15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_3374 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_3374  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  289  1e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0260  lateral flagellar chaperone protein LfgN  94.37 
 
 		 142 aa  274  4e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0229  hypothetical protein  34.07 
 
 		 141 aa  72.8  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.365481 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0716  hypothetical protein  34.07 
 
 		 141 aa  72.8  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0636  putative flagellar protein FlgN  33.33 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0072  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3654  hypothetical protein  28.89 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3471  hypothetical protein  30.23 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.370785  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0078  hypothetical protein  30.53 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3974  hypothetical protein  29.46 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4411  hypothetical protein  25.6 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0602809 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04906  hypothetical protein  26.09 
 
 		 145 aa  45.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0235  hypothetical protein  25.78 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1951  FlgN  25.47 
 
 		 149 aa  41.6  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3737  FlgN family protein  30.43 
 
 		 155 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.158144  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>