellar assembly protein FliH  22.54 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4268  flagellar assembly protein H  31.29 
 
 		 267 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1967  flagellar assembly protein FliH  34.78 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.147072  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1620  flagellar assembly protein FliH  25.95 
 
 		 324 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0496  flagellar assembly protein FliH  30.72 
 
 		 307 aa  77.8  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1368  flagellar assembly protein FliH  29.67 
 
 		 339 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3045  flagellar assembly protein H  26.67 
 
 		 266 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02887  flagellar assembly protein H  27.69 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1363  flagellar assembly protein FliH  25.13 
 
 		 316 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1538  flagellar assembly protein H  28.48 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50110  flagellar assembly protein H  29.45 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973712 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1715  flagellar assembly protein H  28.8 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3928  flagellar assembly protein H  29.59 
 
 		 260 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2823  flagellar assembly protein H  26.38 
 
 		 266 aa  71.6  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283065  normal  0.0158669 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1184  flagellar assembly protein H  25.56 
 
 		 403 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3064  flagellar assembly protein FliH  23.08 
 
 		 334 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4367  flagellar assembly protein H  28.99 
 
 		 263 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.631289 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1960  flagellar assembly protein Flih, putative  27.27 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31844  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2186  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like  25.39 
 
 		 349 aa  70.5  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2306  flagellar assembly protein H  25.34 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1500  flagellar assembly protein H  28.4 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2574  flagellar assembly protein H  23.2 
 
 		 318 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.412103  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3455  flagellar assembly protein H  26.06 
 
 		 272 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1351  flagellar assembly protein H  25.41 
 
 		 316 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.143361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5263  flagellar assembly protein H  24.47 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16543  normal  0.0759214 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1284  flagellar assembly protein H  25.41 
 
 		 316 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3692  flagellar assembly protein H  28.99 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.438422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002817  flagellar assembly protein FliH  26.04 
 
 		 266 aa  66.2  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2295  flagellar assembly protein H  25.41 
 
 		 300 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03160  flagellar assembly protein H  26.56 
 
 		 266 aa  65.5  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3226  flagellar assembly protein H  22.8 
 
 		 316 aa  64.7  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0771  flagellar assembly protein FliH  25.62 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.24197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5099  flagellar assembly protein H  26.06 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.484808  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1326  flagellar assembly protein H  23.81 
 
 		 375 aa  64.3  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2357  flagellar assembly protein FliH  25.33 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0198  flagellar assembly protein H  23.63 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0392  flagellar assembly protein H  27.17 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1344  flagellar assembly protein H  23.78 
 
 		 320 aa  62.8  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388859 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3279  flagellar assembly protein H  25.27 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0415  flagellar assembly protein H  25.27 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.359601  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2944  flagellar assembly protein H  25.27 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.122685  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2144  flagellar assembly protein H  25.27 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0232  flagellar assembly protein H  25.27 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0216224  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3402  flagellar assembly protein H  25.27 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24210  Flagellar assembly protein  25.41 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0165568  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0220  flagellar assembly protein H  24.6 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.188523  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1347  flagellar assembly protein FliH  26.06 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2934  flagellar assembly protein H  23.76 
 
 		 338 aa  58.9  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0640  flagellar assembly protein FliH  26.86 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2933  flagellar assembly protein H  26.53 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2924  flagellar assembly protein H  23.76 
 
 		 338 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3066  flagellar assembly protein H  23.76 
 
 		 338 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.934094 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3772  flagellar assembly protein H  27.49 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.939362 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1439  flagellar assembly protein H  23.76 
 
 		 338 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1602  flagellar assembly protein FliH  27.38 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1957  flagellar assembly protein FliH  25.45 
 
 		 252 aa  54.7  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.253082  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3652  flagellar assembly protein H  24.12 
 
 		 245 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.526766 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1542  flagellar assembly protein FliH  26.04 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1391  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  26.57 
 
 		 262 aa  53.9  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4729  flagellar assembly protein H  24.12 
 
 		 245 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.249746  normal  0.0365414 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0164  flagellar assembly protein H  25.13 
 
 		 227 aa  53.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3085  flagellar assembly protein H  25.15 
 
 		 227 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0955445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3063  flagellar assembly protein H  26.32 
 
 		 225 aa  52.8  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1574  flagellar assembly protein H  27.17 
 
 		 251 aa  52.4  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1160  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  25.9 
 
 		 233 aa  52.4  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966123 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2531  flagellar assembly protein H  24 
 
 		 236 aa  52  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1440  flagellar assembly protein FliH  21.5 
 
 		 276 aa  50.8  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3079  flagellar assembly protein FliH  26.43 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.131312  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3805  flagellar assembly protein FliH  26.43 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0570665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2977  flagellar assembly protein H  27.11 
 
 		 227 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.575281 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3836  flagellar assembly protein FliH  26.58 
 
 		 238 aa  50.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.739706  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0552  flagellar assembly protein FliH  27.38 
 
 		 227 aa  50.1  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3920  flagellar assembly protein FliH  28.99 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0428484 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6415  flagellar assembly protein H  24.56 
 
 		 227 aa  49.3  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491071 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3111  flagellar assembly protein H  27.11 
 
 		 227 aa  49.3  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.33418  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2040  flagellar assembly protein H  23.03 
 
 		 228 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4928  hypothetical protein  45.9 
 
 		 315 aa  48.9  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.443955 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4393  flagellar assembly protein FliH  26.25 
 
 		 245 aa  47  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4170  flagellar assembly protein FliH  27.17 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1708  flagellar assembly protein FliH  23.64 
 
 		 228 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.246476  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2716  flagellar assembly protein H  23.64 
 
 		 228 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.353539 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>