103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_2770 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010468  EcolC_2770  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
171 aa  352  1e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.206287  decreased coverage  0.0000183318 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3043  phage lysozyme  98.82 
 
 
170 aa  346  7e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146006 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0931  phage lysozyme  98.22 
 
 
170 aa  344  3e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2861  phage lysozyme  92.9 
 
 
169 aa  328  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3178  glycoside hydrolase family 24  61.68 
 
 
169 aa  218  3e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4372  glycoside hydrolase, family 24  62.65 
 
 
169 aa  198  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  hitchhiker  0.0000000130314 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3494  glycoside hydrolase family protein  61.82 
 
 
170 aa  198  3e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0871  glycoside hydrolase family protein  58.79 
 
 
170 aa  193  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.718049  normal  0.102143 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3388  lysozyme  44.76 
 
 
143 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.836181  hitchhiker  0.000487886 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1388  lysozyme, phage-related lysozyme  38.46 
 
 
178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000577391  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2180  lysozyme  41.96 
 
 
170 aa  105  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.233317 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00835  conserved hypothetical protein  97.92 
 
 
48 aa  102  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0795  glycoside hydrolase family protein  36.42 
 
 
178 aa  95.5  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.509528  normal  0.0116417 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0875  Lysozyme  39.71 
 
 
143 aa  90.1  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.225375  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0702  phage-related lysozyme  38.3 
 
 
142 aa  89  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.513061  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1032  putative bacteriophage lysozyme  39.13 
 
 
205 aa  88.6  4e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.326117  normal  0.312631 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0240  phage lysozyme  37.93 
 
 
220 aa  88.6  4e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0155947  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1046  lysozyme  33.11 
 
 
195 aa  88.6  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1057  lysozyme  39.31 
 
 
220 aa  87  1e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.738881  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01975  hypothetical protein  39.39 
 
 
159 aa  86.7  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1053  lysozyme  39.29 
 
 
165 aa  86.3  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.152359  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0821  glycoside hydrolase family protein  36.69 
 
 
225 aa  85.5  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000529126  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0965  glycoside hydrolase family protein  36.69 
 
 
225 aa  85.5  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000238073  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0912  lysozyme  39.26 
 
 
164 aa  84  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1158  phage-related lysozyme  39.1 
 
 
166 aa  82.4  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.901858  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1492  glycoside hydrolase family protein  34.31 
 
 
186 aa  82  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0892  phage lysozyme  39.53 
 
 
165 aa  81.3  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0394  phage lysozyme  34.86 
 
 
167 aa  80.5  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.684429  decreased coverage  0.00000000000000176346 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3826  glycoside hydrolase family 24  31.82 
 
 
181 aa  78.2  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2900  phage lysozyme  37.98 
 
 
165 aa  77.8  0.00000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.58341  hitchhiker  0.0000000713415 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3192  putative lysozyme (endolysin) protein  37.86 
 
 
153 aa  77.4  0.00000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.226496 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0629  phage lysozyme  33.72 
 
 
165 aa  77.4  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194528  decreased coverage  0.000000266391 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0883  putative lysozyme (endolysin) protein  38.13 
 
 
153 aa  76.3  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.650566 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2309  glycoside hydrolase family protein  35.62 
 
 
154 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1178  lysozyme  37.78 
 
 
164 aa  76.3  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2321  glycoside hydrolase family protein  40.28 
 
 
341 aa  75.9  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1392  glycoside hydrolase family protein  34.59 
 
 
157 aa  75.5  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9576  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2404  glycoside hydrolase family 24  34.07 
 
 
154 aa  75.9  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1312  phage-related lysozyme  37.59 
 
 
166 aa  75.1  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00507  predicted lysozyme  37.21 
 
 
165 aa  74.3  0.0000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.69492  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0419  phage-related lysozyme  37.59 
 
 
166 aa  74.3  0.0000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1487  phage-related lysozyme  37.59 
 
 
166 aa  74.3  0.0000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00513  hypothetical protein  37.21 
 
 
163 aa  74.3  0.0000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.770196  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3074  Lysozyme  37.21 
 
 
165 aa  73.9  0.0000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0827  phage lysozyme  37.21 
 
 
165 aa  73.9  0.0000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.99177  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1065  phage lysozyme  35.14 
 
 
149 aa  73.9  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000243456 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1402  phage lysozyme  35.14 
 
 
149 aa  73.9  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000103436 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1305  glycoside hydrolase family protein  35.82 
 
 
136 aa  72.4  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.340031 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1920  hypothetical protein  31.98 
 
 
165 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080974  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2819  phage lysozyme  33.78 
 
