More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_2864 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_0927  excinuclease ABC subunit B  100 
 
 
673 aa  1364  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000192395  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1396  excinuclease ABC subunit B  66.02 
 
 
697 aa  892  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0161452  normal  0.0208106 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2573  excinuclease ABC subunit B  100 
 
 
673 aa  1364  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.76312e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1958  excinuclease ABC subunit B  65.72 
 
 
697 aa  894  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622246  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0291  excinuclease ABC, B subunit  58.35 
 
 
884 aa  787  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1833  excinuclease ABC subunit B  66.57 
 
 
669 aa  914  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2127  excinuclease ABC subunit B  65.72 
 
 
696 aa  885  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.929321  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0467  excinuclease ABC subunit B  63.47 
 
 
718 aa  850  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.00244529  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1050  excinuclease ABC subunit B  64.73 
 
 
703 aa  886  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1894  excinuclease ABC subunit B  66.57 
 
 
669 aa  914  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4510  excinuclease ABC subunit B  59.38 
 
 
917 aa  796  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2234  excinuclease ABC subunit B  65.57 
 
 
696 aa  883  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2554  excinuclease ABC subunit B  70.81 
 
 
671 aa  983  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00351574  normal  0.0265518 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0805  excinuclease ABC subunit B  58.35 
 
 
923 aa  798  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.733412 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1539  excinuclease ABC subunit B  69.1 
 
 
671 aa  951  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.455329 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0802  excinuclease ABC subunit B  100 
 
 
673 aa  1364  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  5.0554e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2864  excinuclease ABC subunit B  100 
 
 
673 aa  1364  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  1.93006e-06  normal  0.0188114 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0876  excinuclease ABC subunit B  67.01 
 
 
696 aa  914  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.31229 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01374  excinuclease ABC subunit B  68.05 
 
 
673 aa  941  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2037  Excinuclease ABC subunit B  61.03 
 
 
658 aa  804  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  6.74762e-06 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1873  excinuclease ABC subunit B  72.67 
 
 
676 aa  1017  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0311007  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0971  excinuclease ABC, B subunit  67.71 
 
 
675 aa  911  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.91414  normal  0.150476 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0893  excinuclease ABC subunit B  95.84 
 
 
673 aa  1272  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0045975  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0834  excinuclease ABC subunit B  95.84 
 
 
673 aa  1272  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  3.53247e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0150  excinuclease ABC subunit B  59.3 
 
 
662 aa  794  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00713104  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2586  excinuclease ABC subunit B  59.44 
 
 
699 aa  799  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02727  excinuclease ABC subunit B  72.07 
 
 
671 aa  1009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0835  excinuclease ABC subunit B  53.9 
 
 
661 aa  744  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0948  excinuclease ABC subunit B  95.84 
 
 
673 aa  1272  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00408059  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0925  excinuclease ABC subunit B  95.69 
 
 
673 aa  1272  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00407979  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0862  excinuclease ABC subunit B  95.84 
 
 
673 aa  1272  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00114313  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1385  excinuclease ABC subunit B  66.57 
 
 
674 aa  915  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4824  excinuclease ABC subunit B  59.13 
 
 
1011 aa  788  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.748709  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3444  excinuclease ABC subunit B  58.37 
 
 
665 aa  793  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00237393  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0811  excinuclease ABC subunit B  55.29 
 
 
663 aa  759  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  1.31315e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4537  excinuclease ABC subunit B  58.2 
 
 
922 aa  795  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2926  excinuclease ABC subunit B  85.88 
 
 
671 aa  1167  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.826263  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0293  excinuclease ABC subunit B  61.69 
 
 
674 aa  806  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4253  excinuclease ABC subunit B  59.76 
 
 
761 aa  810  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.31724  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0842  excinuclease ABC subunit B  100 
 
 
673 aa  1364  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  5.96238e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0833  excinuclease ABC subunit B  100 
 
 
673 aa  1364  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.01957e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02961  excinuclease ABC subunit B  75.33 
 
 
676 aa  1045  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3530  excinuclease ABC subunit B  56.86 
 
 
670 aa  749  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.220409  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1544  excinuclease ABC subunit B  70.91 
 
 
672 aa  973  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2744  excinuclease ABC subunit B  59.68 
 
 
866 aa  807  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2288  excinuclease ABC subunit B  59.76 
 
 
771 aa  817  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.73396  normal  0.790773 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2839  excinuclease ABC subunit B  85.88 
 
 
671 aa  1167  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2493  excinuclease ABC subunit B  59.44 
 
 
729 aa  798  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.220361  decreased coverage  0.00080111 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3710  excinuclease ABC subunit B  58.86 
 
 
658 aa  786  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.343081  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1653  excinuclease ABC subunit B  59.76 
 
