More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_2854 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00756  cardiolipin synthase 2  99.76 
 
 
413 aa  852    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2853  conserved hypothetical protein  99.52 
 
 
413 aa  850    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.64331  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0812  cardiolipin synthase 2  99.03 
 
 
413 aa  845    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0377423  normal  0.805381 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0875  cardiolipin synthase 2  86.44 
 
 
413 aa  766    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0847  cardiolipin synthase 2  86.44 
 
 
413 aa  766    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2563  cardiolipin synthase 2  98.31 
 
 
413 aa  841    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1280  cardiolipin synthase 2  81.6 
 
 
413 aa  728    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0960  cardiolipin synthase 2  86.44 
 
 
413 aa  766    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0937  cardiolipin synthase 2  99.52 
 
 
413 aa  850    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0853  cardiolipin synthase 2  99.27 
 
 
413 aa  848    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00773  hypothetical protein  99.76 
 
 
413 aa  852    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0907  cardiolipin synthase 2  86.2 
 
 
413 aa  763    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.352926  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2854  cardiolipin synthase 2  100 
 
 
413 aa  853    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00220611 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0843  cardiolipin synthase 2  99.27 
 
 
413 aa  848    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0939  cardiolipin synthase 2  86.44 
 
 
413 aa  766    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.114483  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2516  cardiolipin synthase 2  63.27 
 
 
401 aa  510  1e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.430536  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2425  cardiolipin synthase 2  61.6 
 
 
401 aa  507  9.999999999999999e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.530502  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0012  cardiolipin synthase 2  53.17 
 
 
422 aa  440  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5037  cardiolipin synthase 2  54.55 
 
 
428 aa  430  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.744789  normal  0.018252 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3264  cardiolipin synthase 2  51.62 
 
 
400 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0013  cardiolipin synthase 2  54.48 
 
 
433 aa  427  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.282981 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0025  cardiolipin synthase 2  53.86 
 
 
436 aa  426  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36690  cardiolipin synthase 2  53.35 
 
 
401 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.70058  normal  0.734179 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2496  cardiolipin synthase 2  51.37 
 
 
400 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3151  cardiolipin synthase 2  54.85 
 
 
401 aa  423  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.90509  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3725  cardiolipin synthase 2  53.4 
 
 
405 aa  424  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2646  cardiolipin synthase 2  50.97 
 
 
400 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.398806  normal  0.323758 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4299  cardiolipin synthase 2  49.55 
 
 
460 aa  421  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.534887  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3008  cardiolipin synthase 2  52.9 
 
 
403 aa  419  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0047  cardiolipin synthase 2  56.2 
 
 
416 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00778324  normal  0.186337 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3617  cardiolipin synthase 2  54.64 
 
 
416 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6327  cardiolipin synthase 2  49.5 
 
 
413 aa  412  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.139699  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2632  cardiolipin synthase 2  50.62 
 
 
400 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671737  normal  0.406016 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2285  cardiolipin synthase 2  50.6 
 
 
400 aa  412  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0421896  hitchhiker  0.000113345 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24820  cardiolipin synthase 2  54.57 
 
 
363 aa  401  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.868846  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3277  cardiolipin synthase 2  49.49 
 
 
416 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.050833  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4609  cardiolipin synthase 2  50.25 
 
 
417 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.244057  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3503  cardiolipin synthetase 2  50 
 
 
416 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.918804  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0446  phospholipase D/transphosphatidylase  40.7 
 
 
396 aa  257  3e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208356  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3768  phospholipase D/transphosphatidylase  37.94 
 
 
397 aa  248  1e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0245671 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2379  phospholipase D/transphosphatidylase  37.98 
 
 
383 aa  248  2e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0383  phospholipase D/transphosphatidylase  38.96 
 
 
461 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.31107  normal  0.117344 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3641  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.56 
 
 
384 aa  224  3e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.823276  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1300  phospholipase D/transphosphatidylase  34.26 
 
 
411 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0444  phospholipase D/transphosphatidylase  35.86 
 
 
442 aa  220  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0470  hypothetical protein  37.13 
 
 
422 aa  219  5e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.276973  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0360  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.02 
 
 
422 aa  218  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0345  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.27 
 
