More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_2989 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00624  conserved hypothetical protein  99.36 
 
 		 625 aa  1269    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00614  hypothetical protein  99.36 
 
 		 625 aa  1269    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0591  peptidase, S54 (rhomboid) family  94.56 
 
 		 625 aa  1192    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2989  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  100 
 
 		 625 aa  1279    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0685  S54 family peptidase  95.36 
 
 		 625 aa  1202    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.085166  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1514  rhomboid family protein  28.21 
 
 		 639 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0993  rhomboid family protein  34.67 
 
 		 541 aa  107  9e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  31.55 
 
 		 486 aa  106  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  34.41 
 
 		 487 aa  106  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  34.41 
 
 		 487 aa  106  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2381  Rhomboid family protein  41.21 
 
 		 389 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1881  rhomboid-like protein  38.69 
 
 		 365 aa  104  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0191  Rhomboid family protein  35.78 
 
 		 386 aa  104  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0919  membrane-associated serine protease  32.99 
 
 		 236 aa  100  8e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.473127  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4044  Rhomboid family protein  40 
 
 		 513 aa  100  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.887377 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2772  Rhomboid family protein  35 
 
 		 327 aa  96.7  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0134259  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0909  rhomboid family protein  34.07 
 
 		 523 aa  96.7  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.710652  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04802  hypothetical protein  40.96 
 
 		 569 aa  95.9  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.113999 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  28.9 
 
 		 519 aa  95.5  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3784  rhomboid family protein  34.39 
 
 		 283 aa  95.9  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2385  rhomboid-like protein  40.4 
 
 		 358 aa  94  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1842  rhomboid-like protein  35.16 
 
 		 356 aa  93.6  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000517898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  35.08 
 
 		 554 aa  93.2  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0958  rhomboid family protein  34.24 
 
 		 547 aa  93.2  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1048  rhomboid family protein  30.84 
 
 		 511 aa  93.6  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1655  rhomboid family protein  34.21 
 
 		 376 aa  92.8  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.51113  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3385  rhomboid family protein  34.24 
 
 		 541 aa  92.8  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  33.51 
 
 		 396 aa  92  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1683  rhomboid family protein  34.98 
 
 		 248 aa  91.7  4e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000993388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1890  rhomboid-like protein  34.04 
 
 		 348 aa  90.9  7e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.043367 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3513  rhomboid family protein  32.26 
 
 		 286 aa  88.6  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  34.16 
 
 		 342 aa  88.2  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1208  rhomboid family protein  34.04 
 
 		 219 aa  87.4  8e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102271  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0209  rhomboid family protein  36.2 
 
 		 226 aa  86.3  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.292506  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2850  Rhomboid family protein  36.72 
 
 		 271 aa  85.5  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  33.54 
 
 		 342 aa  84.3  0.000000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1000  rhomboid family protein  36.49 
 
 		 528 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2462  rhomboid-like protein  32.65 
 
 		 371 aa  82.8  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0829  rhomboid family protein  38.62 
 
 		 520 aa  82  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.186643  normal  0.166239 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3291  rhomboid family protein  36.49 
 
 		 525 aa  82  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3194  rhomboid family protein  37.93 
 
 		 520 aa  80.9  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00720  uncharacterized membrane protein  34.97 
 
 		 313 aa  79  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1097  rhomboid family protein  36.76 
 
 		 281 aa  77  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0352  rhomboid family protein  31.93 
 
 		 235 aa  76.6  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0334  rhomboid family protein  31.93 
 
 		 235 aa  76.6  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.589878  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2888  Rhomboid family protein  35.15 
 
 		 360 aa  75.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0497694  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  34.08 
 
 		 303 aa  75.9  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2794  rhomboid-like protein  33.33 
 
 		 360 aa  75.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0543  rhomboid family protein  31.17 
 
 		 223 aa  76.3  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31680  predicted protein  32.37 
 
