More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_3179 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010468  EcolC_3179  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
403 aa  843  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3553  glycosyl transferase group 1  72.32 
 
 
403 aa  630  1e-179  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0516541  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0591  glycosyl transferase group 1  71.75 
 
 
404 aa  606  1e-172  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0451  putative glycosyl transferase  59.75 
 
 
401 aa  519  1e-146  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4356  glycosyl transferase group 1  38.24 
 
 
409 aa  275  7e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.784045 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2877  glycosyl transferase, group 1  37.38 
 
 
426 aa  270  3e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0391  glycosyl transferase group 1  36.05 
 
 
414 aa  255  1e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4248  glycosyl transferase group 1  34.07 
 
 
405 aa  245  1e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461257  normal  0.0976118 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1804  glycosyl transferase group 1  37.66 
 
 
415 aa  243  5e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0256  glycosyl transferase group 1  33.17 
 
 
415 aa  231  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4972  glycosyl transferase group 1  35.21 
 
 
445 aa  226  4e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1784  glycosyltransferase  30.15 
 
 
401 aa  204  2e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  31.05 
 
 
404 aa  200  4e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2208  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 
403 aa  189  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120517  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5087  glycosyl transferase group 1  31.39 
 
 
390 aa  188  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4622  glycosyl transferase group 1  30.9 
 
 
391 aa  182  6e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0028112 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4364  glycosyl transferase group 1  35.38 
 
 
393 aa  182  8e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2189  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 
394 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1173  glycosyl transferase group 1  29.2 
 
 
391 aa  180  3e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2495  glycosyl transferase group 1  28.19 
 
 
392 aa  175  2e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1704  glycosyl transferase group 1  28.77 
 
 
410 aa  173  4e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1051  putative transferase  29.35 
 
 
384 aa  166  6e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3293  glycosyl transferase group 1  32.58 
 
 
392 aa  159  7e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0719  glycosyl transferase group 1  26.81 
 
 
401 aa  155  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341706  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2588  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
426 aa  150  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6389  glycosyl transferase group 1  28.73 
 
 
387 aa  133  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.447732  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4490  glycosyl transferase, group 1  29.31 
 
 
398 aa  126  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0458  glycosyl transferase group 1  26.3 
 
 
447 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4354  glycosyl transferase group 1  28.37 
 
 
421 aa  122  1e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1390  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
539 aa  122  1e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2977  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5004  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 
435 aa  120  4e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  3.72843e-05 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0797  glycosyl transferase group 1  28.71 
 
 
441 aa  109  7e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.926616  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  35.87 
 
 
353 aa  109  8e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2224  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 
434 aa  106  9e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.307523  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1077  glycosyl transferase group 1  24.63 
 
 
402 aa  104  2e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  1.45174e-05 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0471  glycosyl transferase group 1  28.61 
 
 
422 aa  103  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120961  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 
536 aa  102  8e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2500  glycosyl transferase group 1  28.02 
 
 
434 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0602967  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2501  glycosyl transferase group 1  25.59 
 
 
423 aa  100  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0663849  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2182  glycosyl transferase group 1  32.86 
 
 
443 aa  100  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.347756  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0472  glycosyl transferase group 1  25.3 
 
 
424 aa  100  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.465878  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2225  glycosyl transferase group 1  26.01 
 
 
423 aa  100  7e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0613  glycosyl transferase, group 1 family protein / moaA/nifB/pqqE family protein  24.38 
 
 
778 aa  99.8  9e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12808  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3926  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 
410 aa  99  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760133 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  28.98 
 
 
413 aa  99  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2183  glycosyl transferase group 1  25.06 
 
 
424 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0575473  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
409 aa  96.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3446  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.79 
 
 
412 aa  96.3  9e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  24.26 
 
 
355 aa  95.5  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  31.19 
 
 
355 aa  95.5  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6868  glycosyl transferase group 1  26.81 
 