 
422 aa  215  9e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4017  phospholipase D/transphosphatidylase  33.92 
 
 
451 aa  213  3.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000999569 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6050  phospholipase D/transphosphatidylase  38.06 
 
 
424 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2750  phospholipase D/transphosphatidylase  38.06 
 
 
424 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2723  phospholipase D/transphosphatidylase  38.06 
 
 
424 aa  210  5e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.159332  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2111  phospholipase D/transphosphatidylase  38.06 
 
 
424 aa  210  5e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0383  phospholipase D/transphosphatidylase  36.98 
 
 
426 aa  209  7e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.505376  normal  0.526786 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2774  phospholipase D/transphosphatidylase  36.27 
 
 
424 aa  206  8e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0658  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.74 
 
 
419 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4041  putative phospholipase  39.62 
 
 
419 aa  204  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2641  phospholipase D/transphosphatidylase  37.01 
 
 
424 aa  203  4e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.153898 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0576  phospholipase D/transphosphatidylase  36.02 
 
 
424 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.796063  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0562  cardiolipin synthetase II  38.42 
 
 
424 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0878  phospholipase D/transphosphatidylase  35.18 
 
 
409 aa  200  3.9999999999999996e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0211881  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1328  phospholipase D/transphosphatidylase  36.1 
 
 
410 aa  199  5e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.456282  hitchhiker  0.0031824 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0807  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.18 
 
 
409 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.463557  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2750  cardiolipin synthetase ybhO  39.48 
 
 
424 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2328  cardiolipin synthetase II  38.62 
 
 
424 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2408  cardiolipin synthetase ybhO  38.62 
 
 
424 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0195  cardiolipin synthetase II  37.2 
 
 
410 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0854  cardiolipin synthetase II  39.48 
 
 
424 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0693  cardiolipin synthetase ybhO  39.48 
 
 
424 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0678  cardiolipin synthetase ybhO  39.48 
 
 
424 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0911  phospholipase D/transphosphatidylase  34.8 
 
 
439 aa  194  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470803  normal  0.476132 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0868  phospholipase D/transphosphatidylase  34.76 
 
 
414 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0937  phospholipase D/transphosphatidylase  32.98 
 
 
396 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1073  phospholipase D/transphosphatidylase protein  37.02 
 
 
437 aa  189  8e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.273627 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3632  phospholipase D/transphosphatidylase  33.25 
 
 
422 aa  179  8e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0552294  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.68 
 
 
478 aa  176  5e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3078  phospholipase D/transphosphatidylase  33.82 
 
 
396 aa  168  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1296  phospholipase D/transphosphatidylase  32.62 
 
 
385 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0293816  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4909  putative phospholipase  33.15 
 
 
385 aa  166  9e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0402008  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.53 
 
 
474 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1132  phospholipase D/transphosphatidylase  34.93 
 
 
382 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.23 
 
 
374 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37710  Cardiolipin synthase protein  32.63 
 
 
386 aa  164  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1046  cardiolipin synthetase 2  32.34 
 
 
481 aa  164  3e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0310152  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0786  putative cardiolipin synthetase  33.03 
 
 
420 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.438508  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0271  putative synthetase  31.55 
 
 
392 aa  162  9e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0078  phospholipase D/transphosphatidylase  32.49 
 
 
462 aa  162  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2046  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.29 
 
 
420 aa  161  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.500762 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4073  phospholipase D/transphosphatidylase  32.42 
 
 
446 aa  161  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.25105 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0505  cardiolipin synthetase  31.74 
 
 
478 aa  161  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3457  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.4 
 
 
392 aa  160  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.177474  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1413  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.93 
 
 
395 aa  160  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.77486e-20 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0482  cardiolipin synthetase, putative  32.72 
 
 
396 aa  160  5e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0579  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  32.54 
 
 
484 aa  160  5e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0308  cardiolipin synthetase 2  31.25 
 
 
477 aa  159  7e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.267368  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0995  phospholipase  34.25 
 
 
385 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000127869 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.17 
 
 
485 aa  158  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4470  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.5 
 
 
420 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4459  phospholipase  30.41 
 
 
385 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335011  hitchhiker  0.000764366 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1178  phospholipase D/Transphosphatidylase  32 
 
 
425 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.317837  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>