 
941 aa  814  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.370224  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2113  excinuclease ABC subunit B  72.75 
 
 
668 aa  999  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000859502  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1990  excinuclease ABC subunit B  70.91 
 
 
670 aa  966  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.762653  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3217  excinuclease ABC subunit B  70.01 
 
 
675 aa  946  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1617  excinuclease ABC subunit B  59.05 
 
 
978 aa  805  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.201383  normal  0.222121 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0799  excinuclease ABC subunit B  58.22 
 
 
661 aa  790  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2046  excinuclease ABC subunit B  71.28 
 
 
675 aa  990  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1317  excinuclease ABC subunit B  85.48 
 
 
670 aa  1165  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  1.55227e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2351  excinuclease ABC subunit B  71.86 
 
 
667 aa  996  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00949955  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1505  excinuclease ABC subunit B  69.4 
 
 
671 aa  954  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1052  excinuclease ABC subunit B  59.73 
 
 
661 aa  801  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0552725  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4959  excinuclease ABC subunit B  57.51 
 
 
658 aa  768  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4055  excinuclease ABC subunit B  58.05 
 
 
908 aa  793  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.660857  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1430  excinuclease ABC subunit B  85.74 
 
 
671 aa  1163  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0631  excinuclease ABC subunit B  70.91 
 
 
672 aa  971  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1067  excinuclease ABC subunit B  65.87 
 
 
732 aa  886  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.641355  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4001  excinuclease ABC subunit B  64.2 
 
 
712 aa  878  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0259  excinuclease ABC subunit B  57.92 
 
 
662 aa  779  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000897839  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2159  excinuclease ABC subunit B  72.6 
 
 
668 aa  997  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000173586  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17751  excinuclease ABC subunit B  55.47 
 
 
679 aa  756  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4967  excinuclease ABC subunit B  56.17 
 
 
698 aa  748  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3366  excinuclease ABC subunit B  55.47 
 
 
700 aa  753  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00385634 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2192  excinuclease ABC subunit B  58.2 
 
 
725 aa  802  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2376  excinuclease ABC subunit B  56.2 
 
 
666 aa  742  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299298  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2050  excinuclease ABC subunit B  56.35 
 
 
731 aa  747  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.462256 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11649  excinuclease ABC subunit B  56.5 
 
 
698 aa  745  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.548636  normal  0.697699 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3236  excinuclease ABC subunit B  56.19 
 
 
665 aa  759  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3175  excinuclease ABC subunit B  59.16 
 
 
658 aa  794  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1825  excinuclease ABC, B subunit  59.97 
 
 
681 aa  783  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0508947  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3030  excinuclease ABC subunit B  56.23 
 
 
739 aa  764  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00520932  hitchhiker  0.00289702 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0799  excinuclease ABC subunit B  57.01 
 
 
665 aa  782  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.298665  normal  0.975396 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3957  excinuclease ABC subunit B  59.76 
 
 
674 aa  795  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.86158e-06  hitchhiker  1.63265e-08 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0410  excinuclease ABC, B subunit  60.36 
 
 
663 aa  778  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.662388  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2516  excinuclease ABC, B subunit  56.61 
 
 
716 aa  762  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0946  excinuclease ABC, B subunit  55.74 
 
 
746 aa  760  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1247  excinuclease ABC subunit B  56.87 
 
 
702 aa  743  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  4.94823e-06  normal  0.636224 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2080  excinuclease ABC subunit B  57.06 
 
 
670 aa  769  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1407  excinuclease ABC, B subunit  58.35 
 
 
656 aa  780  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05320  Excinuclease ABC subunit B  55.87 
 
 
708 aa  743  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19950  Excinuclease ABC subunit B  57.59 
 
 
698 aa  780  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1442  excinuclease ABC subunit B  57.29 
 
 
665 aa  756  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3723  excinuclease ABC subunit B  56.97 
 
 
667 aa  771  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.22049  normal  0.128382 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25880  excinuclease ABC subunit B  57.04 
 
 
719 aa  759  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2956  excinuclease ABC subunit B  87.07 
 
 
670 aa  1194  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0537123  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0350  excinuclease ABC, B subunit  70.09 
 
 
679 aa  956  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0204678  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0013  excinuclease ABC, B subunit  58.46 
 
 
672 aa  781  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0965  excinuclease ABC, B subunit  56.95 
 
 
699 aa  757  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1485  excinuclease ABC subunit B  55.9 
 
 
702 aa  744  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2427  excinuclease ABC, B subunit  55.75 
 
 
720 aa  751  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0981  excinuclease ABC, B subunit  56.71 
 
 
707 aa  755  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.14704  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1242  excinuclease ABC, B subunit  72.33 
 
 
677 aa  977  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>