 
149 aa  71.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559643  normal  0.149188 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1537  hypothetical protein  37.33 
 
 
583 aa  69.7  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2493  glycoside hydrolase family 24  32.21 
 
 
166 aa  68.9  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1735  Lysozyme  34.51 
 
 
150 aa  68.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0740685  normal  0.733452 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0580  Lysozyme  32.37 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2648  Lysozyme  32.75 
 
 
158 aa  68.2  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.010454  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3421  prophage LambdaMc01, lysozyme  32.89 
 
 
148 aa  67.8  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2287  glycoside hydrolase family protein  33.86 
 
 
168 aa  67  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.161394  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2043  Lysozyme  33.8 
 
 
150 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3187  glycoside hydrolase family 24  34.78 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1293  glycoside hydrolase family protein  35.34 
 
 
163 aa  63.9  0.0000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.616877  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1671  glycoside hydrolase family protein  36.3 
 
 
155 aa  63.5  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4784  lysozyme  34.25 
 
 
148 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156327  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1185  glycoside hydrolase family 24  38.89 
 
 
175 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3886  glycoside hydrolase family protein  32.19 
 
 
165 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.047713  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4258  lysozyme  33.56 
 
 
148 aa  62  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805915 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1797  glycoside hydrolase family protein  32.19 
 
 
165 aa  62  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2680  prophage LambdaMc01, lysozyme  32.61 
 
 
152 aa  60.1  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.768997  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1875  glycoside hydrolase family 24  31.16 
 
 
179 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0471339  normal  0.356094 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3256  glycoside hydrolase family protein  32.9 
 
 
159 aa  59.7  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0715149  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5913  glycoside hydrolase family 24  29.45 
 
 
165 aa  59.7  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160678  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0631  phage lysozyme  31.72 
 
 
145 aa  58.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000760504  normal  0.0607386 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1690  glycoside hydrolase family 24  31.97 
 
 
187 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.332829  normal  0.645255 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3158  glycoside hydrolase family protein  32.65 
 
 
417 aa  58.5  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2239  glycoside hydrolase family protein  33.02 
 
 
165 aa  58.5  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00579986  hitchhiker  0.0000000319845 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2642  glycoside hydrolase family protein  29.41 
 
 
196 aa  58.2  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.118674  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0693  lysozyme  35.71 
 
 
153 aa  57.8  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5063  lysozyme  35.71 
 
 
153 aa  57.8  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0875  glycoside hydrolase family protein  31.75 
 
 
178 aa  56.2  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1445  glycoside hydrolase family protein  34.53 
 
 
184 aa  55.8  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5979  glycoside hydrolase family protein  37.5 
 
 
211 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.234335  normal  0.0785126 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1733  glycoside hydrolase family 24  32.82 
 
 
391 aa  55.1  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.614452 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1416  glycoside hydrolase family protein  31.48 
 
 
187 aa  54.7  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.189394 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1695  hypothetical protein  29.45 
 
 
163 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182005  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0749  glycoside hydrolase family protein  29.41 
 
 
174 aa  50.8  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.719939  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1412  glycoside hydrolase family 24  32.29 
 
 
209 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.249747  normal  0.117742 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3556  Phage-related lysozyme (muraminidase)-like protein  42.42 
 
 
401 aa  50.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.647883  normal  0.0343541 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0776  glycoside hydrolase family 24  29.41 
 
 
174 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.180108  normal  0.254443 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0449  glycoside hydrolase family protein  31.62 
 
 
157 aa  49.3  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0116911 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6523  glycoside hydrolase family protein  31.37 
 
 
260 aa  48.9  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532315  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2350  phage related lysozyme protein  24.85 
 
 
192 aa  48.5  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109482  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3077  glycoside hydrolase family 24  30.97 
 
 
177 aa  48.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.154512  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0659  lysozyme, putative  30.19 
 
 
185 aa  47  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1740  glycoside hydrolase family protein  28.97 
 
 
638 aa  47  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.696561 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0780  glycoside hydrolase family protein  28.76 
 
 
177 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00423151 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2082  glycoside hydrolase family protein  30.61 
 
 
188 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0227839  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0944  phage lysozyme  28.29 
 
 
177 aa  45.1  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.330694  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3605  glycoside hydrolase family protein  28.76 
 
 
177 aa  44.3  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0767581  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2129  glycoside hydrolase family protein  29.34 
 
 
188 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.471156  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1644  phage lysozyme  30.2 
 
 
177 aa  42  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000011957  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0625  Phage-related lysozyme (muraminidase)-like  25.85 
 
 
209 aa  41.6  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>