219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_3361 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010468  EcolC_3361  flagellar hook-associated protein 3  100 
 
 
309 aa  611  1e-174  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0273  lateral flagellar hook associated protein 3  98.38 
 
 
309 aa  603  1e-171  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.462118  normal  0.382201 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0216  flagellar hook-associated protein FlgL  40.45 
 
 
305 aa  241  8e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04919  flagellar hook-associated protein FlgL  35.71 
 
 
299 aa  181  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000730  flagellar hook-associated protein FlgL  33.44 
 
 
299 aa  179  6e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0059  flagellar hook-associated protein 3  31.17 
 
 
305 aa  164  2e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0065  flagellar hook-associated protein 3  33.12 
 
 
305 aa  162  9e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3641  flagellin-like protein  31.49 
 
 
305 aa  152  5e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4681  flagellar hook-associated protein 3  29.64 
 
 
304 aa  148  1e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.399467  hitchhiker  7.47775e-06 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0217  flagellar hook-associated protein FlgL  28.85 
 
 
307 aa  147  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3458  flagellar hook-associated protein 3  30.45 
 
 
305 aa  146  5e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0649  flagellar hook-associated protein FlgL  28.53 
 
 
305 aa  143  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3961  flagellar hook-associated protein 3  28.85 
 
 
305 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0247  flagellar hook-associated protein FlgL  28.8 
 
 
304 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1627  flagellar hook-associated protein FlgL  28.06 
 
 
300 aa  116  5e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0194  flagellar hook-associated protein FlgL  28.16 
 
 
304 aa  116  6e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3568  flagellar hook-associated protein 3  27.51 
 
 
296 aa  110  4e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0603  flagellar hook-associated protein 3  26.37 
 
 
292 aa  104  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.891148  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2045  flagellar hook-associated protein FlgL  25.94 
 
 
317 aa  101  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0140515  normal  0.0179401 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2914  flagellar hook-associated protein FlgL  27.1 
 
 
302 aa  99.8  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.481604  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1462  flagellar hook-associated protein FlgL  25.94 
 
 
317 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00628542  hitchhiker  4.76574e-07 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0021  flagellar hook-associated protein 3  26.18 
 
 
301 aa  99.8  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01079  flagellar hook-associated protein L  25.94 
 
 
317 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0213586  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4290  flagellar hook-associated protein FlgL  29.61 
 
 
433 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399131  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17130  flagellar hook-associated protein 3  27.54 
 
 
301 aa  95.9  7e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4380  flagellar hook-associated protein FlgL  30.77 
 
 
521 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1964  flagellar hook-associated protein FlgL  26.69 
 
 
304 aa  94.4  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50340  flagellar hook-associated protein FlgL  30.46 
 
 
439 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000457191 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1206  flagellar hook-associated protein FlgL  25.31 
 
 
317 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066805  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0747  flagellar hook-associated protein FlgL  25.63 
 
 
305 aa  94.4  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2368  flagellin-like  32.61 
 
 
400 aa  94.4  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2563  flagellar hook-associated protein 3  25.31 
 
 
317 aa  94  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000663156  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2517  flagellar hook-associated protein FlgL  25.31 
 
 
317 aa  92.8  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0270874  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1206  flagellar hook-associated protein FlgL  25.31 
 
 
317 aa  92.8  7e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0674951  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1352  flagellar hook-associated protein FlgL  26.14 
 
 
287 aa  92.8  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2840  flagellar hook-associated protein FlgL  31.35 
 
 
562 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.878588  normal  0.22747 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2242  flagellar hook-associated protein FlgL  25 
 
 
317 aa  92  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0269991  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1355  flagellar hook-associated protein FlgL  31.22 
 
 
396 aa  91.3  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2308  flagellar hook-associated protein FlgL  24.83 
 
 
401 aa  90.9  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.24261 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5635  flagellar hook-associated protein FlgL  32.82 
 
 
404 aa  90.5  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1350  flagellar hook-associated protein FlgL  33.85 
 
 
400 aa  90.5  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3227  flagellar hook-associated protein FlgL  26.25 
 
 
297 aa  90.5  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1171  flagellar hook-associated protein FlgL  30.6 
 
 
401 aa  90.1  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0759  flagellar hook-associated protein FlgL  25.07 
 
 
326 aa  89.7  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.847019  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24100  flagellar hook-associated protein FlgL  30.91 
 
 
401 aa  89.7  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02918  flagellar hook-associated protein FlgL  32.61 
 
 
404 aa  89  9e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.432868  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2235  flagellar hook-associated protein 3  29.95 
 
 
328 aa  88.6  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000208019 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3030  flagellar hook-associated protein FlgL  26.72 
 
 
301 aa  89  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1269  flagellar hook-associated protein FlgL  28.04 
 
 
402 aa  88.6  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0936  flagellar hook-associated protein 3  30.46 
 
 
416 aa  88.2  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.415465 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0510  flagellar hook-associated protein 3  27.51 
 
 
420 aa  87.8  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.796621  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2240  flagellar hook-associated protein 3  27.46 
 