 		 268 aa  75.5  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0246535  normal  0.737397 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0020  Rhomboid family protein  31.38 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0056  Rhomboid family protein  28.42 
 
 		 225 aa  74.7  0.000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0013  rhomboid family protein  35.26 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0125  rhomboid family protein  31.36 
 
 		 381 aa  73.9  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0674  membrane-associated serine protease  33.33 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.263581  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0025  peptidase, S54 (rhomboid) family protein  32.69 
 
 		 234 aa  73.2  0.00000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.777845 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_48028  predicted protein  33.33 
 
 		 522 aa  73.2  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2719  Rhomboid family protein  35.95 
 
 		 198 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.581136  normal  0.114622 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5574  Rhomboid family protein  33.16 
 
 		 228 aa  72.4  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0069  Rhomboid family protein  33.87 
 
 		 292 aa  72.8  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3394  Rhomboid family protein  35.29 
 
 		 198 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.77 
 
 		 689 aa  72  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00150  uncharacterized membrane protein  32.11 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42743  predicted protein  31.07 
 
 		 669 aa  71.6  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.599119  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  29.8 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2750  rhomboid family protein  35.81 
 
 		 369 aa  70.9  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.717687 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0221  rhomboid-like protein  32.61 
 
 		 190 aa  70.5  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0260  rhomboid family protein  32.61 
 
 		 190 aa  70.5  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10929  rhomboid family membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16490)  28.82 
 
 		 503 aa  70.1  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.345748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2980  Rhomboid family protein  32.73 
 
 		 360 aa  69.7  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0252324  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2194  rhomboid family protein  30.51 
 
 		 489 aa  69.3  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456574 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6351  Rhomboid family protein  37.33 
 
 		 332 aa  69.3  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0012  Rhomboid family protein  34.93 
 
 		 282 aa  69.3  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0223  rhomboid-like protein  31.88 
 
 		 190 aa  68.9  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00140  uncharacterized membrane protein  33.12 
 
 		 286 aa  68.6  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39588  Rhomboid-related protein 1 (RRP) (Rhomboid-like protein 1)  31.51 
 
 		 556 aa  68.2  0.0000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0102742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1021  rhomboid family protein  33.07 
 
 		 172 aa  68.6  0.0000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0537483  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  28.57 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3651  Rhomboid family protein  33.67 
 
 		 747 aa  67.8  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.015996 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  25.98 
 
 		 391 aa  67.8  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0305  Rhomboid family protein  45.78 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000904763 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0787  Rhomboid family protein  41.11 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.565548  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0235  rhomboid family protein  31.88 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0249  rhomboid family protein  31.88 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0044  Rhomboid family protein  31.54 
 
 		 356 aa  67.4  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0786  rhomboid family protein  33.07 
 
 		 172 aa  67.4  0.0000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.169699  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5244  Rhomboid family protein  35.29 
 
 		 306 aa  67  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159225  hitchhiker  0.00568338 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0013  rhomboid family protein  30.85 
 
 		 293 aa  67  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000112499  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0980  rhomboid family protein  30.34 
 
 		 224 aa  66.6  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  25.76 
 
 		 479 aa  66.6  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1384  membrane-associated serine protease  33.53 
 
 		 228 aa  67  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000348789  hitchhiker  4.81213e-16 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0711  Rhomboid family protein  34.56 
 
 		 515 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.535917 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0019  Rhomboid family protein  31.32 
 
 		 238 aa  65.9  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0058  rhomboid family protein  37.14 
 
 		 286 aa  66.2  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0732  conserved hypothetical integral membrane protein, Rhomboid family  29.35 
 
 		 176 aa  65.9  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000749647  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  30 
 
 		 290 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0058  Rhomboid family protein  34.19 
 
 		 302 aa  65.5  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  30.22 
 
 		 776 aa  65.5  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0106  rhomboid-like protein  30.52 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  24.62 
 
 		 810 aa  65.1  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>