 
424 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  25.98 
 
 
355 aa  94.7  3e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3851  glycosyl transferase, group 1  26.59 
 
 
353 aa  94.4  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.243477 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3228  glycosyl transferase, group 1  24.59 
 
 
401 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.948731  normal  0.566821 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  31.75 
 
 
398 aa  94  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  34.65 
 
 
346 aa  93.6  5e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1116  glycosyltransferase  29.33 
 
 
413 aa  94  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  32.39 
 
 
356 aa  94  5e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4615  glycosyl transferase, group 1  28.41 
 
 
382 aa  93.6  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.352309  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  27.48 
 
 
350 aa  92.8  9e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2778  glycosyl transferase, group 1  29.67 
 
 
413 aa  92.8  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0082  glycosyl transferase group 1  25.42 
 
 
403 aa  92.4  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1719  glycosyl transferase group 1  28.36 
 
 
421 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0079  glycosyltransferase, putative  25.42 
 
 
403 aa  92.4  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.471525  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4229  glycosyl transferase, group 1  25.28 
 
 
445 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0378432 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4198  glycosyl transferase group 1  25.3 
 
 
405 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6400  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 
389 aa  90.5  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  32.66 
 
 
365 aa  90.1  6e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2830  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 
380 aa  90.1  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0420061 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  31.76 
 
 
408 aa  89.4  9e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1118  group 1 glycosyltransferase  26.71 
 
 
425 aa  89.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48856  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  33.55 
 
 
426 aa  89.4  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1720  glycosyl transferase group 1  24.82 
 
 
422 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.523158  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2780  glycosyl transferase, group 1  25.4 
 
 
425 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.301884  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4708  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 
418 aa  88.2  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.514087 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  32.81 
 
 
364 aa  88.6  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  2.26756e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0986  glycosyltransferase  25.86 
 
 
383 aa  87.8  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.075214 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  23.27 
 
 
406 aa  87.8  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  28.34 
 
 
415 aa  88.2  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5224  glycosyl transferase group 1  25.58 
 
 
384 aa  87.8  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1194  glycosyl transferase group 1  32.93 
 
 
355 aa  87.8  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  29.04 
 
 
373 aa  87.4  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3432  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 
419 aa  87.4  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1062  glycosyl transferase group 1  23 
 
 
400 aa  87.4  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2441  glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 
351 aa  85.9  1e-15  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.719271  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  29.86 
 
 
373 aa  85.9  1e-15  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26870  glycosyltransferase  31.92 
 
 
372 aa  85.9  1e-15  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.730653  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  30.7 
 
 
411 aa  84.7  2e-15  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1203  glycosyl transferase, group 1  28.19 
 
 
386 aa  84.7  3e-15  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.359152  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  32.75 
 
 
378 aa  84  4e-15  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4355  glycosyl transferase group 1  28.89 
 
 
420 aa  84  4e-15  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0177  glycosyl transferase group 1  26.07 
 
 
445 aa  84.3  4e-15  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0643614  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3530  glycosyl transferase group 1  29.52 
 
 
385 aa  84.3  4e-15  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  1.88303e-05  hitchhiker  0.00829445 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2385  glycosyl transferase group 1  25.88 
 
 
385 aa  83.6  6e-15  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6753  glycosyl transferase group 1  23.83 
 
 
414 aa  83.6  6e-15  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.610687  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3803  glycosyl transferase group 1  35.22 
 
 
406 aa  83.2  7e-15  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.551552 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2436  glycosyl transferase group 1  25.88 
 
 
385 aa  83.2  7e-15  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.830296 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0393  putative glycosyl transferase, group 1  24.15 
 
 
388 aa  83.2  8e-15  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.336091  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2590  glycosyl transferase, group 1  24.77 
 
 
410 aa  83.2  8e-15  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3843  glycosyl transferase, group 1  25.97 
 
 
358 aa  82.8  9e-15  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>