 
310 aa  88.2  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1112  flagellar hook-associated protein FlgL  29.05 
 
 
410 aa  87.8  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00867916  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1597  flagellar hook-associated protein FlgL  23.17 
 
 
317 aa  87  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1607  flagellar hook-associated protein FlgL  26.98 
 
 
396 aa  87.4  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.756895  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2004  flagellar hook-associated protein FlgL  24.38 
 
 
317 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0025359  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1281  flagellar hook-associated protein FlgL  24.38 
 
 
317 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.482155  hitchhiker  0.000108184 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1339  flagellar hook-associated protein FlgL  27.51 
 
 
402 aa  87  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2188  flagellar hook-associated protein FlgL  24.38 
 
 
317 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  1.01663e-05 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1252  flagellar hook-associated protein FlgL  24.38 
 
 
317 aa  86.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724059  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1331  flagellar hook-associated protein FlgL  25.48 
 
 
311 aa  87  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522926  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1296  flagellar hook-associated protein FlgL  24.38 
 
 
317 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  4.79805e-05 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1313  flagellar hook-associated protein FlgL  31.58 
 
 
400 aa  86.3  5e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1766  flagellar hook-associated protein 3  25.93 
 
 
313 aa  86.7  5e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1737  flagellar hook-associated protein FlgL  24.84 
 
 
287 aa  85.9  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1516  flagellar hook-associated protein FlgL  24.84 
 
 
287 aa  85.5  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0831  flagellar hook-associated protein 3  27.56 
 
 
298 aa  85.5  1e-15  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.795766  normal  0.995497 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1507  flagellar hook-associated protein FlgL  25.94 
 
 
523 aa  84.7  2e-15  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2960  flagellar hook-associated protein 3  25.54 
 
 
319 aa  84.3  2e-15  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2203  flagellin-like protein  28.19 
 
 
532 aa  84.3  3e-15  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1331  flagellar hook-associated protein FlgL  28.57 
 
 
403 aa  84  3e-15  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143794  normal  0.0994213 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1968  flagellar hook-associated protein FlgL  30.16 
 
 
410 aa  84  3e-15  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1945  flagellar hook-associated protein FlgL  25.42 
 
 
530 aa  83.6  4e-15  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0770249  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1556  flagellar hook-associated protein FlgL  25.5 
 
 
287 aa  83.2  5e-15  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0416222  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3744  flagellar hook-associated protein FlgL  30.69 
 
 
412 aa  82.4  8e-15  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3239  flagellar hook-associated protein FlgL  28.57 
 
 
403 aa  82.4  8e-15  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1674  flagellar hook-associated protein FlgL  32.88 
 
 
315 aa  82.4  9e-15  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1148  flagellar hook-filament junction protein  27.31 
 
 
296 aa  81.6  1e-14  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2587  flagellar hook-associated protein FlgL  28.04 
 
 
403 aa  81.6  1e-14  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0903  flagellar hook-associated protein 3  31.51 
 
 
408 aa  82  1e-14  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0096  flagellar hook-associated protein FlgL  30.15 
 
 
309 aa  80.9  2e-14  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1650  flagellar hook-associated protein 3  23.91 
 
 
297 aa  80.9  2e-14  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1759  flagellar hook-associated protein FlgL  25.89 
 
 
287 aa  81.6  2e-14  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1815  flagellar hook-associated protein FlgL  25.89 
 
 
287 aa  81.3  2e-14  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2415  flagellar hook-associated protein FlgL  23.93 
 
 
326 aa  80.9  3e-14  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.209645  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2313  flagellar hook-associated protein FlgL  23.93 
 
 
326 aa  80.9  3e-14  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3721  flagellar hook-associated protein FlgL  26.89 
 
 
524 aa  80.9  3e-14  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2588  flagellar hook-associated protein FlgL  25.53 
 
 
317 aa  80.1  5e-14  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1527  flagellar hook-associated protein FlgL  24.18 
 
 
287 aa  79.3  7e-14  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00165478  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3573  flagellar hook-associated protein 3  25.93 
 
 
436 aa  79.3  8e-14  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2937  flagellar hook-associated protein FlgL  26.98 
 
 
403 aa  78.6  1e-13  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  25.4 
 
 
408 aa  78.2  1e-13  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  26.46 
 
 
403 aa  79  1e-13  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01298  flagellar hook-associated protein FlgL  27.13 
 
 
396 aa  78.6  1e-13  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1426  flagellar hook-associated protein FlgL  26.46 
 
 
403 aa  79  1e-13  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3042  flagellar hook-associated protein FlgL  24.37 
 
 
298 aa  78.2  2e-13  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.947446  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2952  flagellar hook-associated protein FlgL  26.46 
 
 
403 aa  77.8  2e-13  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1705  flagellar hook-associated protein FlgL  23.86 
 
 
287 aa  75.9  8e-13  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1552  flagellar hook-associated protein  30.17 
 
 
207 aa  75.5  1e-12  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004163  flagellar hook-associated protein FlgL  29.26 
 
 
397 aa  75.1  1e-12  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>